44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1676 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1676  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  327  4e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3712  hypothetical protein  96.15 
 
 		 177 aa  313  6e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013542 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2563  hypothetical protein  47.1 
 
 		 176 aa  140  9e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000213064  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3353  protein of unknown function DUF1568  37.11 
 
 		 181 aa  117  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.231762 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2065  hypothetical protein  35.44 
 
 		 184 aa  115  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4549  hypothetical protein  37.11 
 
 		 181 aa  110  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.86188 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0450  transposase  30.71 
 
 		 141 aa  67  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3368  transposase  28.86 
 
 		 171 aa  66.2  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.863098  normal  0.131145 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2478  hypothetical protein  32.31 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1317  protein of unknown function DUF1568  30.15 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.737296  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2835  hypothetical protein  28.68 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1384  hypothetical protein  27.46 
 
 		 180 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.705846 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0721b  hypothetical protein  27.74 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1689  hypothetical protein  28.89 
 
 		 184 aa  52  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.625848  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0885  protein of unknown function DUF1568  26.39 
 
 		 169 aa  51.2  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4373  hypothetical protein  26.95 
 
 		 178 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295832  normal  0.0449373 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0361  hypothetical protein  28.33 
 
 		 191 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1962  hypothetical protein  33.96 
 
 		 164 aa  49.7  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0243  hypothetical protein  26.72 
 
 		 178 aa  49.7  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.273479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1975  hypothetical protein  25 
 
 		 163 aa  48.5  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2421  hypothetical protein  26.67 
 
 		 161 aa  48.5  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2607  protein of unknown function DUF1568  32.76 
 
 		 186 aa  47.8  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.407993  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2530  hypothetical protein  28.47 
 
 		 179 aa  47.4  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0796  hypothetical protein  27.97 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3477  hypothetical protein  26.77 
 
 		 188 aa  47  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.379705  normal  0.40189 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3135  hypothetical protein  27.41 
 
 		 176 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.01424 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1685  transposase, putative  27.56 
 
 		 184 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.207714 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1888  hypothetical protein  23.74 
 
 		 171 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.17258  hitchhiker  0.00842787 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2890  hypothetical protein  29.73 
 
 		 191 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0768  hypothetical protein  29.58 
 
 		 175 aa  44.7  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0333217  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4538  protein of unknown function DUF1568  24.62 
 
 		 251 aa  44.7  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0855967  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1952  hypothetical protein  29.13 
 
 		 178 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1473  transposase, putative  29.58 
 
 		 179 aa  43.9  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3203  hypothetical protein  29.27 
 
 		 173 aa  43.9  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.936957 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0731  hypothetical protein  28.99 
 
 		 176 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1855  hypothetical protein  25.2 
 
 		 175 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0352  hypothetical protein  26.47 
 
 		 187 aa  41.6  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.642542  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4825  transposase and inactivated derivative  28.8 
 
 		 163 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2531  transposase  26.47 
 
 		 187 aa  40.8  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719011  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4081  hypothetical protein  30.22 
 
 		 177 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0580442  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0337  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  27.2 
 
 		 1345 aa  40.4  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.038664  normal  0.920027 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3405  hypothetical protein  28.67 
 
 		 179 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0242544  normal  0.205029 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2153  hypothetical protein  24.48 
 
 		 221 aa  40.4  0.01  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0207768  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4226  hypothetical protein  25.95 
 
 		 177 aa  40.4  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.853067  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>