88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4549 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4549  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  384  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.86188 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3353  protein of unknown function DUF1568  47.51 
 
 		 181 aa  185  4e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.231762 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2065  hypothetical protein  41.76 
 
 		 184 aa  165  2.9999999999999998e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0450  transposase  50.39 
 
 		 141 aa  137  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3712  hypothetical protein  36 
 
 		 177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013542 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1676  hypothetical protein  37.11 
 
 		 157 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2563  hypothetical protein  32.14 
 
 		 176 aa  80.5  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000213064  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3368  transposase  31.55 
 
 		 171 aa  79.7  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.863098  normal  0.131145 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3037  protein of unknown function DUF1568  28.74 
 
 		 315 aa  71.6  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1620  hypothetical protein  30.16 
 
 		 313 aa  61.2  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3203  hypothetical protein  25.14 
 
 		 173 aa  60.5  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.936957 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0793  hypothetical protein  26.16 
 
 		 314 aa  59.7  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3020  hypothetical protein  27.33 
 
 		 316 aa  58.9  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0950  hypothetical protein  28.57 
 
 		 321 aa  58.5  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000190963  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0033  hypothetical protein  30.95 
 
 		 235 aa  58.2  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0148  transposase  28.57 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0526667  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0136  transposase  28.17 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3016  hypothetical protein  26.74 
 
 		 312 aa  55.8  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1967  hypothetical protein  28.86 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00827335  normal  0.496503 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4538  protein of unknown function DUF1568  25.15 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0855967  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2771  hypothetical protein  29.37 
 
 		 318 aa  54.3  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0770  protein of unknown function DUF1568  24 
 
 		 316 aa  53.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3926  hypothetical protein  26.97 
 
 		 322 aa  53.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5047  hypothetical protein  24.84 
 
 		 151 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0419469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4421  hypothetical protein  25.33 
 
 		 152 aa  52  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.268203 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0885  protein of unknown function DUF1568  26.67 
 
 		 169 aa  52.4  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0917  protein of unknown function DUF1568  30.25 
 
 		 221 aa  51.2  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1055  transposase  26.11 
 
 		 250 aa  51.2  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2835  hypothetical protein  27.39 
 
 		 191 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1554  protein of unknown function DUF1568  27.01 
 
 		 230 aa  50.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.335003 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1556  protein of unknown function DUF1568  27.01 
 
 		 230 aa  50.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.444415 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1552  protein of unknown function DUF1568  26.28 
 
 		 230 aa  50.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.268269 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2198  transposase  33.33 
 
 		 253 aa  49.7  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3632  hypothetical protein  27.2 
 
 		 316 aa  49.7  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.108416  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1558  protein of unknown function DUF1568  27.01 
 
 		 230 aa  50.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.55731 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3477  hypothetical protein  22.47 
 
 		 188 aa  48.5  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.379705  normal  0.40189 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3135  hypothetical protein  25.75 
 
 		 176 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.01424 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0477  hypothetical protein  29.1 
 
 		 232 aa  48.5  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2192  hypothetical protein  33.33 
 
 		 253 aa  48.5  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107555  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1384  hypothetical protein  24.14 
 
 		 180 aa  48.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.705846 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1689  hypothetical protein  25.54 
 
 		 184 aa  48.1  0.00006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.625848  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2086  hypothetical protein  30.33 
 
 		 321 aa  48.1  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.464464  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4599  hypothetical protein  28.12 
 
 		 160 aa  47.8  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0243  hypothetical protein  25 
 
 		 178 aa  47.8  0.00009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.273479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3612  hypothetical protein  26.49 
 
 		 201 aa  47.8  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0368765  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2607  protein of unknown function DUF1568  25.85 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.407993  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1356  hypothetical protein  24.72 
 
 		 319 aa  47.8  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.895893  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0796  hypothetical protein  23.45 
 
 		 159 aa  47.4  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4462  hypothetical protein  21.15 
 
 		 152 aa  47.4  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0721b  hypothetical protein  25.68 
 
 		 133 aa  46.6  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0790  hypothetical protein  27.2 
 
 		 232 aa  46.6  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.513436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1872  hypothetical protein  28.68 
 
 		 277 aa  46.6  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2897  protein of unknown function DUF1568  26.28 
 
 		 250 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1748  hypothetical protein  24.56 
 
 		 312 aa  46.6  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.994794  normal  0.0128416 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2793  transposase-like p;rotein  27.5 
 
 		 165 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3244  protein of unknown function DUF1568  26.28 
 
 		 241 aa  45.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0397  protein of unknown function DUF1568  30.83 
 
 		 304 aa  45.4  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000164254  normal  0.853679 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4597  hypothetical protein  22.01 
 
 		 151 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0971888 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3127  hypothetical protein  27.21 
 
 		 261 aa  43.9  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0164  transposase  22.86 
 
 		 287 aa  44.3  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0743928  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2966  hypothetical protein  26.28 
 
 		 241 aa  44.3  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1975  hypothetical protein  22.22 
 
 		 163 aa  43.9  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3295  hypothetical protein  26.27 
 
 		 230 aa  44.3  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2932  hypothetical protein  29.03 
 
 		 234 aa  44.3  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3248  protein of unknown function DUF1568  26.77 
 
 		 181 aa  43.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00178625  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2830  hypothetical protein  37.74 
 
 		 77 aa  43.1  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.322225  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2478  hypothetical protein  24.63 
 
 		 161 aa  43.1  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3405  hypothetical protein  25.36 
 
 		 179 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0242544  normal  0.205029 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1701  hypothetical protein  28.93 
 
 		 174 aa  43.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2530  hypothetical protein  23.7 
 
 		 179 aa  42.7  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5382  hypothetical protein  26.62 
 
 		 223 aa  42.4  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal  0.588654 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2153  hypothetical protein  29.71 
 
 		 221 aa  42.7  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0207768  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2421  hypothetical protein  26.17 
 
 		 161 aa  42.4  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5411  protein of unknown function DUF1568  30.08 
 
 		 218 aa  42.4  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000187281  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1151  protein of unknown function DUF1568  27.2 
 
 		 231 aa  42.4  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1552  hypothetical protein  22.22 
 
 		 205 aa  42  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0339239 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2264  transposase and inactivated derivatives  28.33 
 
 		 323 aa  42  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.88974  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1406  protein of unknown function DUF1568  22.09 
 
 		 289 aa  42  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1007  hypothetical protein  24.82 
 
 		 234 aa  41.6  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0595  hypothetical protein  25.88 
 
 		 258 aa  41.6  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.217159  hitchhiker  2.03187e-17 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2878  protein of unknown function DUF1568  22.67 
 
 		 289 aa  41.6  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000473385 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12790  transposase  27.94 
 
 		 241 aa  41.2  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3286  protein of unknown function DUF1568  25.86 
 
 		 214 aa  41.2  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00118326  unclonable  0.0000000135739 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3105  protein of unknown function DUF1568  25.98 
 
 		 192 aa  41.2  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000625853  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3078  protein of unknown function DUF1568  25.98 
 
 		 190 aa  41.2  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0607  hypothetical protein  22.44 
 
 		 151 aa  40.8  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0682  hypothetical protein  26.4 
 
 		 232 aa  40.8  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349284  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1036  hypothetical protein  28.91 
 
 		 222 aa  40.8  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>