177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_5047 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_5047  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  309  1e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0419469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4597  hypothetical protein  54.3 
 
 		 151 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0971888 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0613  hypothetical protein  53.64 
 
 		 151 aa  170  5e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.018198 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0568  hypothetical protein  57.62 
 
 		 151 aa  167  5e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0607  hypothetical protein  57.62 
 
 		 151 aa  166  8e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5236  hypothetical protein  54.3 
 
 		 151 aa  161  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4421  hypothetical protein  53.69 
 
 		 152 aa  158  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.268203 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4707  hypothetical protein  49.67 
 
 		 152 aa  157  5e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3919  hypothetical protein  50.33 
 
 		 151 aa  155  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0968412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5083  hypothetical protein  54.11 
 
 		 151 aa  156  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268045  normal  0.309651 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1364  hypothetical protein  50.34 
 
 		 150 aa  152  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0968684  normal  0.0104776 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0262  hypothetical protein  50 
 
 		 152 aa  152  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1574  hypothetical protein  51.01 
 
 		 150 aa  147  4e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.620864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2777  hypothetical protein  52.35 
 
 		 149 aa  147  6e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.430133  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1133  hypothetical protein  50.34 
 
 		 153 aa  143  8.000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000547954  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5176  hypothetical protein  51.94 
 
 		 184 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00299086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0788  hypothetical protein  42.18 
 
 		 150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1685  hypothetical protein  39.04 
 
 		 149 aa  122  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.365398  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1489  hypothetical protein  39.31 
 
 		 153 aa  117  6e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0943  protein of unknown function DUF1568  44.2 
 
 		 163 aa  114  3.9999999999999997e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3976  protein of unknown function DUF1568  41.43 
 
 		 151 aa  104  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.183049  normal  0.223747 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3465  hypothetical protein  39.31 
 
 		 150 aa  95.9  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16060  hypothetical protein  50 
 
 		 86 aa  92.8  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2468  hypothetical protein  33.33 
 
 		 181 aa  64.3  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.321631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1084  transposase and inactivated derivatives  31.13 
 
 		 338 aa  62.8  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02923  hypothetical protein  36 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0844  hypothetical protein  35.79 
 
 		 340 aa  61.6  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0793  hypothetical protein  36.36 
 
 		 335 aa  61.2  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000261863  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3286  protein of unknown function DUF1568  31.62 
 
 		 214 aa  60.5  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00118326  unclonable  0.0000000135739 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1967  hypothetical protein  36.47 
 
 		 282 aa  58.9  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.969925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2643  transposase domain-containing protein  31.43 
 
 		 335 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4462  hypothetical protein  24.19 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2198  transposase  26.12 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2192  hypothetical protein  26.12 
 
 		 253 aa  58.2  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107555  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1966  hypothetical protein  36.47 
 
 		 305 aa  57.8  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.527692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3926  hypothetical protein  30.16 
 
 		 322 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2474  protein of unknown function DUF1568  32.74 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000403207  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1423  protein of unknown function DUF1568  29.47 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7985800000000005e-18 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1748  hypothetical protein  32.8 
 
 		 312 aa  53.9  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.994794  normal  0.0128416 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2793  transposase-like p;rotein  31.07 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2207  protein of unknown function DUF1568  36.67 
 
 		 323 aa  53.9  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.45311e-16 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1552  hypothetical protein  30.83 
 
 		 205 aa  53.9  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0339239 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02732  hypothetical protein  40.62 
 
 		 91 aa  53.9  0.0000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.979452  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3135  hypothetical protein  27.46 
 
 		 176 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.01424 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0722  protein of unknown function DUF1568  34.83 
 
 		 321 aa  52.4  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.645218  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4549  hypothetical protein  24.84 
 
 		 181 aa  52.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.86188 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2264  transposase and inactivated derivatives  30.23 
 
 		 323 aa  52.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.88974  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2265  transposase and inactivated derivatives  30.23 
 
 		 241 aa  52.4  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2531  transposase  27.86 
 
 		 187 aa  52.4  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719011  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0352  hypothetical protein  27.86 
 
 		 187 aa  52.8  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.642542  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1386  protein of unknown function DUF1568  29.52 
 
 		 325 aa  52.4  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1554  protein of unknown function DUF1568  31.09 
 
 		 230 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.335003 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0996  protein of unknown function DUF1568  35.29 
 
 		 216 aa  52  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.976226  normal  0.164778 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1556  protein of unknown function DUF1568  31.09 
 
 		 230 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.444415 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0337  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  32.99 
 
 		 1345 aa  52  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.038664  normal  0.920027 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0311  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  32.65 
 
 		 1372 aa  52  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.220801 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1784  hypothetical protein  32.63 
 
 		 197 aa  51.6  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3702  hypothetical protein  30.28 
 
 		 208 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000809832 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1256  protein of unknown function DUF1568  30.53 
 
 		 321 aa  50.8  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0072967  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2835  hypothetical protein  25.76 
 
 		 191 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0793  hypothetical protein  27.42 
 
 		 314 aa  50.4  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4825  transposase and inactivated derivative  30.77 
 
 		 163 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1558  protein of unknown function DUF1568  32.69 
 
 		 230 aa  50.4  0.000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.55731 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0731  hypothetical protein  30.51 
 
 		 176 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3871  protein of unknown function DUF1568  34.07 
 
 		 236 aa  50.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1423  protein of unknown function DUF1568  29.25 
 
 		 325 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1791  transposase and inactivated derivatives  31.25 
 
 		 323 aa  50.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0925  protein of unknown function DUF1568  35.9 
 
 		 336 aa  49.7  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1782  protein of unknown function DUF1568  25.69 
 
 		 325 aa  50.1  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0188832 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5035  protein of unknown function DUF1568  28.71 
 
 		 214 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.916294 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2218  hypothetical protein  26.67 
 
 		 327 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00293328  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2336  protein of unknown function DUF1568  34.09 
 
 		 324 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1929  protein of unknown function DUF1568  34.09 
 
 		 321 aa  50.1  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0324  protein of unknown function DUF1568  29.07 
 
 		 252 aa  49.7  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.551772  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1966  hypothetical protein  38.16 
 
 		 231 aa  49.3  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.74185  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5411  protein of unknown function DUF1568  26.02 
 
 		 218 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000187281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05745  hypothetical protein  55.26 
 
 		 68 aa  49.3  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.948839  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3379  conserved hypothetical protein  31.03 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1484  hypothetical protein  29.52 
 
 		 295 aa  48.9  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1487  hypothetical protein  29.52 
 
 		 323 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3016  hypothetical protein  32.14 
 
 		 312 aa  48.9  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2771  hypothetical protein  29.89 
 
 		 318 aa  48.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3020  hypothetical protein  28.23 
 
 		 316 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2932  hypothetical protein  34.88 
 
 		 234 aa  47.8  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1392  hypothetical protein  34.09 
 
 		 320 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2131  hypothetical protein  31.03 
 
 		 333 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.132605  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0954  hypothetical protein  32.14 
 
 		 326 aa  47.8  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.729066  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2394  hypothetical protein  32.29 
 
 		 239 aa  47.4  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3130  transposase and inactivated derivatives  32.63 
 
 		 178 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0127624  normal  0.415202 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0796  hypothetical protein  25.47 
 
 		 159 aa  47.4  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00223  hypothetical protein  29.89 
 
 		 165 aa  47  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00227  hypothetical protein  29.89 
 
 		 165 aa  47  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3037  protein of unknown function DUF1568  27.84 
 
 		 315 aa  47  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3392  hypothetical protein  29.89 
 
 		 165 aa  47  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2620  hypothetical protein  26.05 
 
 		 254 aa  47  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000852823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1552  protein of unknown function DUF1568  31.73 
 
 		 230 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.268269 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1506  protein of unknown function DUF1568  34.09 
 
 		 321 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0136  transposase  22.22 
 
 		 236 aa  46.6  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0148  transposase  25.51 
 
 		 236 aa  46.6  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0526667  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0164  transposase  26.19 
 
 		 287 aa  46.2  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0743928  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>