66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3353 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3353  protein of unknown function DUF1568  100 
 
 		 181 aa  379  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.231762 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4549  hypothetical protein  47.51 
 
 		 181 aa  185  4e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.86188 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2065  hypothetical protein  38.46 
 
 		 184 aa  142  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3712  hypothetical protein  36.21 
 
 		 177 aa  125  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013542 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0450  transposase  43.48 
 
 		 141 aa  123  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1676  hypothetical protein  37.11 
 
 		 157 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3368  transposase  30.13 
 
 		 171 aa  84  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.863098  normal  0.131145 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2563  hypothetical protein  31.95 
 
 		 176 aa  81.3  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000213064  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3203  hypothetical protein  27.54 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.936957 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0793  hypothetical protein  28.12 
 
 		 314 aa  59.3  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3477  hypothetical protein  22.67 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.379705  normal  0.40189 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3926  hypothetical protein  31.85 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1007  hypothetical protein  29.08 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3020  hypothetical protein  28.38 
 
 		 316 aa  56.6  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0885  protein of unknown function DUF1568  28.41 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3037  protein of unknown function DUF1568  28.8 
 
 		 315 aa  54.7  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4462  hypothetical protein  24.2 
 
 		 152 aa  53.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3016  hypothetical protein  27.71 
 
 		 312 aa  53.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2264  transposase and inactivated derivatives  31.91 
 
 		 323 aa  52.8  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.88974  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1802  protein of unknown function DUF1568  27.94 
 
 		 240 aa  52  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2265  transposase and inactivated derivatives  31.91 
 
 		 241 aa  51.6  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4538  protein of unknown function DUF1568  26.85 
 
 		 251 aa  49.7  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0855967  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0033  hypothetical protein  27.21 
 
 		 235 aa  49.7  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1620  hypothetical protein  28.37 
 
 		 313 aa  48.5  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4373  hypothetical protein  25 
 
 		 178 aa  47.8  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295832  normal  0.0449373 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2887  hypothetical protein  29.2 
 
 		 242 aa  47.8  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0231  protein of unknown function DUF1568  23.67 
 
 		 298 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0148  transposase  24.82 
 
 		 236 aa  47  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0526667  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0242  protein of unknown function DUF1568  23.67 
 
 		 298 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0717597  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0682  hypothetical protein  27.33 
 
 		 232 aa  47  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349284  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1151  protein of unknown function DUF1568  24.66 
 
 		 231 aa  46.6  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3135  hypothetical protein  24.26 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.01424 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0243  hypothetical protein  26.01 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.273479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1356  hypothetical protein  29.8 
 
 		 319 aa  47  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.895893  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0136  transposase  26.28 
 
 		 236 aa  45.8  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0164  transposase  25 
 
 		 287 aa  45.8  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0743928  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0220  hypothetical protein  23.81 
 
 		 298 aa  45.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2607  protein of unknown function DUF1568  27.22 
 
 		 186 aa  45.1  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.407993  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1872  hypothetical protein  25.21 
 
 		 277 aa  45.1  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0790  hypothetical protein  23.48 
 
 		 232 aa  44.7  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.513436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1552  protein of unknown function DUF1568  26.92 
 
 		 230 aa  43.9  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.268269 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0950  hypothetical protein  28 
 
 		 321 aa  43.9  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000190963  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1748  hypothetical protein  25.43 
 
 		 312 aa  43.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.994794  normal  0.0128416 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2932  hypothetical protein  26 
 
 		 234 aa  43.5  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0477  hypothetical protein  26.02 
 
 		 232 aa  43.5  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0996  protein of unknown function DUF1568  27.61 
 
 		 216 aa  43.5  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.976226  normal  0.164778 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1782  protein of unknown function DUF1568  22.44 
 
 		 325 aa  43.5  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0188832 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1541  hypothetical protein  29.32 
 
 		 267 aa  43.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.463797  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1427  hypothetical protein  20.62 
 
 		 321 aa  43.5  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1425  hypothetical protein  20.62 
 
 		 321 aa  43.5  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1975  hypothetical protein  20.73 
 
 		 163 aa  43.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03381  hypothetical protein  23.98 
 
 		 199 aa  42.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.593355 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1386  protein of unknown function DUF1568  24.07 
 
 		 325 aa  42.7  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3632  hypothetical protein  28 
 
 		 316 aa  42.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.108416  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1967  hypothetical protein  27.5 
 
 		 226 aa  42.4  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00827335  normal  0.496503 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2321  hypothetical protein  23.61 
 
 		 297 aa  42.4  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0102584 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0331  protein of unknown function DUF1568  25.52 
 
 		 297 aa  42.4  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.214506  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0320  protein of unknown function DUF1568  25.19 
 
 		 297 aa  42.4  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.726603  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2050  protein of unknown function DUF1568  23.97 
 
 		 336 aa  41.6  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.633564  normal  0.705399 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3257  hypothetical protein  23.88 
 
 		 314 aa  41.2  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3872  hypothetical protein  24.64 
 
 		 317 aa  41.2  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3122  transposase  25.41 
 
 		 231 aa  41.6  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299801  normal  0.623865 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13701  hypothetical protein  24.07 
 
 		 164 aa  41.6  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1055  transposase  21.6 
 
 		 250 aa  40.8  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2131  hypothetical protein  23.21 
 
 		 333 aa  41.2  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.132605  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1384  hypothetical protein  24.83 
 
 		 180 aa  40.8  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.705846 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>