20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3203 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3203  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  360  5.0000000000000005e-99  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.936957 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3368  transposase  42.59 
 
 		 171 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.863098  normal  0.131145 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2065  hypothetical protein  30.54 
 
 		 184 aa  71.2  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3353  protein of unknown function DUF1568  27.54 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.231762 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4549  hypothetical protein  25.14 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.86188 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0885  protein of unknown function DUF1568  26.92 
 
 		 169 aa  53.5  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0450  transposase  26.28 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3712  hypothetical protein  25.32 
 
 		 177 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013542 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1552  hypothetical protein  20.69 
 
 		 205 aa  45.1  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0339239 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2530  hypothetical protein  22.56 
 
 		 179 aa  43.9  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1676  hypothetical protein  28.1 
 
 		 157 aa  43.9  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3020  hypothetical protein  24.68 
 
 		 316 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1975  hypothetical protein  26.32 
 
 		 163 aa  43.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2531  transposase  23.17 
 
 		 187 aa  43.1  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719011  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4373  hypothetical protein  25.48 
 
 		 178 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295832  normal  0.0449373 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5382  hypothetical protein  25.19 
 
 		 223 aa  42  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal  0.588654 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0243  hypothetical protein  24.18 
 
 		 178 aa  41.6  0.006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.273479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1317  protein of unknown function DUF1568  24.66 
 
 		 179 aa  41.2  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.737296  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3477  hypothetical protein  26.92 
 
 		 188 aa  40.8  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.379705  normal  0.40189 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1484  hypothetical protein  23.91 
 
 		 231 aa  40.8  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>