188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1552 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1552  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  421  1e-117  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0339239 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4462  hypothetical protein  36 
 
 
152 aa  92.4  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4421  hypothetical protein  33.33 
 
 
152 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.268203 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1975  hypothetical protein  31.78 
 
 
163 aa  70.1  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1962  hypothetical protein  30.07 
 
 
164 aa  64.7  0.0000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0311  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  31.78 
 
 
1372 aa  64.7  0.0000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.220801 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0943  protein of unknown function DUF1568  28.24 
 
 
163 aa  64.7  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1966  hypothetical protein  30.97 
 
 
231 aa  63.9  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.74185  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1888  hypothetical protein  27.69 
 
 
171 aa  63.5  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.17258  hitchhiker  0.00842787 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1717  hypothetical protein  29.3 
 
 
295 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205722  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2161  hypothetical protein  30.57 
 
 
295 aa  63.2  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1384  hypothetical protein  27.86 
 
 
180 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.705846 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4599  hypothetical protein  29.5 
 
 
160 aa  62.4  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1574  hypothetical protein  33.33 
 
 
150 aa  62.4  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.620864  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0337  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  31.48 
 
 
1345 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.038664  normal  0.920027 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1364  hypothetical protein  28.12 
 
 
150 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0968684  normal  0.0104776 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3976  protein of unknown function DUF1568  28.46 
 
 
151 aa  61.2  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.183049  normal  0.223747 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0324  protein of unknown function DUF1568  27.42 
 
 
252 aa  60.1  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.551772  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1473  transposase, putative  30.28 
 
 
179 aa  59.7  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1802  protein of unknown function DUF1568  30.1 
 
 
240 aa  59.7  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0996  protein of unknown function DUF1568  30 
 
 
216 aa  58.9  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.976226  normal  0.164778 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1788  hypothetical protein  30.3 
 
 
295 aa  58.9  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.239361  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0917  protein of unknown function DUF1568  27.42 
 
 
221 aa  58.5  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3465  hypothetical protein  29.77 
 
 
150 aa  58.5  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1685  transposase, putative  28.47 
 
 
184 aa  58.5  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.207714 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0243  hypothetical protein  26.71 
 
 
178 aa  57.8  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.273479  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3049  transposase and inactivated derivatives  26.21 
 
 
226 aa  57  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3130  transposase and inactivated derivatives  30.41 
 
 
178 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0127624  normal  0.415202 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4825  transposase and inactivated derivative  27.07 
 
 
163 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0796  hypothetical protein  27.48 
 
 
159 aa  56.6  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0262  hypothetical protein  27.87 
 
 
152 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0231  protein of unknown function DUF1568  27.56 
 
 
298 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4133  hypothetical protein  28.35 
 
 
298 aa  56.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3990  hypothetical protein  28.35 
 
 
320 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4081  hypothetical protein  25.9 
 
 
177 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0580442  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1685  hypothetical protein  27.13 
 
 
149 aa  55.8  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.365398  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2966  hypothetical protein  27.93 
 
 
241 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0361  hypothetical protein  26.51 
 
 
191 aa  55.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0093  hypothetical protein  26.98 
 
 
234 aa  55.8  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150021  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1855  hypothetical protein  28.66 
 
 
175 aa  55.5  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00223  hypothetical protein  26.17 
 
 
165 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00227  hypothetical protein  26.17 
 
 
165 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0242  protein of unknown function DUF1568  26.92 
 
 
298 aa  55.1  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0717597  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3392  hypothetical protein  25.55 
 
 
165 aa  54.7  0.0000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0613  hypothetical protein  28.91 
 
 
151 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.018198 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3379  conserved hypothetical protein  26.17 
 
 
165 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1489  hypothetical protein  27.12 
 
 
153 aa  54.3  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2421  hypothetical protein  30.61 
 
 
161 aa  54.7  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2478  hypothetical protein  27.52 
 
 
161 aa  54.3  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1952  hypothetical protein  31.62 
 
 
178 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3405  hypothetical protein  31.03 
 
 
179 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0242544  normal  0.205029 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0731  hypothetical protein  25.98 
 
 
176 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5236  hypothetical protein  27.34 
 
 
151 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3286  protein of unknown function DUF1568  26.28 
 
 
214 aa  54.7  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00118326  unclonable  0.0000000135739 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0240  hypothetical protein  27.33 
 
 
165 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0708  protein of unknown function DUF1568  25.71 
 
 
233 aa  53.5  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.615013  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1133  hypothetical protein  30.58 
 
 
153 aa  53.9  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000547954  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2835  hypothetical protein  27.14 
 
 
191 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2897  protein of unknown function DUF1568  27.43 
 
 
250 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5047  hypothetical protein  30.83 
 
 
151 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0419469  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3670  transposase and inactivated derivatives  30.09 
 
 
228 aa  53.1  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3135  hypothetical protein  25.71 
 
 
176 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.01424 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0721b  hypothetical protein  27.97 
 
 
133 aa  53.5  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3919  hypothetical protein  27.34 
 
 
151 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0968412  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3295  hypothetical protein  27 
 
 
230 aa  52.8  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0768  hypothetical protein  27.66 
 
 
175 aa  52.8  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0333217  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0220  hypothetical protein  26.28 
 
 
298 aa  52.8  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0740  hypothetical protein  25.71 
 
 
255 aa  53.1  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345588  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3592  protein of unknown function DUF1568  24.55 
 
 
235 aa  52.4  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00165115  hitchhiker  0.000000708999 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33360  hypothetical protein  29.17 
 
 
176 aa  52.8  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0364  transposase-like protein  24.55 
 
 
235 aa  52.4  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.72516  normal  0.431982 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2530  hypothetical protein  23.57 
 
 
179 aa  52.8  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2474  protein of unknown function DUF1568  21.94 
 
 
224 aa  52  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000403207  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4446  hypothetical protein  25.69 
 
 
236 aa  51.6  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.885807  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3244  protein of unknown function DUF1568  26.55 
 
 
241 aa  51.6  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0352  hypothetical protein  25.85 
 
 
187 aa  51.6  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.642542  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2531  transposase  26.9 
 
 
187 aa  52  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719011  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4226  hypothetical protein  28.17 
 
 
177 aa  52  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.853067  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5083  hypothetical protein  26.56 
 
 
151 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268045  normal  0.309651 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5176  hypothetical protein  26.12 
 
 
184 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00299086  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0489  hypothetical protein  28.71 
 
 
310 aa  51.2  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.448467 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2890  hypothetical protein  27.14 
 
 
191 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1512  hypothetical protein  29.17 
 
 
222 aa  50.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.656335 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2789  hypothetical protein  22.73 
 
 
235 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603101  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3477  hypothetical protein  31.4 
 
 
188 aa  50.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.379705  normal  0.40189 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1689  hypothetical protein  27.72 
 
 
184 aa  50.8  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.625848  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0595  hypothetical protein  24.22 
 
 
258 aa  50.1  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.217159  hitchhiker  2.03187e-17 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3498  hypothetical protein  23.64 
 
 
237 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.827202  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1724  hypothetical protein  23.81 
 
 
248 aa  50.1  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1725  hypothetical protein  23.81 
 
 
248 aa  50.1  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3015  hypothetical protein  22.73 
 
 
237 aa  50.1  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4373  hypothetical protein  28.89 
 
 
178 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295832  normal  0.0449373 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0380  hypothetical protein  23.64 
 
 
237 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2706  hypothetical protein  23.64 
 
 
237 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0803898  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0401  hypothetical protein  23.64 
 
 
237 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2777  hypothetical protein  32.05 
 
 
149 aa  49.7  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.430133  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2737  hypothetical protein  22.73 
 
 
237 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3719  transposase  22.73 
 
 
237 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.719861  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0788  hypothetical protein  24.03 
 
 
150 aa  49.7  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3257  hypothetical protein  25.9 
 
 
314 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>