101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2421 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2421  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  333  5e-91  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1689  hypothetical protein  66.46 
 
 
184 aa  222  2e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.625848  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2478  hypothetical protein  63.64 
 
 
161 aa  207  4e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33360  hypothetical protein  56.77 
 
 
176 aa  201  5e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1855  hypothetical protein  55.06 
 
 
175 aa  193  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1952  hypothetical protein  54.19 
 
 
178 aa  191  5e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1962  hypothetical protein  57.59 
 
 
164 aa  190  9e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1473  transposase, putative  52.5 
 
 
179 aa  184  5e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4081  hypothetical protein  51.27 
 
 
177 aa  184  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0580442  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1685  transposase, putative  55.77 
 
 
184 aa  184  6e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.207714 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0721b  hypothetical protein  67.19 
 
 
133 aa  183  8e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0768  hypothetical protein  55.77 
 
 
175 aa  183  9e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0333217  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4373  hypothetical protein  55.13 
 
 
178 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295832  normal  0.0449373 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3405  hypothetical protein  51.9 
 
 
179 aa  174  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0242544  normal  0.205029 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4226  hypothetical protein  49.68 
 
 
177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.853067  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0243  hypothetical protein  48.39 
 
 
178 aa  167  4e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.273479  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1384  hypothetical protein  50.62 
 
 
180 aa  167  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.705846 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3130  transposase and inactivated derivatives  51.92 
 
 
178 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0127624  normal  0.415202 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0731  hypothetical protein  46.84 
 
 
176 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4825  transposase and inactivated derivative  49.68 
 
 
163 aa  159  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1317  protein of unknown function DUF1568  52.23 
 
 
179 aa  159  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.737296  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2530  hypothetical protein  49.07 
 
 
179 aa  157  6e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3135  hypothetical protein  47.44 
 
 
176 aa  157  7e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.01424 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3392  hypothetical protein  47.1 
 
 
165 aa  144  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00223  hypothetical protein  47.1 
 
 
165 aa  144  5e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00227  hypothetical protein  47.1 
 
 
165 aa  144  5e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3379  conserved hypothetical protein  47.1 
 
 
165 aa  143  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0796  hypothetical protein  43.95 
 
 
159 aa  141  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0240  hypothetical protein  45.81 
 
 
165 aa  141  4e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1888  hypothetical protein  44.59 
 
 
171 aa  140  7e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.17258  hitchhiker  0.00842787 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2835  hypothetical protein  44.17 
 
 
191 aa  136  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0352  hypothetical protein  43.42 
 
 
187 aa  127  6e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.642542  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2890  hypothetical protein  43.31 
 
 
191 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0361  hypothetical protein  44.23 
 
 
191 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2531  transposase  42.76 
 
 
187 aa  124  8.000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719011  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2532  hypothetical protein  30.72 
 
 
157 aa  78.2  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.709096 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0347  hypothetical protein  34.58 
 
 
158 aa  57  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.119312  normal  0.0189577 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3477  hypothetical protein  29.84 
 
 
188 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.379705  normal  0.40189 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0093  hypothetical protein  27.63 
 
 
234 aa  55.5  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150021  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4599  hypothetical protein  26.06 
 
 
160 aa  55.5  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1552  hypothetical protein  30.61 
 
 
205 aa  54.7  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0339239 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3277  protein of unknown function DUF1568  33.04 
 
 
197 aa  54.7  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1888b  hypothetical protein  53.19 
 
 
101 aa  53.1  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0301  hypothetical protein  53.19 
 
 
91 aa  53.1  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1975  hypothetical protein  27.27 
 
 
163 aa  52.4  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2244  transposase  28.1 
 
 
161 aa  52.4  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.196666  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1512  hypothetical protein  23.75 
 
 
222 aa  52.4  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.656335 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1784  hypothetical protein  45.16 
 
 
197 aa  51.6  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0885  protein of unknown function DUF1568  25.95 
 
 
169 aa  50.4  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3712  hypothetical protein  26.67 
 
 
177 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013542 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1676  hypothetical protein  26.67 
 
 
157 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3286  protein of unknown function DUF1568  29.41 
 
 
214 aa  48.5  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00118326  unclonable  0.0000000135739 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4462  hypothetical protein  28.47 
 
 
152 aa  48.1  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2844  hypothetical protein  26.39 
 
 
168 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0996  protein of unknown function DUF1568  24.7 
 
 
216 aa  47.4  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.976226  normal  0.164778 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33350  hypothetical protein  64.71 
 
 
38 aa  47.4  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1802  protein of unknown function DUF1568  25.83 
 
 
240 aa  47.4  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3016  hypothetical protein  25.48 
 
 
312 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3871  protein of unknown function DUF1568  24.5 
 
 
236 aa  46.2  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0917  protein of unknown function DUF1568  25.49 
 
 
221 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2777  hypothetical protein  26 
 
 
149 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.430133  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3252  hypothetical protein  26.06 
 
 
174 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1136  hypothetical protein  24.69 
 
 
192 aa  45.8  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0793  hypothetical protein  24.84 
 
 
314 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5382  hypothetical protein  23.9 
 
 
223 aa  45.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal  0.588654 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2264  transposase and inactivated derivatives  27.19 
 
 
323 aa  44.7  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.88974  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0459  protein of unknown function DUF1568  30.69 
 
 
219 aa  45.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0472  protein of unknown function DUF1568  31.68 
 
 
185 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2265  transposase and inactivated derivatives  28.04 
 
 
241 aa  44.7  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3612  hypothetical protein  30.33 
 
 
201 aa  44.7  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0368765  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1484  hypothetical protein  27.87 
 
 
231 aa  44.3  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4707  hypothetical protein  31.58 
 
 
152 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1748  hypothetical protein  25.17 
 
 
312 aa  44.3  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.994794  normal  0.0128416 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3154  hypothetical protein  40 
 
 
58 aa  43.9  0.0009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0787684 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0337  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  23.81 
 
 
1345 aa  43.9  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.038664  normal  0.920027 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5411  protein of unknown function DUF1568  27.27 
 
 
218 aa  43.9  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000187281  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3049  transposase and inactivated derivatives  23.57 
 
 
226 aa  43.5  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1068  hypothetical protein  24.49 
 
 
179 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0377724 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0489  hypothetical protein  27.12 
 
 
310 aa  43.5  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.448467 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0311  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  21.93 
 
 
1372 aa  43.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.220801 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2426  hypothetical protein  22.73 
 
 
249 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.763748  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3465  hypothetical protein  28 
 
 
150 aa  43.9  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4446  hypothetical protein  28.16 
 
 
236 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.885807  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3026  hypothetical protein  40.91 
 
 
76 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.247877  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3020  hypothetical protein  23.53 
 
 
316 aa  43.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2468  hypothetical protein  25 
 
 
181 aa  42.4  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.321631  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1450  hypothetical protein  23.38 
 
 
203 aa  42  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4549  hypothetical protein  26.17 
 
 
181 aa  42.4  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.86188 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5083  hypothetical protein  27.08 
 
 
151 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268045  normal  0.309651 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2607  protein of unknown function DUF1568  23.66 
 
 
186 aa  42  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.407993  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1272  hypothetical protein  25 
 
 
196 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1364  hypothetical protein  25.32 
 
 
150 aa  41.6  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0968684  normal  0.0104776 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1813  protein of unknown function DUF1568  23.94 
 
 
277 aa  41.6  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00112655  hitchhiker  0.00000000103135 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0493  transposase  25.53 
 
 
222 aa  41.2  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2563  protein of unknown function DUF1568  22.01 
 
 
248 aa  41.2  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5176  hypothetical protein  27.08 
 
 
184 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00299086  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0995  hypothetical protein  29.35 
 
 
163 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1024  hypothetical protein  29.35 
 
 
163 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0275616 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4223  hypothetical protein  27.88 
 
 
212 aa  40.4  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3976  protein of unknown function DUF1568  26.27 
 
 
151 aa  40.4  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.183049  normal  0.223747 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>