69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2468 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2468  hypothetical protein  100 
 
 
181 aa  372  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.321631  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2777  hypothetical protein  34.75 
 
 
149 aa  77.8  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.430133  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4421  hypothetical protein  34.97 
 
 
152 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.268203 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1133  hypothetical protein  34.72 
 
 
153 aa  70.9  0.000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000547954  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1489  hypothetical protein  30.5 
 
 
153 aa  70.5  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0262  hypothetical protein  32.39 
 
 
152 aa  67.8  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0361  hypothetical protein  27.21 
 
 
191 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1685  hypothetical protein  27.34 
 
 
149 aa  64.3  0.0000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.365398  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5047  hypothetical protein  33.33 
 
 
151 aa  64.3  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0419469  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0613  hypothetical protein  31.03 
 
 
151 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.018198 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0607  hypothetical protein  34.72 
 
 
151 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0568  hypothetical protein  34.72 
 
 
151 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5083  hypothetical protein  29.93 
 
 
151 aa  62  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268045  normal  0.309651 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4707  hypothetical protein  32.89 
 
 
152 aa  62  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2835  hypothetical protein  27.21 
 
 
191 aa  60.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3465  hypothetical protein  31.03 
 
 
150 aa  59.7  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1364  hypothetical protein  30.71 
 
 
150 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0968684  normal  0.0104776 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3976  protein of unknown function DUF1568  32.03 
 
 
151 aa  58.2  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.183049  normal  0.223747 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0943  protein of unknown function DUF1568  27.97 
 
 
163 aa  57.4  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3135  hypothetical protein  28.67 
 
 
176 aa  57  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.01424 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3919  hypothetical protein  29.08 
 
 
151 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0968412  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2890  hypothetical protein  25.52 
 
 
191 aa  55.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1975  hypothetical protein  30.71 
 
 
163 aa  54.7  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1574  hypothetical protein  31.25 
 
 
150 aa  54.7  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.620864  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0788  hypothetical protein  26.76 
 
 
150 aa  53.9  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4597  hypothetical protein  29.17 
 
 
151 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0971888 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0796  hypothetical protein  26.72 
 
 
159 aa  53.1  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2793  transposase-like p;rotein  28.99 
 
 
165 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1317  protein of unknown function DUF1568  25.53 
 
 
179 aa  50.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.737296  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4599  hypothetical protein  30.16 
 
 
160 aa  50.8  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1888  hypothetical protein  24.82 
 
 
171 aa  50.1  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.17258  hitchhiker  0.00842787 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1701  hypothetical protein  25 
 
 
174 aa  50.1  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5236  hypothetical protein  27.21 
 
 
151 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1552  hypothetical protein  28.46 
 
 
205 aa  48.9  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0339239 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3477  hypothetical protein  25.37 
 
 
188 aa  48.9  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.379705  normal  0.40189 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2396  hypothetical protein  25.74 
 
 
220 aa  47.8  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0136  transposase  25.36 
 
 
236 aa  47.8  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0352  hypothetical protein  26.53 
 
 
187 aa  47.8  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.642542  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3248  protein of unknown function DUF1568  23.78 
 
 
181 aa  46.6  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00178625  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0459  protein of unknown function DUF1568  25.81 
 
 
219 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0472  protein of unknown function DUF1568  25.81 
 
 
185 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3405  hypothetical protein  26.21 
 
 
179 aa  45.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0242544  normal  0.205029 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3078  protein of unknown function DUF1568  25.53 
 
 
190 aa  45.1  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2530  hypothetical protein  22.07 
 
 
179 aa  45.1  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4226  hypothetical protein  26.76 
 
 
177 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.853067  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3252  hypothetical protein  26.85 
 
 
174 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0917  protein of unknown function DUF1568  25 
 
 
221 aa  43.9  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3105  protein of unknown function DUF1568  24.82 
 
 
192 aa  44.3  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000625853  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1855  hypothetical protein  27.59 
 
 
175 aa  43.9  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1689  hypothetical protein  24.05 
 
 
184 aa  43.5  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.625848  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1384  hypothetical protein  22.63 
 
 
180 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.705846 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0148  transposase  22.16 
 
 
236 aa  43.5  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0526667  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0885  protein of unknown function DUF1568  24.52 
 
 
169 aa  43.5  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2531  transposase  25.85 
 
 
187 aa  43.1  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719011  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1962  hypothetical protein  29.24 
 
 
164 aa  43.5  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5176  hypothetical protein  27.2 
 
 
184 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00299086  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2844  hypothetical protein  26.85 
 
 
168 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0793  hypothetical protein  25.19 
 
 
314 aa  43.5  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1748  hypothetical protein  26.81 
 
 
312 aa  42.4  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.994794  normal  0.0128416 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4462  hypothetical protein  33.8 
 
 
152 aa  42.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2421  hypothetical protein  25 
 
 
161 aa  42.4  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1032  protein of unknown function DUF1568  27.54 
 
 
326 aa  42.4  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1558  protein of unknown function DUF1568  24.64 
 
 
230 aa  42  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.55731 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4081  hypothetical protein  24.31 
 
 
177 aa  42  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0580442  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2198  transposase  25 
 
 
253 aa  41.6  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1356  hypothetical protein  24.07 
 
 
319 aa  41.2  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.895893  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3020  hypothetical protein  25.93 
 
 
316 aa  41.6  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1386  protein of unknown function DUF1568  26.57 
 
 
325 aa  41.2  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0315  hypothetical protein  24.54 
 
 
197 aa  40.8  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>