86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_3379 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_3379  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  347  6e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00223  hypothetical protein  97.56 
 
 		 165 aa  337  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00227  hypothetical protein  97.56 
 
 		 165 aa  337  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3392  hypothetical protein  96.95 
 
 		 165 aa  335  9.999999999999999e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0240  hypothetical protein  93.9 
 
 		 165 aa  327  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4825  transposase and inactivated derivative  68.32 
 
 		 163 aa  240  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4226  hypothetical protein  54.24 
 
 		 177 aa  194  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.853067  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4081  hypothetical protein  52.38 
 
 		 177 aa  185  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0580442  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1685  transposase, putative  52.81 
 
 		 184 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.207714 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33360  hypothetical protein  52.44 
 
 		 176 aa  176  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1473  transposase, putative  52.1 
 
 		 179 aa  176  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1952  hypothetical protein  50.3 
 
 		 178 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1962  hypothetical protein  49.69 
 
 		 164 aa  169  2e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3130  transposase and inactivated derivatives  47.95 
 
 		 178 aa  168  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0127624  normal  0.415202 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3405  hypothetical protein  47.73 
 
 		 179 aa  167  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0242544  normal  0.205029 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2530  hypothetical protein  48.89 
 
 		 179 aa  167  7e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0731  hypothetical protein  49.7 
 
 		 176 aa  166  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0796  hypothetical protein  52.2 
 
 		 159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0768  hypothetical protein  49.7 
 
 		 175 aa  161  4.0000000000000004e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0333217  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1855  hypothetical protein  46.15 
 
 		 175 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4373  hypothetical protein  44.85 
 
 		 178 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295832  normal  0.0449373 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1317  protein of unknown function DUF1568  44.38 
 
 		 179 aa  153  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.737296  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1689  hypothetical protein  45.09 
 
 		 184 aa  151  5e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.625848  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3135  hypothetical protein  43.93 
 
 		 176 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.01424 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1888  hypothetical protein  45.4 
 
 		 171 aa  148  3e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.17258  hitchhiker  0.00842787 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2421  hypothetical protein  47.1 
 
 		 161 aa  143  1e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2531  transposase  46.75 
 
 		 187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719011  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0352  hypothetical protein  45.66 
 
 		 187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.642542  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1384  hypothetical protein  41.32 
 
 		 180 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.705846 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0243  hypothetical protein  40.57 
 
 		 178 aa  135  2e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.273479  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2478  hypothetical protein  43.84 
 
 		 161 aa  130  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2835  hypothetical protein  41.42 
 
 		 191 aa  128  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0361  hypothetical protein  39.64 
 
 		 191 aa  124  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2890  hypothetical protein  36.69 
 
 		 191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2532  hypothetical protein  38.89 
 
 		 157 aa  109  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709096 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0721b  hypothetical protein  42.97 
 
 		 133 aa  109  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2244  transposase  34.4 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.196666  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3465  hypothetical protein  30.43 
 
 		 150 aa  57  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4707  hypothetical protein  26.67 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1552  hypothetical protein  26.17 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0339239 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5176  hypothetical protein  33.33 
 
 		 184 aa  54.3  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00299086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0613  hypothetical protein  26.81 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.018198 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3477  hypothetical protein  25.74 
 
 		 188 aa  52.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.379705  normal  0.40189 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5083  hypothetical protein  32.18 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268045  normal  0.309651 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4599  hypothetical protein  26.15 
 
 		 160 aa  50.8  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1364  hypothetical protein  32.18 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0968684  normal  0.0104776 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0262  hypothetical protein  23.7 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0568  hypothetical protein  30.34 
 
 		 151 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0607  hypothetical protein  30.34 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4597  hypothetical protein  25.55 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0971888 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1975  hypothetical protein  25.74 
 
 		 163 aa  48.9  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3976  protein of unknown function DUF1568  31.78 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.183049  normal  0.223747 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1784  hypothetical protein  30.28 
 
 		 197 aa  48.9  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0788  hypothetical protein  29.55 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5047  hypothetical protein  31.03 
 
 		 151 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0419469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3277  protein of unknown function DUF1568  32.65 
 
 		 197 aa  48.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0917  protein of unknown function DUF1568  28.26 
 
 		 221 aa  47.8  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2777  hypothetical protein  31.46 
 
 		 149 aa  47.8  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.430133  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3154  hypothetical protein  39.68 
 
 		 58 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0787684 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4462  hypothetical protein  22.73 
 
 		 152 aa  47.4  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1489  hypothetical protein  31.18 
 
 		 153 aa  47.4  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3612  hypothetical protein  26.97 
 
 		 201 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0368765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1685  hypothetical protein  24.46 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.365398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1888b  hypothetical protein  47.22 
 
 		 101 aa  46.2  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0301  hypothetical protein  47.22 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1133  hypothetical protein  28.85 
 
 		 153 aa  45.8  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000547954  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5411  protein of unknown function DUF1568  23.01 
 
 		 218 aa  45.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000187281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3919  hypothetical protein  28.57 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0968412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4421  hypothetical protein  32.95 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.268203 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0136  transposase  24.32 
 
 		 236 aa  43.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0337  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  27.36 
 
 		 1345 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.038664  normal  0.920027 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0347  hypothetical protein  32.98 
 
 		 158 aa  43.9  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.119312  normal  0.0189577 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2932  hypothetical protein  22.76 
 
 		 234 aa  43.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0284  hypothetical protein  23.53 
 
 		 187 aa  43.1  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0148  transposase  26.13 
 
 		 236 aa  42.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0526667  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2474  protein of unknown function DUF1568  24.48 
 
 		 224 aa  43.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000403207  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5236  hypothetical protein  28.74 
 
 		 151 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1574  hypothetical protein  26.44 
 
 		 150 aa  42.4  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.620864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2563  hypothetical protein  29.51 
 
 		 176 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000213064  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0885  protein of unknown function DUF1568  23.19 
 
 		 169 aa  42  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1512  hypothetical protein  24.58 
 
 		 222 aa  41.6  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.656335 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0554  hypothetical protein  25.68 
 
 		 177 aa  41.6  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4223  hypothetical protein  25.49 
 
 		 212 aa  41.2  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1136  hypothetical protein  23.93 
 
 		 192 aa  41.2  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1802  protein of unknown function DUF1568  20.41 
 
 		 240 aa  40.8  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0682  hypothetical protein  23.53 
 
 		 232 aa  40.8  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349284  normal  0.584525 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>