51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2532 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2532  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  317  3e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.709096 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0361  hypothetical protein  37.04 
 
 
191 aa  114  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3392  hypothetical protein  38.89 
 
 
165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00223  hypothetical protein  38.89 
 
 
165 aa  111  5e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00227  hypothetical protein  38.89 
 
 
165 aa  111  5e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0352  hypothetical protein  37.97 
 
 
187 aa  110  6e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.642542  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3379  conserved hypothetical protein  38.89 
 
 
165 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0240  hypothetical protein  37.5 
 
 
165 aa  107  8.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2531  transposase  37.34 
 
 
187 aa  106  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719011  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2890  hypothetical protein  35.19 
 
 
191 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1317  protein of unknown function DUF1568  37.04 
 
 
179 aa  105  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.737296  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1473  transposase, putative  37.28 
 
 
179 aa  105  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1888  hypothetical protein  34.62 
 
 
171 aa  103  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.17258  hitchhiker  0.00842787 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1685  transposase, putative  37.65 
 
 
184 aa  101  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.207714 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2835  hypothetical protein  34.34 
 
 
191 aa  100  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1384  hypothetical protein  30.43 
 
 
180 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.705846 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2530  hypothetical protein  32.93 
 
 
179 aa  95.5  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33360  hypothetical protein  37.42 
 
 
176 aa  94.7  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1952  hypothetical protein  37.58 
 
 
178 aa  95.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4226  hypothetical protein  35.12 
 
 
177 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.853067  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0768  hypothetical protein  37.5 
 
 
175 aa  92.8  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0333217  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3405  hypothetical protein  37.01 
 
 
179 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0242544  normal  0.205029 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3135  hypothetical protein  37.11 
 
 
176 aa  91.7  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.01424 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4373  hypothetical protein  33.33 
 
 
178 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295832  normal  0.0449373 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4825  transposase and inactivated derivative  34.69 
 
 
163 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1855  hypothetical protein  33.96 
 
 
175 aa  88.6  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3130  transposase and inactivated derivatives  35.54 
 
 
178 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0127624  normal  0.415202 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0796  hypothetical protein  33.56 
 
 
159 aa  83.2  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4081  hypothetical protein  33.73 
 
 
177 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0580442  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1689  hypothetical protein  30 
 
 
184 aa  82.8  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.625848  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2421  hypothetical protein  30.72 
 
 
161 aa  78.2  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1962  hypothetical protein  29.11 
 
 
164 aa  77.8  0.00000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0721b  hypothetical protein  30.71 
 
 
133 aa  76.6  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2244  transposase  38.96 
 
 
161 aa  72  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.196666  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2478  hypothetical protein  27.86 
 
 
161 aa  66.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0243  hypothetical protein  27.27 
 
 
178 aa  65.1  0.0000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.273479  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0731  hypothetical protein  29.49 
 
 
176 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3477  hypothetical protein  28.46 
 
 
188 aa  57.4  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.379705  normal  0.40189 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4462  hypothetical protein  26.72 
 
 
152 aa  53.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3919  hypothetical protein  31.06 
 
 
151 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0968412  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3976  protein of unknown function DUF1568  30.37 
 
 
151 aa  49.7  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.183049  normal  0.223747 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4599  hypothetical protein  26.52 
 
 
160 aa  48.5  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1489  hypothetical protein  25.2 
 
 
153 aa  47  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4421  hypothetical protein  26.77 
 
 
152 aa  47.4  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.268203 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0885  protein of unknown function DUF1568  28.38 
 
 
169 aa  46.2  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1364  hypothetical protein  28.36 
 
 
150 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0968684  normal  0.0104776 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3465  hypothetical protein  31.78 
 
 
150 aa  45.1  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0943  protein of unknown function DUF1568  23.65 
 
 
163 aa  43.9  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4707  hypothetical protein  30.37 
 
 
152 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5236  hypothetical protein  25 
 
 
151 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3612  hypothetical protein  35.9 
 
 
201 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0368765  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>