139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3465 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3465  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  307  2.9999999999999997e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3976  protein of unknown function DUF1568  51.33 
 
 		 151 aa  159  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.183049  normal  0.223747 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0943  protein of unknown function DUF1568  49.66 
 
 		 163 aa  152  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1133  hypothetical protein  44.52 
 
 		 153 aa  120  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000547954  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4707  hypothetical protein  43.26 
 
 		 152 aa  120  9e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0262  hypothetical protein  44.68 
 
 		 152 aa  117  7e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3919  hypothetical protein  44.14 
 
 		 151 aa  114  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0968412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4421  hypothetical protein  41.43 
 
 		 152 aa  110  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.268203 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0613  hypothetical protein  41.55 
 
 		 151 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.018198 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4597  hypothetical protein  41.55 
 
 		 151 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0971888 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5083  hypothetical protein  41.1 
 
 		 151 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268045  normal  0.309651 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5236  hypothetical protein  42.25 
 
 		 151 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1489  hypothetical protein  37.06 
 
 		 153 aa  104  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2777  hypothetical protein  39.74 
 
 		 149 aa  104  5e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.430133  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1364  hypothetical protein  40.14 
 
 		 150 aa  104  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0968684  normal  0.0104776 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0568  hypothetical protein  44.52 
 
 		 151 aa  101  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5176  hypothetical protein  42.19 
 
 		 184 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00299086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0607  hypothetical protein  43.84 
 
 		 151 aa  100  8e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5047  hypothetical protein  39.31 
 
 		 151 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0419469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1685  hypothetical protein  32.87 
 
 		 149 aa  92.4  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.365398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1574  hypothetical protein  40.14 
 
 		 150 aa  91.7  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.620864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0788  hypothetical protein  34.03 
 
 		 150 aa  83.2  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16060  hypothetical protein  43.9 
 
 		 86 aa  74.7  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0796  hypothetical protein  28.57 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1975  hypothetical protein  31.29 
 
 		 163 aa  65.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2530  hypothetical protein  24.83 
 
 		 179 aa  64.3  0.0000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3286  protein of unknown function DUF1568  29.51 
 
 		 214 aa  63.9  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00118326  unclonable  0.0000000135739 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3135  hypothetical protein  30.56 
 
 		 176 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.01424 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4226  hypothetical protein  33.04 
 
 		 177 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.853067  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4825  transposase and inactivated derivative  31.58 
 
 		 163 aa  60.5  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1317  protein of unknown function DUF1568  30.37 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.737296  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2468  hypothetical protein  31.03 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.321631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0240  hypothetical protein  31.52 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1552  hypothetical protein  29.77 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0339239 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3379  conserved hypothetical protein  30.43 
 
 		 165 aa  57  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1689  hypothetical protein  28.86 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.625848  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0311  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  34.29 
 
 		 1372 aa  56.2  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.220801 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2835  hypothetical protein  27.61 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00223  hypothetical protein  29.35 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00227  hypothetical protein  29.35 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3392  hypothetical protein  29.35 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02732  hypothetical protein  38.67 
 
 		 91 aa  56.2  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.979452  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3702  hypothetical protein  30.91 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000809832 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5411  protein of unknown function DUF1568  28.24 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000187281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0243  hypothetical protein  26.32 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.273479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4599  hypothetical protein  36.05 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3130  transposase and inactivated derivatives  33.33 
 
 		 178 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0127624  normal  0.415202 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0731  hypothetical protein  29.37 
 
 		 176 aa  53.9  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4223  hypothetical protein  27.94 
 
 		 212 aa  54.3  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4081  hypothetical protein  26.76 
 
 		 177 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0580442  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1888  hypothetical protein  25.19 
 
 		 171 aa  53.5  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.17258  hitchhiker  0.00842787 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2844  hypothetical protein  29.03 
 
 		 168 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4462  hypothetical protein  27.13 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2890  hypothetical protein  25.37 
 
 		 191 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0721b  hypothetical protein  27.87 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0337  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  33.33 
 
 		 1345 aa  51.6  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.038664  normal  0.920027 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33360  hypothetical protein  28.57 
 
 		 176 aa  51.6  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3252  hypothetical protein  27.45 
 
 		 174 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1032  protein of unknown function DUF1568  25.4 
 
 		 326 aa  51.2  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0352  hypothetical protein  25.69 
 
 		 187 aa  51.2  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.642542  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2474  protein of unknown function DUF1568  37.04 
 
 		 224 aa  51.2  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000403207  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1966  hypothetical protein  31.19 
 
 		 231 aa  50.8  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.74185  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5035  protein of unknown function DUF1568  28.41 
 
 		 214 aa  50.4  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.916294 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1473  transposase, putative  28.97 
 
 		 179 aa  50.8  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1092  hypothetical protein  26.37 
 
 		 223 aa  50.8  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.462205  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1952  hypothetical protein  36 
 
 		 178 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1855  hypothetical protein  31.54 
 
 		 175 aa  50.4  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0361  hypothetical protein  23.24 
 
 		 191 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1384  hypothetical protein  26.06 
 
 		 180 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.705846 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2531  transposase  25 
 
 		 187 aa  49.3  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719011  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0595  hypothetical protein  25.22 
 
 		 258 aa  48.9  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.217159  hitchhiker  2.03187e-17 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3049  transposase and inactivated derivatives  30.68 
 
 		 226 aa  47.8  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3477  hypothetical protein  32.95 
 
 		 188 aa  47.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.379705  normal  0.40189 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3321  hypothetical protein  37.93 
 
 		 197 aa  46.6  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  hitchhiker  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1024  hypothetical protein  28.57 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0275616 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0885  protein of unknown function DUF1568  30.69 
 
 		 169 aa  46.6  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2153  hypothetical protein  32.58 
 
 		 221 aa  47  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0207768  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0995  hypothetical protein  28.57 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1084  transposase and inactivated derivatives  27.86 
 
 		 338 aa  45.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1552  protein of unknown function DUF1568  31.96 
 
 		 230 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.268269 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3405  hypothetical protein  29.29 
 
 		 179 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0242544  normal  0.205029 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1962  hypothetical protein  24.18 
 
 		 164 aa  45.4  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0164  transposase  27.74 
 
 		 287 aa  45.4  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0743928  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2321  hypothetical protein  35.42 
 
 		 297 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0102584 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0554  hypothetical protein  29.17 
 
 		 177 aa  45.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1356  hypothetical protein  26.81 
 
 		 319 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.895893  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2771  hypothetical protein  30.68 
 
 		 318 aa  44.7  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2643  transposase domain-containing protein  28.78 
 
 		 335 aa  45.1  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2532  hypothetical protein  31.78 
 
 		 157 aa  45.1  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709096 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0300  hypothetical protein  22.84 
 
 		 193 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.401229  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1791  transposase and inactivated derivatives  30.77 
 
 		 323 aa  44.3  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2793  transposase-like p;rotein  32.22 
 
 		 165 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1748  hypothetical protein  30.12 
 
 		 312 aa  44.3  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.994794  normal  0.0128416 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1272  hypothetical protein  29.87 
 
 		 196 aa  44.3  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2451  hypothetical protein  24.86 
 
 		 201 aa  44.3  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.875999 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1453  hypothetical protein  25.42 
 
 		 203 aa  44.3  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1554  protein of unknown function DUF1568  30.93 
 
 		 230 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.335003 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1556  protein of unknown function DUF1568  30.93 
 
 		 230 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.444415 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1685  transposase, putative  30.25 
 
 		 184 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.207714 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2421  hypothetical protein  28 
 
 		 161 aa  43.9  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>