207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3477 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3477  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  392  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.379705  normal  0.40189 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0885  protein of unknown function DUF1568  35.19 
 
 
169 aa  96.3  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2607  protein of unknown function DUF1568  30.81 
 
 
186 aa  84  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.407993  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2835  hypothetical protein  28.77 
 
 
191 aa  72.4  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2890  hypothetical protein  28.57 
 
 
191 aa  71.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3135  hypothetical protein  27.7 
 
 
176 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.01424 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1975  hypothetical protein  32.58 
 
 
163 aa  67.8  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0352  hypothetical protein  25.9 
 
 
187 aa  66.6  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.642542  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2531  transposase  26.51 
 
 
187 aa  67  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719011  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0361  hypothetical protein  27.39 
 
 
191 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0731  hypothetical protein  27.15 
 
 
176 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0243  hypothetical protein  26.95 
 
 
178 aa  64.7  0.0000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.273479  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0793  hypothetical protein  29.71 
 
 
314 aa  63.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3020  hypothetical protein  28.57 
 
 
316 aa  62.8  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1888  hypothetical protein  26.9 
 
 
171 aa  62.4  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.17258  hitchhiker  0.00842787 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2776  hypothetical protein  31.01 
 
 
235 aa  62  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.721483  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3016  hypothetical protein  29.29 
 
 
312 aa  62  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1689  hypothetical protein  27.27 
 
 
184 aa  61.2  0.000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.625848  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2153  hypothetical protein  29.45 
 
 
221 aa  61.2  0.000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0207768  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0721b  hypothetical protein  29.75 
 
 
133 aa  60.5  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4226  hypothetical protein  29.05 
 
 
177 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.853067  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1574  hypothetical protein  29.23 
 
 
150 aa  59.7  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.620864  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2530  hypothetical protein  25.52 
 
 
179 aa  60.1  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3049  transposase and inactivated derivatives  23.81 
 
 
226 aa  58.9  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0033  hypothetical protein  29.29 
 
 
235 aa  58.9  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1748  hypothetical protein  28.37 
 
 
312 aa  58.9  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.994794  normal  0.0128416 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0917  protein of unknown function DUF1568  34.02 
 
 
221 aa  58.5  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1317  protein of unknown function DUF1568  26.35 
 
 
179 aa  58.5  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.737296  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3353  protein of unknown function DUF1568  22.67 
 
 
181 aa  58.5  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.231762 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3295  hypothetical protein  28.81 
 
 
230 aa  58.9  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1701  hypothetical protein  32 
 
 
174 aa  58.5  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0136  transposase  32.19 
 
 
236 aa  57.8  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0768  hypothetical protein  27.46 
 
 
175 aa  57.4  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0333217  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1962  hypothetical protein  24.39 
 
 
164 aa  57.4  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1484  hypothetical protein  28.83 
 
 
231 aa  57.4  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2532  hypothetical protein  28.46 
 
 
157 aa  57.4  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.709096 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1855  hypothetical protein  32.58 
 
 
175 aa  57.4  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2421  hypothetical protein  29.84 
 
 
161 aa  56.6  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2264  transposase and inactivated derivatives  27.08 
 
 
323 aa  57  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.88974  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0148  transposase  31.25 
 
 
236 aa  56.6  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0526667  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4373  hypothetical protein  26.32 
 
 
178 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295832  normal  0.0449373 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3037  protein of unknown function DUF1568  28.95 
 
 
315 aa  56.2  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0231  protein of unknown function DUF1568  31.11 
 
 
298 aa  55.8  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2478  hypothetical protein  25.97 
 
 
161 aa  55.5  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33360  hypothetical protein  27.89 
 
 
176 aa  55.5  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1384  hypothetical protein  22.29 
 
 
180 aa  55.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.705846 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0240  hypothetical protein  25 
 
 
165 aa  54.7  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3612  hypothetical protein  28.68 
 
 
201 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0368765  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4825  transposase and inactivated derivative  27.54 
 
 
163 aa  55.1  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0796  hypothetical protein  28 
 
 
159 aa  54.7  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0788  hypothetical protein  27.07 
 
 
150 aa  54.7  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2474  protein of unknown function DUF1568  31.48 
 
 
224 aa  54.7  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000403207  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00223  hypothetical protein  25.74 
 
 
165 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0242  protein of unknown function DUF1568  30.37 
 
 
298 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0717597  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00227  hypothetical protein  25.74 
 
 
165 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3392  hypothetical protein  25.74 
 
 
165 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2265  transposase and inactivated derivatives  29.31 
 
 
241 aa  54.3  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0790  hypothetical protein  25.17 
 
 
232 aa  54.3  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.513436  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2563  hypothetical protein  27.67 
 
 
176 aa  53.9  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000213064  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3926  hypothetical protein  26.28 
 
 
322 aa  54.3  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0943  protein of unknown function DUF1568  26.81 
 
 
163 aa  53.9  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4421  hypothetical protein  27.48 
 
 
152 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.268203 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3976  protein of unknown function DUF1568  28.68 
 
 
151 aa  53.1  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.183049  normal  0.223747 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1685  transposase, putative  24.84 
 
 
184 aa  53.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.207714 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2897  protein of unknown function DUF1568  29.47 
 
 
250 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0682  hypothetical protein  26.81 
 
 
232 aa  53.5  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349284  normal  0.584525 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3379  conserved hypothetical protein  25.74 
 
 
165 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0337  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  35.71 
 
 
1345 aa  52.4  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.038664  normal  0.920027 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2396  hypothetical protein  25.35 
 
 
220 aa  52.4  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3130  transposase and inactivated derivatives  31.25 
 
 
178 aa  52.4  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0127624  normal  0.415202 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3244  protein of unknown function DUF1568  29.47 
 
 
241 aa  52.4  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1473  transposase, putative  25.17 
 
 
179 aa  52  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1952  hypothetical protein  27.89 
 
 
178 aa  52  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0450  transposase  26.87 
 
 
141 aa  52  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2771  hypothetical protein  26.9 
 
 
318 aa  51.6  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0397  protein of unknown function DUF1568  31.37 
 
 
304 aa  51.6  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000164254  normal  0.853679 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3405  hypothetical protein  26.98 
 
 
179 aa  52  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0242544  normal  0.205029 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12790  transposase  25.2 
 
 
241 aa  51.6  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3277  protein of unknown function DUF1568  27.21 
 
 
197 aa  51.6  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2563  protein of unknown function DUF1568  24.49 
 
 
248 aa  51.6  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3286  protein of unknown function DUF1568  35.05 
 
 
214 aa  51.2  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00118326  unclonable  0.0000000135739 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0477  hypothetical protein  27.68 
 
 
232 aa  51.2  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1151  protein of unknown function DUF1568  27.1 
 
 
231 aa  51.2  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1007  hypothetical protein  25.53 
 
 
234 aa  51.2  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849512  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1541  hypothetical protein  25 
 
 
267 aa  50.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.463797  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0311  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  34.52 
 
 
1372 aa  50.8  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.220801 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0220  hypothetical protein  30.66 
 
 
298 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0595  hypothetical protein  26.43 
 
 
258 aa  50.8  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.217159  hitchhiker  2.03187e-17 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0364  transposase-like protein  30.93 
 
 
235 aa  50.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.72516  normal  0.431982 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1552  hypothetical protein  31.4 
 
 
205 aa  50.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0339239 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3592  protein of unknown function DUF1568  30.93 
 
 
235 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00165115  hitchhiker  0.000000708999 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5382  hypothetical protein  32.65 
 
 
223 aa  50.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal  0.588654 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1724  hypothetical protein  23.91 
 
 
248 aa  50.4  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1725  hypothetical protein  23.91 
 
 
248 aa  50.1  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4462  hypothetical protein  24.03 
 
 
152 aa  50.1  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1802  protein of unknown function DUF1568  28.07 
 
 
240 aa  49.7  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1512  hypothetical protein  35.05 
 
 
222 aa  50.1  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.656335 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0093  hypothetical protein  29.52 
 
 
234 aa  50.1  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150021  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4223  hypothetical protein  25.14 
 
 
212 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0902  hypothetical protein  27.13 
 
 
250 aa  49.3  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>