146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3277 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3277  protein of unknown function DUF1568  100 
 
 
197 aa  407  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3612  hypothetical protein  55.74 
 
 
201 aa  205  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0368765  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0347  hypothetical protein  58.6 
 
 
158 aa  189  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.119312  normal  0.0189577 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1784  hypothetical protein  42.93 
 
 
197 aa  167  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1689  hypothetical protein  32.88 
 
 
184 aa  63.2  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.625848  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0721b  hypothetical protein  36.07 
 
 
133 aa  59.7  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1685  transposase, putative  29.5 
 
 
184 aa  59.3  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.207714 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2932  hypothetical protein  31.48 
 
 
234 aa  58.9  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12790  transposase  32.48 
 
 
241 aa  58.5  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1541  hypothetical protein  27.64 
 
 
267 aa  58.2  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.463797  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2474  protein of unknown function DUF1568  27.56 
 
 
224 aa  58.2  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000403207  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0790  hypothetical protein  29.63 
 
 
232 aa  57  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.513436  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0595  hypothetical protein  28.57 
 
 
258 aa  57  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.217159  hitchhiker  2.03187e-17 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2421  hypothetical protein  32.28 
 
 
161 aa  56.6  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0885  protein of unknown function DUF1568  26.11 
 
 
169 aa  56.6  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2530  hypothetical protein  28.77 
 
 
179 aa  55.5  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2563  protein of unknown function DUF1568  26.28 
 
 
248 aa  54.7  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2776  hypothetical protein  27.54 
 
 
235 aa  53.9  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.721483  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1317  protein of unknown function DUF1568  27.94 
 
 
179 aa  54.3  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.737296  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3477  hypothetical protein  27.21 
 
 
188 aa  53.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.379705  normal  0.40189 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0917  protein of unknown function DUF1568  29.2 
 
 
221 aa  53.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0793  hypothetical protein  28.38 
 
 
314 aa  53.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3020  hypothetical protein  28.19 
 
 
316 aa  53.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1512  hypothetical protein  27.43 
 
 
222 aa  53.1  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.656335 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0337  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  31.76 
 
 
1345 aa  52.4  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.038664  normal  0.920027 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3286  protein of unknown function DUF1568  37.37 
 
 
214 aa  52.4  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00118326  unclonable  0.0000000135739 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0682  hypothetical protein  29.25 
 
 
232 aa  52  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349284  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0311  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  29.59 
 
 
1372 aa  51.6  0.000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.220801 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0240  hypothetical protein  32.03 
 
 
165 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1966  hypothetical protein  31.17 
 
 
231 aa  51.6  0.000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.74185  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3016  hypothetical protein  31.29 
 
 
312 aa  51.6  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1151  protein of unknown function DUF1568  26.85 
 
 
231 aa  51.2  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4223  hypothetical protein  32.11 
 
 
212 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1701  hypothetical protein  25.68 
 
 
174 aa  51.2  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3871  protein of unknown function DUF1568  27.35 
 
 
236 aa  50.4  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1888  hypothetical protein  34.75 
 
 
171 aa  50.4  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.17258  hitchhiker  0.00842787 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1473  transposase, putative  29.5 
 
 
179 aa  50.4  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1962  hypothetical protein  31.78 
 
 
164 aa  50.4  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2777  hypothetical protein  31.25 
 
 
149 aa  50.1  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.430133  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2887  hypothetical protein  29.29 
 
 
242 aa  50.1  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3379  conserved hypothetical protein  29.69 
 
 
165 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0243  hypothetical protein  27.93 
 
 
178 aa  49.3  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.273479  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0361  hypothetical protein  27.33 
 
 
191 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5559  hypothetical protein  27.03 
 
 
236 aa  49.3  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316618  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00223  hypothetical protein  27.82 
 
 
165 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0996  protein of unknown function DUF1568  23.9 
 
 
216 aa  48.9  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.976226  normal  0.164778 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00227  hypothetical protein  27.82 
 
 
165 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2878  protein of unknown function DUF1568  26.56 
 
 
287 aa  49.3  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3392  hypothetical protein  27.82 
 
 
165 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1007  hypothetical protein  25.23 
 
 
234 aa  48.5  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849512  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4421  hypothetical protein  29.92 
 
 
152 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.268203 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2835  hypothetical protein  29.17 
 
 
191 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0477  hypothetical protein  27.66 
 
 
232 aa  47.4  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0708  protein of unknown function DUF1568  23.85 
 
 
233 aa  47.8  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.615013  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3702  hypothetical protein  38.1 
 
 
208 aa  47.4  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000809832 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2153  hypothetical protein  25.3 
 
 
221 aa  47.4  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0207768  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4599  hypothetical protein  26.85 
 
 
160 aa  47.8  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0352  hypothetical protein  26.14 
 
 
187 aa  46.6  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.642542  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0111  hypothetical protein  30.3 
 
 
325 aa  47  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3074  CheW protein  30.3 
 
 
325 aa  47  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.464984  normal  0.367409 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3465  hypothetical protein  30.3 
 
 
325 aa  46.6  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0641119 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1423  protein of unknown function DUF1568  30.7 
 
 
180 aa  46.6  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7985800000000005e-18 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0740  hypothetical protein  23.85 
 
 
255 aa  46.6  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345588  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1384  hypothetical protein  33.93 
 
 
180 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.705846 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1484  hypothetical protein  26.77 
 
 
231 aa  47  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0333  Type I secretion outer membrane protein, TolC  30.3 
 
 
325 aa  46.6  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0672756 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4226  hypothetical protein  28.67 
 
 
177 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.853067  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3670  transposase and inactivated derivatives  26.32 
 
 
228 aa  46.2  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4825  transposase and inactivated derivative  27.87 
 
 
163 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1406  protein of unknown function DUF1568  25.19 
 
 
289 aa  45.8  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2531  transposase  26.17 
 
 
187 aa  45.8  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719011  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1489  hypothetical protein  27.61 
 
 
153 aa  45.4  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3405  hypothetical protein  31.39 
 
 
179 aa  45.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0242544  normal  0.205029 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1967  hypothetical protein  25.24 
 
 
226 aa  45.4  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00827335  normal  0.496503 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3295  hypothetical protein  27.96 
 
 
230 aa  45.4  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2478  hypothetical protein  34.29 
 
 
161 aa  45.1  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2086  hypothetical protein  24.82 
 
 
321 aa  45.1  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.464464  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0487  transposase  29.17 
 
 
222 aa  45.1  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0788  hypothetical protein  28.79 
 
 
150 aa  45.1  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3017  hypothetical protein  31.82 
 
 
325 aa  45.1  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0296678 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1748  hypothetical protein  25.56 
 
 
312 aa  45.1  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.994794  normal  0.0128416 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4538  protein of unknown function DUF1568  29.17 
 
 
251 aa  45.1  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0855967  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1967  hypothetical protein  34.21 
 
 
282 aa  44.3  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.969925  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1724  hypothetical protein  24.8 
 
 
248 aa  44.3  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1725  hypothetical protein  24.8 
 
 
248 aa  44.3  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2324  Elongator protein 3/MiaB/NifB  32.84 
 
 
208 aa  44.3  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0123865 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2607  protein of unknown function DUF1568  25.49 
 
 
186 aa  44.3  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.407993  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33360  hypothetical protein  31.16 
 
 
176 aa  44.3  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2890  hypothetical protein  29.49 
 
 
191 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1055  transposase  32.35 
 
 
250 aa  44.7  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0093  hypothetical protein  23.93 
 
 
234 aa  44.3  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150021  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3135  hypothetical protein  26.06 
 
 
176 aa  43.9  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.01424 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5382  hypothetical protein  26.32 
 
 
223 aa  44.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal  0.588654 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0796  hypothetical protein  30.21 
 
 
159 aa  44.3  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1556  protein of unknown function DUF1568  23.31 
 
 
230 aa  43.5  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.444415 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2878  protein of unknown function DUF1568  24.43 
 
 
289 aa  43.9  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000473385 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3049  transposase and inactivated derivatives  24.57 
 
 
226 aa  43.5  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0459  transposase  27.5 
 
 
222 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1855  hypothetical protein  44.74 
 
 
175 aa  43.9  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0562  hypothetical protein  27.27 
 
 
370 aa  43.5  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0862774 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>