163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2324 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2324  Elongator protein 3/MiaB/NifB  100 
 
 		 208 aa  437  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0123865 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0282  hypothetical protein  95.65 
 
 		 325 aa  422  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.822944  hitchhiker  0.00000243422 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0281  hypothetical protein  94.2 
 
 		 325 aa  417  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015206 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2943  histidine kinase  94.69 
 
 		 325 aa  419  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0607  hypothetical protein  92.27 
 
 		 325 aa  407  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0111  hypothetical protein  82.61 
 
 		 325 aa  370  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3074  CheW protein  82.61 
 
 		 325 aa  370  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.464984  normal  0.367409 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0333  Type I secretion outer membrane protein, TolC  82.13 
 
 		 325 aa  369  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0672756 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3465  hypothetical protein  82.61 
 
 		 325 aa  369  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0641119 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3017  hypothetical protein  77.78 
 
 		 325 aa  340  5.999999999999999e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0296678 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3356  hypothetical protein  61.95 
 
 		 323 aa  275  3e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.526564  normal  0.864241 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3091  hypothetical protein  62.93 
 
 		 326 aa  275  4e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0496594 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0052  hypothetical protein  62.44 
 
 		 326 aa  271  6e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.186799 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02418  hypothetical protein  58.54 
 
 		 328 aa  268  5e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2307  hypothetical protein  61.95 
 
 		 326 aa  268  5e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3323  hypothetical protein  60.68 
 
 		 325 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1111  hypothetical protein  61.46 
 
 		 327 aa  266  2e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0480419  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1848  hypothetical protein  60 
 
 		 327 aa  266  2e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1948  hypothetical protein  59.51 
 
 		 327 aa  265  2.9999999999999995e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.557873  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0135  hypothetical protein  59.9 
 
 		 325 aa  264  5.999999999999999e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2402  hypothetical protein  59.42 
 
 		 325 aa  264  8.999999999999999e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.283143  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1385  hypothetical protein  59.51 
 
 		 327 aa  263  1e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.868466  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1921  hypothetical protein  59.9 
 
 		 325 aa  263  2e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3680  hypothetical protein  59.9 
 
 		 325 aa  263  2e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2299  hypothetical protein  58.45 
 
 		 325 aa  263  2e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.187044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0907  hypothetical protein  59.02 
 
 		 327 aa  260  8.999999999999999e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0248219  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1547  hypothetical protein  57.49 
 
 		 325 aa  260  1e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4530  hypothetical protein  57.49 
 
 		 325 aa  260  1e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1856  hypothetical protein  57.92 
 
 		 370 aa  260  1e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1735  hypothetical protein  59.51 
 
 		 327 aa  259  2e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2628  hypothetical protein  58.94 
 
 		 326 aa  259  2e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0115  hypothetical protein  57.97 
 
 		 325 aa  259  3e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0116  hypothetical protein  58.54 
 
 		 325 aa  258  3e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1241  hypothetical protein  58.94 
 
 		 325 aa  259  3e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1510  hypothetical protein  57.97 
 
 		 325 aa  259  3e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4132  hypothetical protein  57.56 
 
 		 327 aa  258  3e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2555  hypothetical protein  57.49 
 
 		 325 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00750734  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1546  hypothetical protein  57.49 
 
 		 326 aa  258  6e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0670  hypothetical protein  57 
 
 		 325 aa  257  7e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2392  hypothetical protein  58.45 
 
 		 325 aa  257  1e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.134929  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2653  hypothetical protein  58.54 
 
 		 326 aa  257  1e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2814  hypothetical protein  57.49 
 
 		 325 aa  257  1e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1948  hypothetical protein  57 
 
 		 326 aa  256  1e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.270103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1812  hypothetical protein  57.49 
 
 		 316 aa  256  1e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3040  hypothetical protein  56.52 
 
 		 325 aa  256  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3447  hypothetical protein  56.52 
 
 		 325 aa  256  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4547  hypothetical protein  56.52 
 
 		 325 aa  256  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1511  hypothetical protein  57 
 
 		 325 aa  256  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3087  hypothetical protein  59.51 
 
 		 325 aa  255  3e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2922  hypothetical protein  58.45 
 
 		 325 aa  254  6e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0196  hypothetical protein  58.05 
 
 		 326 aa  254  7e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.157282 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2785  hypothetical protein  59.02 
 
 		 325 aa  254  7e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0143634  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4465  hypothetical protein  57.49 
 
 		 325 aa  254  9e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1610  hypothetical protein  58.54 
 
 		 325 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3084  hypothetical protein  59.02 
 
 		 325 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0606  hypothetical protein  56.52 
 
 		 325 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1890  hypothetical protein  55.56 
 
 		 325 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2533  hypothetical protein  57.77 
 
 		 326 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0991372  normal  0.0595118 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0957  hypothetical protein  56.52 
 
 		 325 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00250015  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1264  hypothetical protein  56.52 
 
 		 325 aa  252  2.0000000000000002e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3473  hypothetical protein  55.07 
 
 		 325 aa  251  6e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3773  hypothetical protein  55.07 
 
 		 325 aa  248  5e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.149988  hitchhiker  0.00126811 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2679  hypothetical protein  58.25 
 
 		 336 aa  246  1e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0118762  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1378  hypothetical protein  54.59 
 
 		 325 aa  246  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000599998 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3681  hypothetical protein  56.04 
 
 		 323 aa  245  3e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2958  hypothetical protein  55.07 
 
 		 325 aa  245  3e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2622  hypothetical protein  57.71 
 
 		 319 aa  245  4e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0144606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4299  hypothetical protein  55.07 
 
 		 325 aa  244  9e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1436  protein of unknown function DUF1568  53.88 
 
 		 341 aa  240  1e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2414  hypothetical protein  54.63 
 
 		 341 aa  239  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.301389  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2414  hypothetical protein  57.77 
 
 		 326 aa  238  4e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.196776  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0868  hypothetical protein  53.4 
 
 		 344 aa  237  8e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3627  hypothetical protein  53.62 
 
 		 325 aa  236  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02306  hypothetical protein  54.33 
 
 		 324 aa  236  2e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.334783  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1697  hypothetical protein  54.81 
 
 		 349 aa  236  2e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1226  protein of unknown function DUF1568  54.63 
 
 		 341 aa  234  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.353731  hitchhiker  0.000000017845 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4749  hypothetical protein  52.66 
 
 		 325 aa  234  6e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.291957  hitchhiker  0.000564584 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2780  hypothetical protein  53.17 
 
 		 336 aa  234  8e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000960474  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2403  hypothetical protein  54.15 
 
 		 341 aa  234  8e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.284659  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2840  protein of unknown function DUF1568  54.81 
 
 		 345 aa  234  9e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0644633 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3299  hypothetical protein  54.07 
 
 		 213 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1945  protein of unknown function DUF1568  53.66 
 
 		 341 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.499337 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1861  hypothetical protein  53.55 
 
 		 329 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.633128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3659  hypothetical protein  53.85 
 
 		 347 aa  232  3e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1178  hypothetical protein  53.85 
 
 		 344 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0303591  normal  0.0825627 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0562  hypothetical protein  53.37 
 
 		 370 aa  232  4.0000000000000004e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0862774 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0910  hypothetical protein  53.37 
 
 		 344 aa  231  6e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3200  hypothetical protein  53.37 
 
 		 344 aa  231  7.000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.789239 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0856  hypothetical protein  51.2 
 
 		 347 aa  229  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2480  hypothetical protein  53.37 
 
 		 344 aa  228  3e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1126  hypothetical protein  53.37 
 
 		 344 aa  228  7e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.776641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2933  hypothetical protein  51.44 
 
 		 345 aa  226  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.161086  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2906  hypothetical protein  52.43 
 
 		 329 aa  225  4e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01831  hypothetical protein  65.58 
 
 		 271 aa  218  3.9999999999999997e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3041  hypothetical protein  56.11 
 
 		 198 aa  217  1e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3446  hypothetical protein  56.11 
 
 		 198 aa  217  1e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1700  protein of unknown function DUF1568  49.52 
 
 		 377 aa  215  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0414346 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3682  hypothetical protein  55.93 
 
 		 198 aa  209  3e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0200  hypothetical protein  55.23 
 
 		 293 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2839  hypothetical protein  48.18 
 
 		 137 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.504912  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>