189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0196 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_0196  hypothetical protein  100 
 
 
326 aa  684    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.157282 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2653  hypothetical protein  95.71 
 
 
326 aa  660    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1948  hypothetical protein  80.06 
 
 
326 aa  560  1e-158  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.270103  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0135  hypothetical protein  74.46 
 
 
325 aa  530  1e-149  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1921  hypothetical protein  75.86 
 
 
325 aa  523  1e-147  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3680  hypothetical protein  75.86 
 
 
325 aa  523  1e-147  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2392  hypothetical protein  73.67 
 
 
325 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.134929  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2785  hypothetical protein  74.29 
 
 
325 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0143634  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3087  hypothetical protein  73.98 
 
 
325 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1610  hypothetical protein  73.67 
 
 
325 aa  511  1e-144  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1547  hypothetical protein  72.67 
 
 
325 aa  507  1e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4530  hypothetical protein  73.29 
 
 
325 aa  509  1e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3084  hypothetical protein  73.35 
 
 
325 aa  507  1e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2299  hypothetical protein  73.91 
 
 
325 aa  509  1e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.187044  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0670  hypothetical protein  72.98 
 
 
325 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0115  hypothetical protein  73.29 
 
 
325 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0116  hypothetical protein  72.98 
 
 
325 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3040  hypothetical protein  72.98 
 
 
325 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3447  hypothetical protein  72.98 
 
 
325 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2402  hypothetical protein  73.29 
 
 
325 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.283143  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1241  hypothetical protein  73.29 
 
 
325 aa  504  1e-141  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1510  hypothetical protein  73.67 
 
 
325 aa  503  1e-141  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2555  hypothetical protein  72.98 
 
 
325 aa  503  1e-141  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00750734  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1511  hypothetical protein  73.04 
 
 
325 aa  501  1e-141  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2814  hypothetical protein  72.98 
 
 
325 aa  503  1e-141  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1890  hypothetical protein  72.09 
 
 
325 aa  498  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4547  hypothetical protein  71.74 
 
 
325 aa  498  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3627  hypothetical protein  72.73 
 
 
325 aa  498  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92162  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1546  hypothetical protein  71.12 
 
 
326 aa  495  1e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0957  hypothetical protein  72.41 
 
 
325 aa  496  1e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00250015  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2533  hypothetical protein  73.98 
 
 
326 aa  496  1e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0991372  normal  0.0595118 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3473  hypothetical protein  70.81 
 
 
325 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1264  hypothetical protein  72.1 
 
 
325 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2958  hypothetical protein  71.43 
 
 
325 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4299  hypothetical protein  72.1 
 
 
325 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1378  hypothetical protein  72.41 
 
 
325 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599998 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4749  hypothetical protein  71.79 
 
 
325 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.291957  hitchhiker  0.000564584 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3773  hypothetical protein  71.16 
 
 
325 aa  488  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.149988  hitchhiker  0.00126811 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3681  hypothetical protein  71.25 
 
 
323 aa  491  1e-137  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3323  hypothetical protein  69.35 
 
 
325 aa  490  1e-137  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0606  hypothetical protein  71.79 
 
 
325 aa  486  1e-136  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1812  hypothetical protein  73.14 
 
 
316 aa  484  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2922  hypothetical protein  69.54 
 
 
325 aa  482  1e-135  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2628  hypothetical protein  69.02 
 
 
326 aa  481  1e-135  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1861  hypothetical protein  70.25 
 
 
329 aa  480  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.633128  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2622  hypothetical protein  71.79 
 
 
319 aa  480  1e-134  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0144606  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2414  hypothetical protein  72 
 
 
326 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.196776  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2307  hypothetical protein  67.49 
 
 
326 aa  477  1e-133  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3091  hypothetical protein  67.8 
 
 
326 aa  475  1e-133  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0496594 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4465  hypothetical protein  67.7 
 
 
325 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0052  hypothetical protein  66.56 
 
 
326 aa  469  1.0000000000000001e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.186799 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0200  hypothetical protein  72.41 
 
 
293 aa  448  1e-125  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3356  hypothetical protein  55.66 
 
 
323 aa  384  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.526564  normal  0.864241 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1385  hypothetical protein  56.96 
 
 
327 aa  368  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.868466  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1848  hypothetical protein  56.27 
 
 
327 aa  369  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1948  hypothetical protein  55.35 
 
 
327 aa  366  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.557873  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0907  hypothetical protein  56.65 
 
 
327 aa  363  2e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0248219  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4132  hypothetical protein  54.13 
 
 
327 aa  362  3e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1735  hypothetical protein  54.43 
 
 
327 aa  359  3e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3465  hypothetical protein  54.63 
 
 
325 aa  357  9.999999999999999e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0641119 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0111  hypothetical protein  58.68 
 
 
325 aa  354  1e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3074  CheW protein  58.68 
 
 
325 aa  354  1e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.464984  normal  0.367409 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0333  Type I secretion outer membrane protein, TolC  57.64 
 
 
325 aa  353  2e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0672756 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2393  hypothetical protein  73.99 
 
 
238 aa  350  1e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0597783  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0282  hypothetical protein  53.48 
 
 
325 aa  338  5.9999999999999996e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.822944  hitchhiker  0.00000243422 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0281  hypothetical protein  52.85 
 
 
325 aa  333  2e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000015206 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3017  hypothetical protein  51.1 
 
 
325 aa  333  2e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0296678 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2943  histidine kinase  53.16 
 
 
325 aa  332  4e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0607  hypothetical protein  52.85 
 
 
325 aa  332  5e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1111  hypothetical protein  49.24 
 
 
327 aa  325  6e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0480419  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1856  hypothetical protein  46.5 
 
 
370 aa  311  7.999999999999999e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3041  hypothetical protein  77.78 
 
 
198 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3446  hypothetical protein  77.78 
 
 
198 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2679  hypothetical protein  47.9 
 
 
336 aa  301  7.000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0118762  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1436  protein of unknown function DUF1568  51.54 
 
 
341 aa  294  1e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01831  hypothetical protein  52.96 
 
 
271 aa  291  9e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0856  hypothetical protein  45.43 
 
 
347 aa  291  1e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3659  hypothetical protein  46.2 
 
 
347 aa  291  1e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3682  hypothetical protein  75.14 
 
 
198 aa  289  4e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2840  protein of unknown function DUF1568  45.07 
 
 
345 aa  285  5e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0644633 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02418  hypothetical protein  45.26 
 
 
328 aa  285  8e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2906  hypothetical protein  44.65 
 
 
329 aa  285  8e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2780  hypothetical protein  49.83 
 
 
336 aa  282  6.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000960474  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1697  hypothetical protein  43.45 
 
 
349 aa  278  1e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2933  hypothetical protein  43.92 
 
 
345 aa  276  2e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.161086  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0868  hypothetical protein  43.33 
 
 
344 aa  276  3e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1226  protein of unknown function DUF1568  42.6 
 
 
341 aa  276  3e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.353731  hitchhiker  0.000000017845 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2414  hypothetical protein  43.25 
 
 
341 aa  275  5e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.301389  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0910  hypothetical protein  43.2 
 
 
344 aa  275  9e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1945  protein of unknown function DUF1568  43.25 
 
 
341 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.499337 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3200  hypothetical protein  42.25 
 
 
344 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.789239 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1700  protein of unknown function DUF1568  42.22 
 
 
377 aa  272  5.000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0414346 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1178  hypothetical protein  42.6 
 
 
344 aa  272  6e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0303591  normal  0.0825627 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2403  hypothetical protein  43.12 
 
 
341 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.284659  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2480  hypothetical protein  42.31 
 
 
344 aa  269  4e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1126  hypothetical protein  42.31 
 
 
344 aa  268  7e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.776641  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02306  hypothetical protein  43.21 
 
 
324 aa  267  2e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.334783  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2838  hypothetical protein  67.22 
 
 
186 aa  265  1e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.579373  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0562  hypothetical protein  41.72 
 
 
370 aa  258  1e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0862774 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2324  Elongator protein 3/MiaB/NifB  58.05 
 
 
208 aa  254  2.0000000000000002e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0123865 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>