181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0910 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0910  hypothetical protein  100 
 
 		 344 aa  719    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2480  hypothetical protein  93.02 
 
 		 344 aa  670    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1126  hypothetical protein  94.77 
 
 		 344 aa  688    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.776641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1178  hypothetical protein  95.06 
 
 		 344 aa  691    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0303591  normal  0.0825627 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3200  hypothetical protein  94.19 
 
 		 344 aa  681    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.789239 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2414  hypothetical protein  84.97 
 
 		 341 aa  615  1e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.301389  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2403  hypothetical protein  84.97 
 
 		 341 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.284659  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1945  protein of unknown function DUF1568  84.97 
 
 		 341 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.499337 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1226  protein of unknown function DUF1568  84.39 
 
 		 341 aa  610  1e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.353731  hitchhiker  0.000000017845 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0868  hypothetical protein  83.14 
 
 		 344 aa  608  1e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1697  hypothetical protein  83.72 
 
 		 349 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2840  protein of unknown function DUF1568  82.08 
 
 		 345 aa  592  1e-168  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0644633 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3659  hypothetical protein  77.46 
 
 		 347 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2933  hypothetical protein  75.29 
 
 		 345 aa  556  1e-157  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.161086  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0856  hypothetical protein  73.28 
 
 		 347 aa  547  1e-155  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2906  hypothetical protein  70.35 
 
 		 329 aa  508  1e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3299  hypothetical protein  83.96 
 
 		 213 aa  395  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1856  hypothetical protein  47.4 
 
 		 370 aa  346  3e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1541  hypothetical protein  77.56 
 
 		 209 aa  333  3e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2679  hypothetical protein  48.06 
 
 		 336 aa  311  1e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0118762  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0282  hypothetical protein  48.25 
 
 		 325 aa  306  3e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.822944  hitchhiker  0.00000243422 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0607  hypothetical protein  48.25 
 
 		 325 aa  305  8.000000000000001e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1436  protein of unknown function DUF1568  48.17 
 
 		 341 aa  302  5.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2943  histidine kinase  47.8 
 
 		 325 aa  301  1e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0281  hypothetical protein  47.94 
 
 		 325 aa  299  5e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015206 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3017  hypothetical protein  47.3 
 
 		 325 aa  298  8e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0296678 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1948  hypothetical protein  44.15 
 
 		 327 aa  297  2e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.557873  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3356  hypothetical protein  44.34 
 
 		 323 aa  297  2e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.526564  normal  0.864241 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2628  hypothetical protein  46.13 
 
 		 326 aa  295  6e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3087  hypothetical protein  46.44 
 
 		 325 aa  294  1e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0135  hypothetical protein  47.37 
 
 		 325 aa  294  2e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3074  CheW protein  44.44 
 
 		 325 aa  291  8e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.464984  normal  0.367409 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0111  hypothetical protein  44.13 
 
 		 325 aa  291  9e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2785  hypothetical protein  44.48 
 
 		 325 aa  290  2e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0143634  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3084  hypothetical protein  45.82 
 
 		 325 aa  290  2e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3465  hypothetical protein  45.08 
 
 		 325 aa  290  3e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0641119 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1848  hypothetical protein  43.57 
 
 		 327 aa  290  3e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1610  hypothetical protein  45.51 
 
 		 325 aa  288  7e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2402  hypothetical protein  47.3 
 
 		 325 aa  288  1e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.283143  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0333  Type I secretion outer membrane protein, TolC  44.13 
 
 		 325 aa  287  2e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0672756 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1385  hypothetical protein  43.27 
 
 		 327 aa  287  2e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.868466  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2780  hypothetical protein  44.24 
 
 		 336 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000960474  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1921  hypothetical protein  46.98 
 
 		 325 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3680  hypothetical protein  46.98 
 
 		 325 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4465  hypothetical protein  44.54 
 
 		 325 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0115  hypothetical protein  46.23 
 
 		 325 aa  286  4e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1241  hypothetical protein  46.23 
 
 		 325 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0907  hypothetical protein  43.27 
 
 		 327 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0248219  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1735  hypothetical protein  43.27 
 
 		 327 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1890  hypothetical protein  46.67 
 
 		 325 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4132  hypothetical protein  42.4 
 
 		 327 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1264  hypothetical protein  47.3 
 
 		 325 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1546  hypothetical protein  46.54 
 
 		 326 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2555  hypothetical protein  45.82 
 
 		 325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00750734  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4530  hypothetical protein  45.91 
 
 		 325 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0670  hypothetical protein  46.13 
 
 		 325 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0116  hypothetical protein  46.35 
 
 		 325 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0957  hypothetical protein  46.98 
 
 		 325 aa  281  8.000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00250015  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3473  hypothetical protein  46.03 
 
 		 325 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0606  hypothetical protein  44.54 
 
 		 325 aa  280  2e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1510  hypothetical protein  45.6 
 
 		 325 aa  280  3e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3040  hypothetical protein  46.03 
 
 		 325 aa  280  3e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3447  hypothetical protein  46.03 
 
 		 325 aa  280  3e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2392  hypothetical protein  44.89 
 
 		 325 aa  280  3e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.134929  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2958  hypothetical protein  44.27 
 
 		 325 aa  279  5e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4299  hypothetical protein  43.07 
 
 		 325 aa  279  5e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2622  hypothetical protein  46.01 
 
 		 319 aa  279  5e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0144606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1812  hypothetical protein  45.51 
 
 		 316 aa  278  7e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1547  hypothetical protein  45.6 
 
 		 325 aa  278  1e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2922  hypothetical protein  44.65 
 
 		 325 aa  278  1e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1948  hypothetical protein  44.89 
 
 		 326 aa  278  1e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.270103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3681  hypothetical protein  43.25 
 
 		 323 aa  277  1e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1378  hypothetical protein  43.65 
 
 		 325 aa  277  2e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000599998 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2299  hypothetical protein  46.03 
 
 		 325 aa  277  2e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.187044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1511  hypothetical protein  42.69 
 
 		 325 aa  277  2e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2307  hypothetical protein  45.54 
 
 		 326 aa  277  2e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4547  hypothetical protein  45.4 
 
 		 325 aa  276  3e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1111  hypothetical protein  41.23 
 
 		 327 aa  276  5e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0480419  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3091  hypothetical protein  43.02 
 
 		 326 aa  275  8e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0496594 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2814  hypothetical protein  45.71 
 
 		 325 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0196  hypothetical protein  43.2 
 
 		 326 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.157282 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1700  protein of unknown function DUF1568  38.2 
 
 		 377 aa  273  3e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0414346 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3773  hypothetical protein  43.65 
 
 		 325 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.149988  hitchhiker  0.00126811 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0562  hypothetical protein  41.52 
 
 		 370 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0862774 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0052  hypothetical protein  43.02 
 
 		 326 aa  272  5.000000000000001e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.186799 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2653  hypothetical protein  42.9 
 
 		 326 aa  271  1e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3627  hypothetical protein  42.48 
 
 		 325 aa  271  1e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1861  hypothetical protein  45.45 
 
 		 329 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.633128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4749  hypothetical protein  41.59 
 
 		 325 aa  265  8e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.291957  hitchhiker  0.000564584 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2533  hypothetical protein  43.65 
 
 		 326 aa  263  4e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0991372  normal  0.0595118 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3323  hypothetical protein  40.06 
 
 		 325 aa  259  3e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1542  hypothetical protein  85.4 
 
 		 139 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2414  hypothetical protein  43.34 
 
 		 326 aa  246  6e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.196776  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0200  hypothetical protein  44.1 
 
 		 293 aa  243  3e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02306  hypothetical protein  39.88 
 
 		 324 aa  238  8e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.334783  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2324  Elongator protein 3/MiaB/NifB  53.37 
 
 		 208 aa  231  1e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0123865 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02418  hypothetical protein  38.94 
 
 		 328 aa  228  1e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01831  hypothetical protein  42.97 
 
 		 271 aa  218  1e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3682  hypothetical protein  53.85 
 
 		 198 aa  210  3e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3041  hypothetical protein  51.67 
 
 		 198 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>