174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1111 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1111  hypothetical protein  100 
 
 		 327 aa  689    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0480419  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1948  hypothetical protein  77.06 
 
 		 327 aa  553  1e-156  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.557873  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1385  hypothetical protein  75.84 
 
 		 327 aa  544  1e-154  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.868466  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4132  hypothetical protein  76.15 
 
 		 327 aa  544  1e-154  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1735  hypothetical protein  76.45 
 
 		 327 aa  542  1e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1848  hypothetical protein  76.15 
 
 		 327 aa  542  1e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0907  hypothetical protein  74.01 
 
 		 327 aa  530  1e-149  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0248219  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3356  hypothetical protein  55.41 
 
 		 323 aa  364  1e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.526564  normal  0.864241 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3074  CheW protein  51.54 
 
 		 325 aa  353  2e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.464984  normal  0.367409 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0282  hypothetical protein  52.16 
 
 		 325 aa  352  5.9999999999999994e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.822944  hitchhiker  0.00000243422 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0607  hypothetical protein  52.47 
 
 		 325 aa  350  2e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2943  histidine kinase  52.47 
 
 		 325 aa  349  4e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3465  hypothetical protein  50.93 
 
 		 325 aa  349  5e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0641119 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0111  hypothetical protein  50.62 
 
 		 325 aa  348  6e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0281  hypothetical protein  52.16 
 
 		 325 aa  348  6e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015206 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0333  Type I secretion outer membrane protein, TolC  50.93 
 
 		 325 aa  345  8e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0672756 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3017  hypothetical protein  50.31 
 
 		 325 aa  345  8.999999999999999e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0296678 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1610  hypothetical protein  52.08 
 
 		 325 aa  344  1e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0135  hypothetical protein  52.4 
 
 		 325 aa  342  4e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3087  hypothetical protein  51.12 
 
 		 325 aa  340  1e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3084  hypothetical protein  51.76 
 
 		 325 aa  340  2e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2402  hypothetical protein  53.35 
 
 		 325 aa  340  2e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.283143  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0052  hypothetical protein  51.23 
 
 		 326 aa  339  4e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.186799 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3091  hypothetical protein  50.46 
 
 		 326 aa  339  4e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0496594 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2785  hypothetical protein  51.12 
 
 		 325 aa  338  5.9999999999999996e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0143634  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1890  hypothetical protein  51.44 
 
 		 325 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2299  hypothetical protein  53.35 
 
 		 325 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.187044  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4547  hypothetical protein  51.76 
 
 		 325 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1921  hypothetical protein  51.44 
 
 		 325 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3680  hypothetical protein  51.44 
 
 		 325 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2307  hypothetical protein  51.54 
 
 		 326 aa  336  3.9999999999999995e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0116  hypothetical protein  52.4 
 
 		 325 aa  335  5e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02418  hypothetical protein  51.23 
 
 		 328 aa  335  5e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1510  hypothetical protein  52.72 
 
 		 325 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2392  hypothetical protein  50.48 
 
 		 325 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.134929  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0670  hypothetical protein  51.76 
 
 		 325 aa  334  1e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1948  hypothetical protein  49.24 
 
 		 326 aa  334  1e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.270103  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1547  hypothetical protein  51.76 
 
 		 325 aa  333  2e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2555  hypothetical protein  52.08 
 
 		 325 aa  333  2e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00750734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2814  hypothetical protein  53.35 
 
 		 325 aa  334  2e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3040  hypothetical protein  52.4 
 
 		 325 aa  333  3e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3447  hypothetical protein  52.4 
 
 		 325 aa  333  3e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3323  hypothetical protein  52.08 
 
 		 325 aa  333  3e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0115  hypothetical protein  52.08 
 
 		 325 aa  332  4e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1264  hypothetical protein  50.8 
 
 		 325 aa  333  4e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0606  hypothetical protein  51.76 
 
 		 325 aa  332  8e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1812  hypothetical protein  51.95 
 
 		 316 aa  331  9e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0957  hypothetical protein  50.8 
 
 		 325 aa  330  1e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00250015  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1241  hypothetical protein  52.4 
 
 		 325 aa  330  2e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4530  hypothetical protein  51.44 
 
 		 325 aa  330  2e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1511  hypothetical protein  52.08 
 
 		 325 aa  330  2e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1546  hypothetical protein  50.8 
 
 		 326 aa  330  3e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3473  hypothetical protein  50.48 
 
 		 325 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3681  hypothetical protein  50.8 
 
 		 323 aa  326  3e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0196  hypothetical protein  49.24 
 
 		 326 aa  325  6e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.157282 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2653  hypothetical protein  50.32 
 
 		 326 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2628  hypothetical protein  49.07 
 
 		 326 aa  324  1e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2533  hypothetical protein  51.44 
 
 		 326 aa  322  5e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0991372  normal  0.0595118 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4465  hypothetical protein  48.88 
 
 		 325 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2922  hypothetical protein  49.2 
 
 		 325 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2958  hypothetical protein  49.2 
 
 		 325 aa  317  2e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2622  hypothetical protein  51.67 
 
 		 319 aa  315  5e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0144606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1378  hypothetical protein  48.88 
 
 		 325 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000599998 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3773  hypothetical protein  48.56 
 
 		 325 aa  311  1e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.149988  hitchhiker  0.00126811 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1861  hypothetical protein  49.53 
 
 		 329 aa  310  2e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.633128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4299  hypothetical protein  47.6 
 
 		 325 aa  309  5e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2414  hypothetical protein  51.76 
 
 		 326 aa  305  7e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.196776  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3627  hypothetical protein  47.28 
 
 		 325 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4749  hypothetical protein  46.96 
 
 		 325 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.291957  hitchhiker  0.000564584 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1856  hypothetical protein  41.32 
 
 		 370 aa  298  1e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2679  hypothetical protein  46.43 
 
 		 336 aa  293  4e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0118762  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0200  hypothetical protein  50 
 
 		 293 aa  288  1e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01831  hypothetical protein  52.03 
 
 		 271 aa  283  4.0000000000000003e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1697  hypothetical protein  41.72 
 
 		 349 aa  278  7e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2403  hypothetical protein  42.18 
 
 		 341 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.284659  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02306  hypothetical protein  46.43 
 
 		 324 aa  277  2e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.334783  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2414  hypothetical protein  41.89 
 
 		 341 aa  276  2e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.301389  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0910  hypothetical protein  41.23 
 
 		 344 aa  276  4e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1436  protein of unknown function DUF1568  42.6 
 
 		 341 aa  275  8e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2840  protein of unknown function DUF1568  42.6 
 
 		 345 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0644633 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3659  hypothetical protein  42.51 
 
 		 347 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3200  hypothetical protein  41.52 
 
 		 344 aa  272  4.0000000000000004e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.789239 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0868  hypothetical protein  41.52 
 
 		 344 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1226  protein of unknown function DUF1568  42.18 
 
 		 341 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.353731  hitchhiker  0.000000017845 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0856  hypothetical protein  40.82 
 
 		 347 aa  271  8.000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1945  protein of unknown function DUF1568  41.3 
 
 		 341 aa  271  9e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.499337 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0562  hypothetical protein  39.73 
 
 		 370 aa  271  9e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0862774 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1178  hypothetical protein  40.94 
 
 		 344 aa  270  2e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0303591  normal  0.0825627 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1126  hypothetical protein  40.64 
 
 		 344 aa  267  2e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.776641  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2480  hypothetical protein  40.64 
 
 		 344 aa  266  4e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2324  Elongator protein 3/MiaB/NifB  61.46 
 
 		 208 aa  266  4e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0123865 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2933  hypothetical protein  40.3 
 
 		 345 aa  265  7e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.161086  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2906  hypothetical protein  41.69 
 
 		 329 aa  265  1e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2780  hypothetical protein  41.87 
 
 		 336 aa  255  8e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000960474  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1700  protein of unknown function DUF1568  37.43 
 
 		 377 aa  248  1e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0414346 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3299  hypothetical protein  54.55 
 
 		 213 aa  241  9e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3041  hypothetical protein  60 
 
 		 198 aa  231  1e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3446  hypothetical protein  60 
 
 		 198 aa  231  1e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1890  hypothetical protein  70.07 
 
 		 147 aa  226  6e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0896786  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3682  hypothetical protein  56.04 
 
 		 198 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>