107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1890 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1890  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  310  2.9999999999999996e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0896786  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4132  hypothetical protein  95.24 
 
 		 327 aa  302  9.000000000000001e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1385  hypothetical protein  94.56 
 
 		 327 aa  300  6.000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.868466  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1735  hypothetical protein  94.56 
 
 		 327 aa  299  1e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1902  hypothetical protein  94.56 
 
 		 147 aa  292  1e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.266524  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1948  hypothetical protein  89.12 
 
 		 327 aa  287  3e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.557873  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1848  hypothetical protein  89.8 
 
 		 327 aa  283  8e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0907  hypothetical protein  88.44 
 
 		 327 aa  279  8.000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0248219  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0882  hypothetical protein  76.03 
 
 		 153 aa  237  2.9999999999999997e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1111  hypothetical protein  70.07 
 
 		 327 aa  226  1e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0480419  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3074  CheW protein  53.47 
 
 		 325 aa  159  8.000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.464984  normal  0.367409 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0111  hypothetical protein  52.08 
 
 		 325 aa  157  4e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3465  hypothetical protein  52.08 
 
 		 325 aa  157  4e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0641119 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3017  hypothetical protein  50.69 
 
 		 325 aa  153  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0296678 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0282  hypothetical protein  49.31 
 
 		 325 aa  149  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.822944  hitchhiker  0.00000243422 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0333  Type I secretion outer membrane protein, TolC  50 
 
 		 325 aa  147  4e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0672756 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0196  hypothetical protein  51.02 
 
 		 326 aa  147  5e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.157282 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0281  hypothetical protein  49.31 
 
 		 325 aa  145  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015206 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2943  histidine kinase  48.61 
 
 		 325 aa  144  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2653  hypothetical protein  51.39 
 
 		 326 aa  144  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0607  hypothetical protein  48.61 
 
 		 325 aa  144  4.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01831  hypothetical protein  50 
 
 		 271 aa  144  4.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1948  hypothetical protein  48.3 
 
 		 326 aa  142  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.270103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0135  hypothetical protein  54.14 
 
 		 325 aa  141  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0200  hypothetical protein  54.14 
 
 		 293 aa  141  3e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1921  hypothetical protein  54.14 
 
 		 325 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2393  hypothetical protein  52.63 
 
 		 238 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0597783  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3680  hypothetical protein  54.14 
 
 		 325 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3356  hypothetical protein  50.38 
 
 		 323 aa  138  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.526564  normal  0.864241 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2392  hypothetical protein  52.63 
 
 		 325 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.134929  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1890  hypothetical protein  52.63 
 
 		 325 aa  136  8.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0116  hypothetical protein  51.13 
 
 		 325 aa  134  5e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0052  hypothetical protein  48.61 
 
 		 326 aa  133  7.000000000000001e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.186799 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1610  hypothetical protein  52.24 
 
 		 325 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3084  hypothetical protein  52.24 
 
 		 325 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3087  hypothetical protein  51.49 
 
 		 325 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0115  hypothetical protein  51.13 
 
 		 325 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2299  hypothetical protein  51.88 
 
 		 325 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.187044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2555  hypothetical protein  51.13 
 
 		 325 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00750734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2402  hypothetical protein  51.88 
 
 		 325 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.283143  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2814  hypothetical protein  52.63 
 
 		 325 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0957  hypothetical protein  51.13 
 
 		 325 aa  131  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00250015  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3040  hypothetical protein  50.38 
 
 		 325 aa  130  3.9999999999999996e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3447  hypothetical protein  50.38 
 
 		 325 aa  130  3.9999999999999996e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3323  hypothetical protein  48.87 
 
 		 325 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3091  hypothetical protein  46.9 
 
 		 326 aa  131  3.9999999999999996e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0496594 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4547  hypothetical protein  51.13 
 
 		 325 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1264  hypothetical protein  50.38 
 
 		 325 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3113  hypothetical protein  50.38 
 
 		 207 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4749  hypothetical protein  49.62 
 
 		 325 aa  130  9e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.291957  hitchhiker  0.000564584 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2785  hypothetical protein  48.87 
 
 		 325 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0143634  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2307  hypothetical protein  47.22 
 
 		 326 aa  129  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0499  hypothetical protein  48.87 
 
 		 186 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4530  hypothetical protein  49.62 
 
 		 325 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2622  hypothetical protein  50.38 
 
 		 319 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0144606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0670  hypothetical protein  50.38 
 
 		 325 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2628  hypothetical protein  48.53 
 
 		 326 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2958  hypothetical protein  48.87 
 
 		 325 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3627  hypothetical protein  48.87 
 
 		 325 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92162  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1241  hypothetical protein  50.38 
 
 		 325 aa  128  3e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1378  hypothetical protein  48.87 
 
 		 325 aa  128  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000599998 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1812  hypothetical protein  51.56 
 
 		 316 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4465  hypothetical protein  48.87 
 
 		 325 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1547  hypothetical protein  48.87 
 
 		 325 aa  127  6e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1511  hypothetical protein  48.87 
 
 		 325 aa  127  6e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3473  hypothetical protein  50.38 
 
 		 325 aa  127  6e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0606  hypothetical protein  50.38 
 
 		 325 aa  127  6e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1861  hypothetical protein  50.38 
 
 		 329 aa  127  6e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.633128  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1510  hypothetical protein  49.62 
 
 		 325 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4299  hypothetical protein  48.12 
 
 		 325 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3773  hypothetical protein  48.12 
 
 		 325 aa  125  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.149988  hitchhiker  0.00126811 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1546  hypothetical protein  47.37 
 
 		 326 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2922  hypothetical protein  44.44 
 
 		 325 aa  120  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2838  hypothetical protein  45.86 
 
 		 186 aa  118  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.579373  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3681  hypothetical protein  45.86 
 
 		 323 aa  118  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2679  hypothetical protein  47.66 
 
 		 336 aa  108  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0118762  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2414  hypothetical protein  41.67 
 
 		 326 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.196776  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2533  hypothetical protein  44.36 
 
 		 326 aa  106  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0991372  normal  0.0595118 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1856  hypothetical protein  32.24 
 
 		 370 aa  102  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2325  molybdopterin binding domain-containing protein  43.43 
 
 		 100 aa  94.7  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0107016 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2906  hypothetical protein  37.41 
 
 		 329 aa  93.6  7e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2933  hypothetical protein  34.78 
 
 		 345 aa  94  7e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.161086  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1945  protein of unknown function DUF1568  34.59 
 
 		 341 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.499337 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2414  hypothetical protein  34.59 
 
 		 341 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.301389  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2403  hypothetical protein  33.96 
 
 		 341 aa  92  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.284659  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2840  protein of unknown function DUF1568  34.81 
 
 		 345 aa  92  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0644633 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1697  hypothetical protein  33.54 
 
 		 349 aa  90.9  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1541  hypothetical protein  32.92 
 
 		 209 aa  90.9  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0868  hypothetical protein  33.33 
 
 		 344 aa  90.5  6e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1126  hypothetical protein  34.57 
 
 		 344 aa  90.5  7e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.776641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1178  hypothetical protein  34.57 
 
 		 344 aa  90.5  7e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0303591  normal  0.0825627 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0910  hypothetical protein  33.95 
 
 		 344 aa  88.6  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1226  protein of unknown function DUF1568  33.96 
 
 		 341 aa  88.2  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.353731  hitchhiker  0.000000017845 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0856  hypothetical protein  33.13 
 
 		 347 aa  88.6  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1436  protein of unknown function DUF1568  43.24 
 
 		 341 aa  87.4  6e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3200  hypothetical protein  33.33 
 
 		 344 aa  87  7e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.789239 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3659  hypothetical protein  34.01 
 
 		 347 aa  86.3  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2480  hypothetical protein  32.52 
 
 		 344 aa  84.7  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1700  protein of unknown function DUF1568  32.39 
 
 		 377 aa  80.1  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0414346 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0562  hypothetical protein  28.02 
 
 		 370 aa  76.6  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0862774 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>