103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2325 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2325  molybdopterin binding domain-containing protein  100 
 
 		 100 aa  204  5e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0107016 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0607  hypothetical protein  94 
 
 		 325 aa  200  5e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0282  hypothetical protein  95 
 
 		 325 aa  200  7e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.822944  hitchhiker  0.00000243422 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0281  hypothetical protein  94.9 
 
 		 325 aa  198  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015206 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2943  histidine kinase  91 
 
 		 325 aa  194  4.0000000000000005e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3074  CheW protein  76.77 
 
 		 325 aa  167  4e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.464984  normal  0.367409 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3465  hypothetical protein  76.77 
 
 		 325 aa  166  9e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0641119 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0111  hypothetical protein  76.77 
 
 		 325 aa  164  5e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0333  Type I secretion outer membrane protein, TolC  70.71 
 
 		 325 aa  152  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0672756 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3017  hypothetical protein  67.68 
 
 		 325 aa  151  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0296678 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3356  hypothetical protein  54.44 
 
 		 323 aa  102  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.526564  normal  0.864241 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1890  hypothetical protein  43.43 
 
 		 147 aa  94.7  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0896786  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4132  hypothetical protein  44.44 
 
 		 327 aa  92.8  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1385  hypothetical protein  43 
 
 		 327 aa  92.4  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.868466  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1735  hypothetical protein  44.44 
 
 		 327 aa  92.4  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1848  hypothetical protein  44.44 
 
 		 327 aa  91.7  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1948  hypothetical protein  43.43 
 
 		 327 aa  90.5  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.557873  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0907  hypothetical protein  43.43 
 
 		 327 aa  90.5  7e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0248219  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1902  hypothetical protein  40.4 
 
 		 147 aa  86.3  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.266524  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01831  hypothetical protein  45.56 
 
 		 271 aa  82.4  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0882  hypothetical protein  37.37 
 
 		 153 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2393  hypothetical protein  42.86 
 
 		 238 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0597783  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1861  hypothetical protein  56.92 
 
 		 329 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.633128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0856  hypothetical protein  44.74 
 
 		 347 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2392  hypothetical protein  55.38 
 
 		 325 aa  77  0.00000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.134929  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2958  hypothetical protein  43.18 
 
 		 325 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0135  hypothetical protein  55.38 
 
 		 325 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0200  hypothetical protein  40.82 
 
 		 293 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1921  hypothetical protein  55.38 
 
 		 325 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3680  hypothetical protein  55.38 
 
 		 325 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0910  hypothetical protein  50 
 
 		 344 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1111  hypothetical protein  36.36 
 
 		 327 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0480419  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2555  hypothetical protein  45.45 
 
 		 325 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00750734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1126  hypothetical protein  50 
 
 		 344 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.776641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1178  hypothetical protein  50 
 
 		 344 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0303591  normal  0.0825627 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0670  hypothetical protein  45.45 
 
 		 325 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3200  hypothetical protein  48.39 
 
 		 344 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.789239 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1945  protein of unknown function DUF1568  48.39 
 
 		 341 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.499337 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2414  hypothetical protein  48.39 
 
 		 341 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.301389  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1890  hypothetical protein  53.85 
 
 		 325 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2403  hypothetical protein  48.39 
 
 		 341 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.284659  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3113  hypothetical protein  55.56 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3659  hypothetical protein  40.79 
 
 		 347 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1226  protein of unknown function DUF1568  48.39 
 
 		 341 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.353731  hitchhiker  0.000000017845 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1697  hypothetical protein  46.27 
 
 		 349 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0868  hypothetical protein  45.07 
 
 		 344 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1547  hypothetical protein  53.85 
 
 		 325 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2906  hypothetical protein  46.27 
 
 		 329 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1812  hypothetical protein  46.43 
 
 		 316 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1378  hypothetical protein  42.05 
 
 		 325 aa  72  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000599998 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3627  hypothetical protein  53.97 
 
 		 325 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3087  hypothetical protein  43.18 
 
 		 325 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3473  hypothetical protein  53.97 
 
 		 325 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2628  hypothetical protein  42.86 
 
 		 326 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4749  hypothetical protein  53.97 
 
 		 325 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.291957  hitchhiker  0.000564584 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2622  hypothetical protein  43.18 
 
 		 319 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0144606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2840  protein of unknown function DUF1568  46.27 
 
 		 345 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0644633 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1436  protein of unknown function DUF1568  39.58 
 
 		 341 aa  70.5  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3040  hypothetical protein  53.85 
 
 		 325 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3447  hypothetical protein  53.85 
 
 		 325 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1541  hypothetical protein  46.27 
 
 		 209 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2653  hypothetical protein  55.56 
 
 		 326 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4299  hypothetical protein  52.38 
 
 		 325 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2480  hypothetical protein  46.77 
 
 		 344 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2402  hypothetical protein  53.85 
 
 		 325 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.283143  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0499  hypothetical protein  50.77 
 
 		 186 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3084  hypothetical protein  44.05 
 
 		 325 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3323  hypothetical protein  44.32 
 
 		 325 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1856  hypothetical protein  40.23 
 
 		 370 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1610  hypothetical protein  40.91 
 
 		 325 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1948  hypothetical protein  40.66 
 
 		 326 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.270103  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4547  hypothetical protein  52.31 
 
 		 325 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0196  hypothetical protein  53.97 
 
 		 326 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.157282 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3773  hypothetical protein  39.77 
 
 		 325 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.149988  hitchhiker  0.00126811 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0957  hypothetical protein  49.23 
 
 		 325 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00250015  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2933  hypothetical protein  43.28 
 
 		 345 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.161086  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4465  hypothetical protein  39.77 
 
 		 325 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2814  hypothetical protein  50.77 
 
 		 325 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3091  hypothetical protein  40.66 
 
 		 326 aa  67.8  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0496594 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2838  hypothetical protein  46.15 
 
 		 186 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.579373  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1241  hypothetical protein  52.31 
 
 		 325 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0115  hypothetical protein  52.31 
 
 		 325 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0606  hypothetical protein  50.77 
 
 		 325 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1510  hypothetical protein  52.31 
 
 		 325 aa  67  0.00000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2299  hypothetical protein  52.31 
 
 		 325 aa  67  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.187044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2307  hypothetical protein  40.66 
 
 		 326 aa  66.6  0.00000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0116  hypothetical protein  50.77 
 
 		 325 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4530  hypothetical protein  57.89 
 
 		 325 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1264  hypothetical protein  47.69 
 
 		 325 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2922  hypothetical protein  39.77 
 
 		 325 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1546  hypothetical protein  49.23 
 
 		 326 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2785  hypothetical protein  40.91 
 
 		 325 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0143634  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0052  hypothetical protein  41.67 
 
 		 326 aa  65.1  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.186799 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1511  hypothetical protein  47.69 
 
 		 325 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3681  hypothetical protein  38.64 
 
 		 323 aa  60.8  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2679  hypothetical protein  50 
 
 		 336 aa  60.1  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0118762  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2414  hypothetical protein  42.86 
 
 		 326 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.196776  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2533  hypothetical protein  42.05 
 
 		 326 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0991372  normal  0.0595118 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2780  hypothetical protein  56.82 
 
 		 336 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000960474  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0562  hypothetical protein  29.9 
 
 		 370 aa  53.9  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0862774 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>