178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0200 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0200  hypothetical protein  100 
 
 		 293 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0957  hypothetical protein  87.24 
 
 		 325 aa  530  1e-150  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00250015  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1890  hypothetical protein  86.41 
 
 		 325 aa  528  1e-149  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1264  hypothetical protein  86.21 
 
 		 325 aa  525  1e-148  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3040  hypothetical protein  85.17 
 
 		 325 aa  525  1e-148  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3447  hypothetical protein  85.17 
 
 		 325 aa  525  1e-148  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0135  hypothetical protein  84.83 
 
 		 325 aa  524  1e-148  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0670  hypothetical protein  85.17 
 
 		 325 aa  521  1e-147  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2299  hypothetical protein  86.06 
 
 		 325 aa  520  1e-147  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.187044  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1510  hypothetical protein  85.37 
 
 		 325 aa  517  1e-146  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2402  hypothetical protein  85.37 
 
 		 325 aa  518  1e-146  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.283143  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2622  hypothetical protein  85.37 
 
 		 319 aa  520  1e-146  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0144606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2814  hypothetical protein  85.02 
 
 		 325 aa  518  1e-146  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0115  hypothetical protein  84.32 
 
 		 325 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1546  hypothetical protein  83.79 
 
 		 326 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4530  hypothetical protein  83.45 
 
 		 325 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4547  hypothetical protein  84.14 
 
 		 325 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2555  hypothetical protein  83.79 
 
 		 325 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00750734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1511  hypothetical protein  83.45 
 
 		 325 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3473  hypothetical protein  83.79 
 
 		 325 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0606  hypothetical protein  85.52 
 
 		 325 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0116  hypothetical protein  84.32 
 
 		 325 aa  511  1e-144  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1241  hypothetical protein  84.67 
 
 		 325 aa  511  1e-144  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1547  hypothetical protein  83.62 
 
 		 325 aa  513  1e-144  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1921  hypothetical protein  83.04 
 
 		 325 aa  509  1e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3680  hypothetical protein  83.04 
 
 		 325 aa  509  1e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1861  hypothetical protein  83.33 
 
 		 329 aa  502  1e-141  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.633128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2392  hypothetical protein  81.66 
 
 		 325 aa  503  1e-141  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.134929  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1812  hypothetical protein  86.13 
 
 		 316 aa  496  1e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1378  hypothetical protein  75.78 
 
 		 325 aa  474  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000599998 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4299  hypothetical protein  75.96 
 
 		 325 aa  477  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2958  hypothetical protein  76.47 
 
 		 325 aa  477  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3627  hypothetical protein  75.61 
 
 		 325 aa  474  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4749  hypothetical protein  75.61 
 
 		 325 aa  474  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.291957  hitchhiker  0.000564584 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3773  hypothetical protein  74.39 
 
 		 325 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.149988  hitchhiker  0.00126811 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2922  hypothetical protein  73.45 
 
 		 325 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3681  hypothetical protein  75.61 
 
 		 323 aa  462  1e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4465  hypothetical protein  73.01 
 
 		 325 aa  464  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2653  hypothetical protein  73.79 
 
 		 326 aa  456  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3087  hypothetical protein  72.41 
 
 		 325 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0196  hypothetical protein  72.41 
 
 		 326 aa  448  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.157282 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2785  hypothetical protein  71.72 
 
 		 325 aa  447  1e-125  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0143634  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1948  hypothetical protein  71.72 
 
 		 326 aa  449  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.270103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1610  hypothetical protein  72.07 
 
 		 325 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2393  hypothetical protein  92.14 
 
 		 238 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0597783  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3084  hypothetical protein  71.38 
 
 		 325 aa  442  1e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2533  hypothetical protein  74.14 
 
 		 326 aa  434  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0991372  normal  0.0595118 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2414  hypothetical protein  72.76 
 
 		 326 aa  411  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.196776  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3323  hypothetical protein  65.62 
 
 		 325 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0052  hypothetical protein  65.26 
 
 		 326 aa  402  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.186799 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2628  hypothetical protein  65.85 
 
 		 326 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2307  hypothetical protein  64.14 
 
 		 326 aa  400  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3091  hypothetical protein  65.26 
 
 		 326 aa  400  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0496594 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3356  hypothetical protein  55.04 
 
 		 323 aa  330  2e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.526564  normal  0.864241 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1735  hypothetical protein  56.83 
 
 		 327 aa  329  4e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1848  hypothetical protein  56.79 
 
 		 327 aa  323  2e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1948  hypothetical protein  56.83 
 
 		 327 aa  323  2e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.557873  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1385  hypothetical protein  56.12 
 
 		 327 aa  322  6e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.868466  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0907  hypothetical protein  56.47 
 
 		 327 aa  319  3e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0248219  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4132  hypothetical protein  55.04 
 
 		 327 aa  318  5e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2838  hypothetical protein  76.88 
 
 		 186 aa  310  1e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.579373  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0499  hypothetical protein  82.46 
 
 		 186 aa  301  6.000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3074  CheW protein  56.52 
 
 		 325 aa  301  6.000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.464984  normal  0.367409 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3465  hypothetical protein  56.92 
 
 		 325 aa  300  2e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0641119 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0111  hypothetical protein  55.73 
 
 		 325 aa  297  1e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0333  Type I secretion outer membrane protein, TolC  54.15 
 
 		 325 aa  292  3e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0672756 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1111  hypothetical protein  50 
 
 		 327 aa  288  8e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0480419  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0282  hypothetical protein  54.51 
 
 		 325 aa  281  6.000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.822944  hitchhiker  0.00000243422 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0281  hypothetical protein  54.12 
 
 		 325 aa  279  4e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015206 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2943  histidine kinase  50.72 
 
 		 325 aa  275  5e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0607  hypothetical protein  53.73 
 
 		 325 aa  274  1.0000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01831  hypothetical protein  51.13 
 
 		 271 aa  274  1.0000000000000001e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3682  hypothetical protein  74.12 
 
 		 198 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3017  hypothetical protein  52.17 
 
 		 325 aa  273  4.0000000000000004e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0296678 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3041  hypothetical protein  86.9 
 
 		 198 aa  271  1e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3446  hypothetical protein  86.9 
 
 		 198 aa  271  1e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3113  hypothetical protein  81.53 
 
 		 207 aa  270  2e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1856  hypothetical protein  45.37 
 
 		 370 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2679  hypothetical protein  49.81 
 
 		 336 aa  264  1e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0118762  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1436  protein of unknown function DUF1568  51.16 
 
 		 341 aa  257  2e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2906  hypothetical protein  49.81 
 
 		 329 aa  256  3e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0856  hypothetical protein  46.62 
 
 		 347 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2780  hypothetical protein  50.79 
 
 		 336 aa  251  1e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000960474  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3659  hypothetical protein  44.64 
 
 		 347 aa  250  3e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3200  hypothetical protein  43.75 
 
 		 344 aa  249  3e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.789239 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2840  protein of unknown function DUF1568  44.21 
 
 		 345 aa  246  2e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0644633 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2414  hypothetical protein  43.86 
 
 		 341 aa  246  2e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.301389  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1697  hypothetical protein  44.56 
 
 		 349 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0868  hypothetical protein  43.06 
 
 		 344 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1945  protein of unknown function DUF1568  43.86 
 
 		 341 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.499337 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0910  hypothetical protein  44.1 
 
 		 344 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1178  hypothetical protein  43.4 
 
 		 344 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0303591  normal  0.0825627 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0562  hypothetical protein  44.08 
 
 		 370 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0862774 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2480  hypothetical protein  43.4 
 
 		 344 aa  243  3e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1700  protein of unknown function DUF1568  43.33 
 
 		 377 aa  243  3e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0414346 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1226  protein of unknown function DUF1568  43.51 
 
 		 341 aa  242  5e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.353731  hitchhiker  0.000000017845 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2403  hypothetical protein  43.51 
 
 		 341 aa  241  7.999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.284659  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2933  hypothetical protein  42.52 
 
 		 345 aa  241  1e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.161086  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1126  hypothetical protein  43.06 
 
 		 344 aa  240  2e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.776641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02418  hypothetical protein  41.94 
 
 		 328 aa  235  7e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>