174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01831 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_01831  hypothetical protein  100 
 
 
271 aa  572  1.0000000000000001e-162  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0907  hypothetical protein  56.09 
 
 
327 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0248219  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3356  hypothetical protein  56.23 
 
 
323 aa  310  2e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.526564  normal  0.864241 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1848  hypothetical protein  55.72 
 
 
327 aa  310  2e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1735  hypothetical protein  54.98 
 
 
327 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1948  hypothetical protein  54.61 
 
 
327 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.557873  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1385  hypothetical protein  54.61 
 
 
327 aa  306  3e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.868466  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3465  hypothetical protein  62.3 
 
 
325 aa  305  7e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0641119 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0333  Type I secretion outer membrane protein, TolC  56.62 
 
 
325 aa  303  2.0000000000000002e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0672756 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0607  hypothetical protein  57.41 
 
 
325 aa  302  4.0000000000000003e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0111  hypothetical protein  61.07 
 
 
325 aa  301  6.000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0282  hypothetical protein  56.27 
 
 
325 aa  301  8.000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.822944  hitchhiker  0.00000243422 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3074  CheW protein  61.48 
 
 
325 aa  301  8.000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.464984  normal  0.367409 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4132  hypothetical protein  53.14 
 
 
327 aa  300  2e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0281  hypothetical protein  56.27 
 
 
325 aa  297  1e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000015206 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2943  histidine kinase  55.89 
 
 
325 aa  296  3e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3323  hypothetical protein  54.44 
 
 
325 aa  295  8e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2653  hypothetical protein  53.33 
 
 
326 aa  292  4e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0196  hypothetical protein  52.96 
 
 
326 aa  291  6e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.157282 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2307  hypothetical protein  52.22 
 
 
326 aa  289  3e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0052  hypothetical protein  52.22 
 
 
326 aa  288  8e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.186799 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3091  hypothetical protein  51.85 
 
 
326 aa  286  2e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0496594 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3017  hypothetical protein  57.03 
 
 
325 aa  285  5.999999999999999e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0296678 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0135  hypothetical protein  52.51 
 
 
325 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1111  hypothetical protein  52.03 
 
 
327 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0480419  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1948  hypothetical protein  52.11 
 
 
326 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.270103  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1921  hypothetical protein  52.63 
 
 
325 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3680  hypothetical protein  52.63 
 
 
325 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2958  hypothetical protein  51.74 
 
 
325 aa  280  1e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2392  hypothetical protein  52.51 
 
 
325 aa  280  2e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.134929  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3627  hypothetical protein  51.13 
 
 
325 aa  280  3e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92162  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1378  hypothetical protein  51.74 
 
 
325 aa  279  4e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599998 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4465  hypothetical protein  51.74 
 
 
325 aa  278  6e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4749  hypothetical protein  51.13 
 
 
325 aa  278  6e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.291957  hitchhiker  0.000564584 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4299  hypothetical protein  51.13 
 
 
325 aa  277  1e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3773  hypothetical protein  50.97 
 
 
325 aa  277  1e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.149988  hitchhiker  0.00126811 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3084  hypothetical protein  51.3 
 
 
325 aa  276  2e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1610  hypothetical protein  52.51 
 
 
325 aa  275  4e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2922  hypothetical protein  49.63 
 
 
325 aa  275  5e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1890  hypothetical protein  51.31 
 
 
325 aa  275  6e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3087  hypothetical protein  51.11 
 
 
325 aa  275  6e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0200  hypothetical protein  51.13 
 
 
293 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2814  hypothetical protein  50.38 
 
 
325 aa  273  3e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0957  hypothetical protein  51.31 
 
 
325 aa  273  3e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00250015  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0670  hypothetical protein  51.54 
 
 
325 aa  272  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2785  hypothetical protein  50.19 
 
 
325 aa  271  9e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0143634  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1264  hypothetical protein  50.94 
 
 
325 aa  271  1e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3040  hypothetical protein  50.56 
 
 
325 aa  270  1e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3447  hypothetical protein  50.56 
 
 
325 aa  270  1e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0115  hypothetical protein  50.77 
 
 
325 aa  270  2e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4547  hypothetical protein  50.75 
 
 
325 aa  270  2e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2555  hypothetical protein  51.35 
 
 
325 aa  270  2e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00750734  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2622  hypothetical protein  51.15 
 
 
319 aa  269  4e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0144606  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3681  hypothetical protein  49.82 
 
 
323 aa  269  4e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2299  hypothetical protein  50.19 
 
 
325 aa  268  7e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.187044  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4530  hypothetical protein  50.56 
 
 
325 aa  268  8e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2402  hypothetical protein  50.97 
 
 
325 aa  268  8e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.283143  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1547  hypothetical protein  50.38 
 
 
325 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1812  hypothetical protein  51.78 
 
 
316 aa  267  1e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2628  hypothetical protein  50.37 
 
 
326 aa  267  1e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0116  hypothetical protein  50.19 
 
 
325 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1241  hypothetical protein  51.54 
 
 
325 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1511  hypothetical protein  50.19 
 
 
325 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2533  hypothetical protein  52.4 
 
 
326 aa  265  5e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0991372  normal  0.0595118 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1510  hypothetical protein  50.19 
 
 
325 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1546  hypothetical protein  49.81 
 
 
326 aa  265  8e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3473  hypothetical protein  48.85 
 
 
325 aa  263  3e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0606  hypothetical protein  50.56 
 
 
325 aa  263  3e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1861  hypothetical protein  48.86 
 
 
329 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.633128  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2414  hypothetical protein  52.77 
 
 
326 aa  250  2e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.196776  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1856  hypothetical protein  44.33 
 
 
370 aa  238  8e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3659  hypothetical protein  45.68 
 
 
347 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2414  hypothetical protein  41.26 
 
 
341 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.301389  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2393  hypothetical protein  51.33 
 
 
238 aa  229  3e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0597783  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2679  hypothetical protein  48.05 
 
 
336 aa  229  3e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0118762  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02306  hypothetical protein  49.8 
 
 
324 aa  229  4e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.334783  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2840  protein of unknown function DUF1568  43.16 
 
 
345 aa  228  8e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0644633 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02418  hypothetical protein  44.61 
 
 
328 aa  228  9e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1697  hypothetical protein  41.58 
 
 
349 aa  227  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0562  hypothetical protein  43.06 
 
 
370 aa  228  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0862774 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2403  hypothetical protein  44.23 
 
 
341 aa  226  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.284659  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1945  protein of unknown function DUF1568  40.56 
 
 
341 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.499337 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3200  hypothetical protein  40.48 
 
 
344 aa  224  1e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.789239 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1226  protein of unknown function DUF1568  43.46 
 
 
341 aa  222  6e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.353731  hitchhiker  0.000000017845 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2933  hypothetical protein  41.84 
 
 
345 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.161086  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1436  protein of unknown function DUF1568  50.42 
 
 
341 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0856  hypothetical protein  44.32 
 
 
347 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1178  hypothetical protein  43.35 
 
 
344 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0303591  normal  0.0825627 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1700  protein of unknown function DUF1568  40.73 
 
 
377 aa  219  3e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0414346 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2480  hypothetical protein  42.97 
 
 
344 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2324  Elongator protein 3/MiaB/NifB  65.58 
 
 
208 aa  218  6e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0123865 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0910  hypothetical protein  42.97 
 
 
344 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0868  hypothetical protein  43.73 
 
 
344 aa  217  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1126  hypothetical protein  42.97 
 
 
344 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.776641  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2780  hypothetical protein  46.84 
 
 
336 aa  216  4e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000960474  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2906  hypothetical protein  45.2 
 
 
329 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2838  hypothetical protein  54.91 
 
 
186 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.579373  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3682  hypothetical protein  58.5 
 
 
198 aa  182  3e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0499  hypothetical protein  51.79 
 
 
186 aa  181  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3299  hypothetical protein  56.05 
 
 
213 aa  180  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>