176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2838 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_2838  hypothetical protein  100 
 
 
186 aa  390  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.579373  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2922  hypothetical protein  84.95 
 
 
325 aa  336  9.999999999999999e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3681  hypothetical protein  82.51 
 
 
323 aa  325  2.0000000000000001e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0135  hypothetical protein  78.49 
 
 
325 aa  320  7e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1921  hypothetical protein  78.49 
 
 
325 aa  318  3.9999999999999996e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3680  hypothetical protein  78.49 
 
 
325 aa  318  3.9999999999999996e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2392  hypothetical protein  77.42 
 
 
325 aa  314  5e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.134929  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0200  hypothetical protein  76.88 
 
 
293 aa  310  4.999999999999999e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2393  hypothetical protein  75.81 
 
 
238 aa  310  5.999999999999999e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0597783  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1378  hypothetical protein  77.42 
 
 
325 aa  306  8e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599998 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2958  hypothetical protein  76.34 
 
 
325 aa  306  9e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1890  hypothetical protein  75.27 
 
 
325 aa  306  1.0000000000000001e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4465  hypothetical protein  75.81 
 
 
325 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4749  hypothetical protein  76.63 
 
 
325 aa  302  2.0000000000000002e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.291957  hitchhiker  0.000564584 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4299  hypothetical protein  76.09 
 
 
325 aa  300  1e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0670  hypothetical protein  73.66 
 
 
325 aa  299  1e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3773  hypothetical protein  75.27 
 
 
325 aa  300  1e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.149988  hitchhiker  0.00126811 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2299  hypothetical protein  74.19 
 
 
325 aa  299  2e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.187044  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2402  hypothetical protein  74.19 
 
 
325 aa  299  2e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.283143  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3627  hypothetical protein  76.09 
 
 
325 aa  298  2e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92162  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0957  hypothetical protein  74.73 
 
 
325 aa  298  2e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00250015  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2555  hypothetical protein  73.12 
 
 
325 aa  298  3e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00750734  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3040  hypothetical protein  73.12 
 
 
325 aa  298  4e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3447  hypothetical protein  73.12 
 
 
325 aa  298  4e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1546  hypothetical protein  72.58 
 
 
326 aa  295  2e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4547  hypothetical protein  73.66 
 
 
325 aa  296  2e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2814  hypothetical protein  73.66 
 
 
325 aa  295  2e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1264  hypothetical protein  74.19 
 
 
325 aa  296  2e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0115  hypothetical protein  73.91 
 
 
325 aa  295  3e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1861  hypothetical protein  73.66 
 
 
329 aa  295  3e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.633128  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1511  hypothetical protein  73.22 
 
 
325 aa  295  3e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2622  hypothetical protein  73.91 
 
 
319 aa  295  3e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0144606  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4530  hypothetical protein  72.58 
 
 
325 aa  294  4e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1547  hypothetical protein  71.51 
 
 
325 aa  294  5e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0606  hypothetical protein  73.66 
 
 
325 aa  293  8e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1510  hypothetical protein  73.37 
 
 
325 aa  293  1e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3473  hypothetical protein  72.04 
 
 
325 aa  292  2e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1241  hypothetical protein  72.58 
 
 
325 aa  290  8e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0116  hypothetical protein  73.22 
 
 
325 aa  289  2e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1610  hypothetical protein  70.43 
 
 
325 aa  287  7e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3087  hypothetical protein  69.35 
 
 
325 aa  284  5.999999999999999e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2785  hypothetical protein  68.28 
 
 
325 aa  280  1e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0143634  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3084  hypothetical protein  68.82 
 
 
325 aa  280  1e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1812  hypothetical protein  75.29 
 
 
316 aa  277  5e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0499  hypothetical protein  72.19 
 
 
186 aa  269  2e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1948  hypothetical protein  66.31 
 
 
326 aa  268  2e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.270103  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2653  hypothetical protein  66.31 
 
 
326 aa  268  2.9999999999999997e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3323  hypothetical protein  67.96 
 
 
325 aa  267  8e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0196  hypothetical protein  67.22 
 
 
326 aa  265  2.9999999999999995e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.157282 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2628  hypothetical protein  67.78 
 
 
326 aa  263  1e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2533  hypothetical protein  68.82 
 
 
326 aa  262  2e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0991372  normal  0.0595118 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3091  hypothetical protein  64.52 
 
 
326 aa  261  3e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0496594 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2307  hypothetical protein  66.3 
 
 
326 aa  261  4e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0052  hypothetical protein  65.75 
 
 
326 aa  258  4e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.186799 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2414  hypothetical protein  68.82 
 
 
326 aa  245  3e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.196776  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3113  hypothetical protein  66.88 
 
 
207 aa  232  3e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3356  hypothetical protein  59.2 
 
 
323 aa  216  2e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.526564  normal  0.864241 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01831  hypothetical protein  54.91 
 
 
271 aa  197  6e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1735  hypothetical protein  55.17 
 
 
327 aa  189  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1948  hypothetical protein  55.17 
 
 
327 aa  188  4e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.557873  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3465  hypothetical protein  61.07 
 
 
325 aa  187  5e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0641119 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0111  hypothetical protein  59.73 
 
 
325 aa  186  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0333  Type I secretion outer membrane protein, TolC  59.06 
 
 
325 aa  187  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0672756 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3074  CheW protein  59.73 
 
 
325 aa  186  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.464984  normal  0.367409 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1848  hypothetical protein  54.02 
 
 
327 aa  184  6e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1385  hypothetical protein  52.87 
 
 
327 aa  184  7e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.868466  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4132  hypothetical protein  52.87 
 
 
327 aa  184  7e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0907  hypothetical protein  54.02 
 
 
327 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0248219  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3017  hypothetical protein  56.38 
 
 
325 aa  173  9.999999999999999e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0296678 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0282  hypothetical protein  54.97 
 
 
325 aa  172  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.822944  hitchhiker  0.00000243422 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1111  hypothetical protein  51.15 
 
 
327 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0480419  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2943  histidine kinase  55.63 
 
 
325 aa  169  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0281  hypothetical protein  54.97 
 
 
325 aa  168  4e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000015206 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0607  hypothetical protein  54.97 
 
 
325 aa  168  4e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1856  hypothetical protein  43.33 
 
 
370 aa  160  7e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2679  hypothetical protein  50.91 
 
 
336 aa  153  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0118762  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0856  hypothetical protein  46.33 
 
 
347 aa  153  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2906  hypothetical protein  49.08 
 
 
329 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2840  protein of unknown function DUF1568  46.24 
 
 
345 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0644633 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3659  hypothetical protein  44.32 
 
 
347 aa  149  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1436  protein of unknown function DUF1568  49.34 
 
 
341 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1697  hypothetical protein  46.82 
 
 
349 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2933  hypothetical protein  42.93 
 
 
345 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.161086  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2414  hypothetical protein  44.2 
 
 
341 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.301389  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3200  hypothetical protein  41.85 
 
 
344 aa  144  5e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.789239 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0868  hypothetical protein  43.48 
 
 
344 aa  144  5e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1945  protein of unknown function DUF1568  44.2 
 
 
341 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.499337 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1226  protein of unknown function DUF1568  44.75 
 
 
341 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.353731  hitchhiker  0.000000017845 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1541  hypothetical protein  42.93 
 
 
209 aa  142  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1126  hypothetical protein  41.85 
 
 
344 aa  142  4e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.776641  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1178  hypothetical protein  41.85 
 
 
344 aa  142  4e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0303591  normal  0.0825627 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0910  hypothetical protein  41.85 
 
 
344 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2403  hypothetical protein  46.43 
 
 
341 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.284659  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2780  hypothetical protein  49.33 
 
 
336 aa  137  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000960474  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2480  hypothetical protein  40.88 
 
 
344 aa  135  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02306  hypothetical protein  39.23 
 
 
324 aa  134  6.0000000000000005e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.334783  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3682  hypothetical protein  96.77 
 
 
198 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02418  hypothetical protein  39.33 
 
 
328 aa  129  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1728  hypothetical protein  68.75 
 
 
80 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0979  hypothetical protein  70 
 
 
80 aa  128  6e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>