188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2402 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_0115  hypothetical protein  93.54 
 
 
325 aa  640    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0116  hypothetical protein  92.92 
 
 
325 aa  637    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1241  hypothetical protein  93.85 
 
 
325 aa  642    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1510  hypothetical protein  94.15 
 
 
325 aa  644    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1546  hypothetical protein  93.85 
 
 
326 aa  647    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1547  hypothetical protein  93.23 
 
 
325 aa  643    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3040  hypothetical protein  93.23 
 
 
325 aa  644    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3447  hypothetical protein  93.23 
 
 
325 aa  644    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4530  hypothetical protein  93.85 
 
 
325 aa  644    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4547  hypothetical protein  92.62 
 
 
325 aa  641    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2299  hypothetical protein  93.23 
 
 
325 aa  644    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.187044  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2555  hypothetical protein  95.69 
 
 
325 aa  654    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00750734  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2402  hypothetical protein  100 
 
 
325 aa  681    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.283143  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0670  hypothetical protein  91.69 
 
 
325 aa  634    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2814  hypothetical protein  92.31 
 
 
325 aa  632  1e-180  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3473  hypothetical protein  91.38 
 
 
325 aa  633  1e-180  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2622  hypothetical protein  95.24 
 
 
319 aa  629  1e-179  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0144606  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1511  hypothetical protein  90.46 
 
 
325 aa  624  1e-178  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1861  hypothetical protein  90.27 
 
 
329 aa  617  1e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.633128  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1890  hypothetical protein  88.58 
 
 
325 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0606  hypothetical protein  87.35 
 
 
325 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0957  hypothetical protein  85.8 
 
 
325 aa  599  1e-170  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00250015  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1812  hypothetical protein  91.91 
 
 
316 aa  599  1e-170  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1264  hypothetical protein  85.49 
 
 
325 aa  597  1e-169  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0135  hypothetical protein  80.75 
 
 
325 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1921  hypothetical protein  79.38 
 
 
325 aa  559  1e-158  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3680  hypothetical protein  79.38 
 
 
325 aa  559  1e-158  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2392  hypothetical protein  78.15 
 
 
325 aa  551  1e-156  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.134929  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2958  hypothetical protein  76 
 
 
325 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1378  hypothetical protein  76 
 
 
325 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599998 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3773  hypothetical protein  74.46 
 
 
325 aa  531  1e-150  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.149988  hitchhiker  0.00126811 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4299  hypothetical protein  75.47 
 
 
325 aa  532  1e-150  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3627  hypothetical protein  74.53 
 
 
325 aa  524  1e-148  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92162  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4465  hypothetical protein  73.85 
 
 
325 aa  521  1e-147  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2922  hypothetical protein  73.6 
 
 
325 aa  517  1e-146  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0200  hypothetical protein  85.37 
 
 
293 aa  518  1e-146  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4749  hypothetical protein  73.6 
 
 
325 aa  520  1e-146  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.291957  hitchhiker  0.000564584 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3681  hypothetical protein  72.76 
 
 
323 aa  513  1e-144  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2653  hypothetical protein  74.53 
 
 
326 aa  510  1e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2533  hypothetical protein  77.02 
 
 
326 aa  510  1e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0991372  normal  0.0595118 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3087  hypothetical protein  72.62 
 
 
325 aa  510  1e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1610  hypothetical protein  72.31 
 
 
325 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2785  hypothetical protein  72.31 
 
 
325 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0143634  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0196  hypothetical protein  73.29 
 
 
326 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.157282 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3084  hypothetical protein  72 
 
 
325 aa  503  1e-141  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2414  hypothetical protein  74.77 
 
 
326 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.196776  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1948  hypothetical protein  69.25 
 
 
326 aa  485  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.270103  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3323  hypothetical protein  66.46 
 
 
325 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0052  hypothetical protein  66.46 
 
 
326 aa  465  9.999999999999999e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.186799 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2307  hypothetical protein  67.08 
 
 
326 aa  464  1e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3091  hypothetical protein  65.84 
 
 
326 aa  459  9.999999999999999e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0496594 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2628  hypothetical protein  64.29 
 
 
326 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2393  hypothetical protein  84.72 
 
 
238 aa  414  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0597783  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3356  hypothetical protein  56.87 
 
 
323 aa  381  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.526564  normal  0.864241 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1385  hypothetical protein  57.83 
 
 
327 aa  367  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.868466  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1948  hypothetical protein  57.51 
 
 
327 aa  365  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.557873  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1848  hypothetical protein  57.51 
 
 
327 aa  363  2e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0907  hypothetical protein  56.87 
 
 
327 aa  359  4e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0248219  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4132  hypothetical protein  55.91 
 
 
327 aa  358  7e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1735  hypothetical protein  56.23 
 
 
327 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3041  hypothetical protein  93.33 
 
 
198 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3446  hypothetical protein  93.33 
 
 
198 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3465  hypothetical protein  58.33 
 
 
325 aa  351  8e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0641119 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0111  hypothetical protein  57.29 
 
 
325 aa  349  5e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3074  CheW protein  57.29 
 
 
325 aa  348  6e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.464984  normal  0.367409 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0333  Type I secretion outer membrane protein, TolC  56.25 
 
 
325 aa  348  9e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0672756 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0282  hypothetical protein  56.9 
 
 
325 aa  340  2e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.822944  hitchhiker  0.00000243422 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1111  hypothetical protein  53.35 
 
 
327 aa  340  2e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0480419  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0281  hypothetical protein  56.9 
 
 
325 aa  337  1.9999999999999998e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000015206 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0499  hypothetical protein  91.38 
 
 
186 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2943  histidine kinase  53.35 
 
 
325 aa  335  7.999999999999999e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0607  hypothetical protein  56.55 
 
 
325 aa  334  1e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1856  hypothetical protein  49.42 
 
 
370 aa  325  8.000000000000001e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3017  hypothetical protein  53.12 
 
 
325 aa  324  1e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0296678 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1436  protein of unknown function DUF1568  50.62 
 
 
341 aa  310  2e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2679  hypothetical protein  50.66 
 
 
336 aa  299  5e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0118762  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2838  hypothetical protein  74.19 
 
 
186 aa  299  5e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.579373  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3659  hypothetical protein  46.91 
 
 
347 aa  296  3e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2906  hypothetical protein  50.66 
 
 
329 aa  295  5e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3113  hypothetical protein  87.5 
 
 
207 aa  295  9e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3200  hypothetical protein  45.82 
 
 
344 aa  292  7e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.789239 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2780  hypothetical protein  51.9 
 
 
336 aa  290  3e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000960474  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3682  hypothetical protein  73.08 
 
 
198 aa  288  6e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0910  hypothetical protein  47.3 
 
 
344 aa  288  1e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2840  protein of unknown function DUF1568  46.47 
 
 
345 aa  287  1e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0644633 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0856  hypothetical protein  47.32 
 
 
347 aa  288  1e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0868  hypothetical protein  45.51 
 
 
344 aa  287  2e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2414  hypothetical protein  46.25 
 
 
341 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.301389  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1945  protein of unknown function DUF1568  46.25 
 
 
341 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.499337 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1697  hypothetical protein  46.79 
 
 
349 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1178  hypothetical protein  46.67 
 
 
344 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0303591  normal  0.0825627 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1226  protein of unknown function DUF1568  46.56 
 
 
341 aa  285  8e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.353731  hitchhiker  0.000000017845 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2403  hypothetical protein  47.12 
 
 
341 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.284659  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2480  hypothetical protein  46.35 
 
 
344 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1126  hypothetical protein  46.35 
 
 
344 aa  281  8.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.776641  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2933  hypothetical protein  44.41 
 
 
345 aa  281  1e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.161086  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1700  protein of unknown function DUF1568  43.15 
 
 
377 aa  280  2e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0414346 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02418  hypothetical protein  43.53 
 
 
328 aa  279  5e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0562  hypothetical protein  45.27 
 
 
370 aa  278  8e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0862774 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02306  hypothetical protein  43.08 
 
 
324 aa  270  2.9999999999999997e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.334783  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>