125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3446 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3041  hypothetical protein  100 
 
 		 198 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3446  hypothetical protein  100 
 
 		 198 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4530  hypothetical protein  98.33 
 
 		 325 aa  370  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1510  hypothetical protein  96.11 
 
 		 325 aa  365  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0670  hypothetical protein  93.89 
 
 		 325 aa  362  3e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0116  hypothetical protein  93.89 
 
 		 325 aa  359  1e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2299  hypothetical protein  93.33 
 
 		 325 aa  360  1e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.187044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1812  hypothetical protein  93.89 
 
 		 316 aa  359  2e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1546  hypothetical protein  92.78 
 
 		 326 aa  358  3e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1547  hypothetical protein  93.89 
 
 		 325 aa  358  3e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2402  hypothetical protein  93.33 
 
 		 325 aa  357  9e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.283143  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2555  hypothetical protein  93.33 
 
 		 325 aa  356  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00750734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3473  hypothetical protein  92.22 
 
 		 325 aa  356  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0115  hypothetical protein  93.33 
 
 		 325 aa  355  1.9999999999999998e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1241  hypothetical protein  92.22 
 
 		 325 aa  355  1.9999999999999998e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1890  hypothetical protein  91.67 
 
 		 325 aa  354  3.9999999999999996e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2814  hypothetical protein  91.67 
 
 		 325 aa  354  5e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1511  hypothetical protein  91.67 
 
 		 325 aa  353  6.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0606  hypothetical protein  90.56 
 
 		 325 aa  352  2.9999999999999997e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3040  hypothetical protein  90 
 
 		 325 aa  350  1e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3447  hypothetical protein  90 
 
 		 325 aa  350  1e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4547  hypothetical protein  90.56 
 
 		 325 aa  349  2e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1264  hypothetical protein  88.89 
 
 		 325 aa  347  6e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0957  hypothetical protein  88.33 
 
 		 325 aa  345  2e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00250015  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1861  hypothetical protein  90.22 
 
 		 329 aa  343  1e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.633128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2622  hypothetical protein  91.76 
 
 		 319 aa  329  1e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0144606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3773  hypothetical protein  77.22 
 
 		 325 aa  310  1e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.149988  hitchhiker  0.00126811 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4299  hypothetical protein  78.33 
 
 		 325 aa  308  2.9999999999999997e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1378  hypothetical protein  77.22 
 
 		 325 aa  308  4e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000599998 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2653  hypothetical protein  78.89 
 
 		 326 aa  308  4e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2958  hypothetical protein  77.22 
 
 		 325 aa  306  1.0000000000000001e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2533  hypothetical protein  77.22 
 
 		 326 aa  303  8.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0991372  normal  0.0595118 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0196  hypothetical protein  77.78 
 
 		 326 aa  303  9.000000000000001e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.157282 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0135  hypothetical protein  75.56 
 
 		 325 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3627  hypothetical protein  77.22 
 
 		 325 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4465  hypothetical protein  75.56 
 
 		 325 aa  300  8.000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1921  hypothetical protein  75 
 
 		 325 aa  299  1e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3680  hypothetical protein  75 
 
 		 325 aa  299  1e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2922  hypothetical protein  76.11 
 
 		 325 aa  300  1e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2392  hypothetical protein  75 
 
 		 325 aa  298  5e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.134929  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4749  hypothetical protein  75 
 
 		 325 aa  297  7e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.291957  hitchhiker  0.000564584 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3087  hypothetical protein  75.56 
 
 		 325 aa  297  8e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1610  hypothetical protein  75 
 
 		 325 aa  294  5e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2785  hypothetical protein  75 
 
 		 325 aa  294  5e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0143634  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3681  hypothetical protein  74.44 
 
 		 323 aa  293  2e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3084  hypothetical protein  74.44 
 
 		 325 aa  291  4e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2414  hypothetical protein  76.67 
 
 		 326 aa  286  1e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.196776  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1948  hypothetical protein  72.22 
 
 		 326 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.270103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0200  hypothetical protein  86.9 
 
 		 293 aa  271  7e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2307  hypothetical protein  68.33 
 
 		 326 aa  264  5e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3323  hypothetical protein  65 
 
 		 325 aa  259  2e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3091  hypothetical protein  66.11 
 
 		 326 aa  258  3e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0496594 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0052  hypothetical protein  65 
 
 		 326 aa  257  8e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.186799 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2628  hypothetical protein  63.89 
 
 		 326 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3682  hypothetical protein  73.25 
 
 		 198 aa  249  2e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3356  hypothetical protein  60 
 
 		 323 aa  240  1e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.526564  normal  0.864241 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0907  hypothetical protein  61.11 
 
 		 327 aa  236  1e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0248219  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1385  hypothetical protein  61.11 
 
 		 327 aa  234  5.0000000000000005e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.868466  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1948  hypothetical protein  60.56 
 
 		 327 aa  234  7e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.557873  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1848  hypothetical protein  60.56 
 
 		 327 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1111  hypothetical protein  60 
 
 		 327 aa  231  5e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0480419  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0333  Type I secretion outer membrane protein, TolC  58.33 
 
 		 325 aa  229  3e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0672756 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3074  CheW protein  58.33 
 
 		 325 aa  228  5e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.464984  normal  0.367409 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0111  hypothetical protein  58.33 
 
 		 325 aa  228  6e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4132  hypothetical protein  58.33 
 
 		 327 aa  228  6e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1735  hypothetical protein  58.89 
 
 		 327 aa  227  9e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1856  hypothetical protein  59.66 
 
 		 370 aa  226  2e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3465  hypothetical protein  58.33 
 
 		 325 aa  226  2e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0641119 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02418  hypothetical protein  57.22 
 
 		 328 aa  223  2e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2324  Elongator protein 3/MiaB/NifB  56.11 
 
 		 208 aa  217  1e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0123865 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0281  hypothetical protein  56.11 
 
 		 325 aa  216  2e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015206 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3017  hypothetical protein  54.44 
 
 		 325 aa  215  2.9999999999999998e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0296678 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1436  protein of unknown function DUF1568  56.11 
 
 		 341 aa  215  4e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0282  hypothetical protein  55.56 
 
 		 325 aa  213  9.999999999999999e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.822944  hitchhiker  0.00000243422 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0607  hypothetical protein  55.56 
 
 		 325 aa  213  1.9999999999999998e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2943  histidine kinase  55.56 
 
 		 325 aa  212  1.9999999999999998e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2780  hypothetical protein  57.22 
 
 		 336 aa  212  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000960474  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0562  hypothetical protein  55.74 
 
 		 370 aa  211  7e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0862774 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2839  hypothetical protein  69.34 
 
 		 137 aa  209  2e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.504912  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2679  hypothetical protein  52.78 
 
 		 336 aa  207  8e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0118762  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1700  protein of unknown function DUF1568  53.85 
 
 		 377 aa  206  2e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0414346 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0856  hypothetical protein  54.14 
 
 		 347 aa  203  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2906  hypothetical protein  53.89 
 
 		 329 aa  201  5e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3659  hypothetical protein  53.33 
 
 		 347 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3299  hypothetical protein  51.67 
 
 		 213 aa  198  5e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0910  hypothetical protein  51.67 
 
 		 344 aa  197  6e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2403  hypothetical protein  51.67 
 
 		 341 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.284659  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1226  protein of unknown function DUF1568  52.22 
 
 		 341 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.353731  hitchhiker  0.000000017845 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3200  hypothetical protein  51.67 
 
 		 344 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.789239 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2933  hypothetical protein  50.56 
 
 		 345 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.161086  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1697  hypothetical protein  51.11 
 
 		 349 aa  196  3e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2480  hypothetical protein  51.67 
 
 		 344 aa  195  3e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2414  hypothetical protein  51.11 
 
 		 341 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.301389  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1178  hypothetical protein  50.56 
 
 		 344 aa  194  8.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0303591  normal  0.0825627 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1945  protein of unknown function DUF1568  51.11 
 
 		 341 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.499337 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2840  protein of unknown function DUF1568  51.11 
 
 		 345 aa  193  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0644633 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0868  hypothetical protein  48.89 
 
 		 344 aa  193  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1126  hypothetical protein  50 
 
 		 344 aa  190  1e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.776641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2394  hypothetical protein  85 
 
 		 104 aa  186  2e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.176236  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02306  hypothetical protein  51.98 
 
 		 324 aa  183  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.334783  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>