171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2393 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2393  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  500  1e-140  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0597783  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0200  hypothetical protein  92.14 
 
 		 293 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1890  hypothetical protein  86.03 
 
 		 325 aa  423  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2392  hypothetical protein  87.77 
 
 		 325 aa  424  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.134929  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0135  hypothetical protein  86.03 
 
 		 325 aa  421  1e-117  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1921  hypothetical protein  86.46 
 
 		 325 aa  422  1e-117  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3680  hypothetical protein  86.46 
 
 		 325 aa  422  1e-117  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0957  hypothetical protein  86.9 
 
 		 325 aa  422  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00250015  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1264  hypothetical protein  86.46 
 
 		 325 aa  419  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2402  hypothetical protein  84.72 
 
 		 325 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.283143  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0670  hypothetical protein  84.72 
 
 		 325 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1547  hypothetical protein  83.84 
 
 		 325 aa  410  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3040  hypothetical protein  84.28 
 
 		 325 aa  412  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3447  hypothetical protein  84.28 
 
 		 325 aa  412  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2299  hypothetical protein  84.72 
 
 		 325 aa  412  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.187044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2555  hypothetical protein  84.72 
 
 		 325 aa  413  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00750734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2622  hypothetical protein  85.4 
 
 		 319 aa  410  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0144606  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1510  hypothetical protein  85.02 
 
 		 325 aa  409  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1546  hypothetical protein  83.41 
 
 		 326 aa  407  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4530  hypothetical protein  83.41 
 
 		 325 aa  408  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4547  hypothetical protein  82.97 
 
 		 325 aa  409  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2814  hypothetical protein  83.41 
 
 		 325 aa  409  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0115  hypothetical protein  84.07 
 
 		 325 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3473  hypothetical protein  82.53 
 
 		 325 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0606  hypothetical protein  84.28 
 
 		 325 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0116  hypothetical protein  82.82 
 
 		 325 aa  400  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1241  hypothetical protein  82.1 
 
 		 325 aa  400  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1511  hypothetical protein  82.3 
 
 		 325 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1861  hypothetical protein  81.97 
 
 		 329 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.633128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1812  hypothetical protein  85.92 
 
 		 316 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4749  hypothetical protein  78.17 
 
 		 325 aa  390  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.291957  hitchhiker  0.000564584 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4299  hypothetical protein  78.17 
 
 		 325 aa  389  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3627  hypothetical protein  77.73 
 
 		 325 aa  387  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1378  hypothetical protein  78.51 
 
 		 325 aa  384  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000599998 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4465  hypothetical protein  77.19 
 
 		 325 aa  380  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2958  hypothetical protein  77.63 
 
 		 325 aa  382  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3773  hypothetical protein  75.44 
 
 		 325 aa  374  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.149988  hitchhiker  0.00126811 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3681  hypothetical protein  75.56 
 
 		 323 aa  365  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2922  hypothetical protein  74.78 
 
 		 325 aa  366  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3087  hypothetical protein  72.49 
 
 		 325 aa  357  7e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1948  hypothetical protein  73.78 
 
 		 326 aa  356  1.9999999999999998e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.270103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1610  hypothetical protein  72.37 
 
 		 325 aa  355  5e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2785  hypothetical protein  71.62 
 
 		 325 aa  354  7.999999999999999e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0143634  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2653  hypothetical protein  74.44 
 
 		 326 aa  353  8.999999999999999e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0196  hypothetical protein  73.99 
 
 		 326 aa  350  8e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.157282 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3084  hypothetical protein  71.05 
 
 		 325 aa  348  3e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2533  hypothetical protein  75.11 
 
 		 326 aa  344  6e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0991372  normal  0.0595118 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0052  hypothetical protein  66.52 
 
 		 326 aa  320  9.999999999999999e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.186799 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2628  hypothetical protein  66.52 
 
 		 326 aa  318  3.9999999999999996e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2414  hypothetical protein  72.49 
 
 		 326 aa  317  1e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.196776  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3323  hypothetical protein  66.08 
 
 		 325 aa  316  2e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3091  hypothetical protein  66.67 
 
 		 326 aa  316  3e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0496594 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2307  hypothetical protein  66.67 
 
 		 326 aa  312  2.9999999999999996e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2838  hypothetical protein  75.81 
 
 		 186 aa  310  9e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.579373  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0499  hypothetical protein  83.04 
 
 		 186 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3113  hypothetical protein  81.13 
 
 		 207 aa  275  7e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1948  hypothetical protein  56.68 
 
 		 327 aa  250  1e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.557873  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1735  hypothetical protein  56.22 
 
 		 327 aa  248  5e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3356  hypothetical protein  54.38 
 
 		 323 aa  248  7e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.526564  normal  0.864241 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1848  hypothetical protein  56.22 
 
 		 327 aa  247  1e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1385  hypothetical protein  54.84 
 
 		 327 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.868466  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4132  hypothetical protein  54.38 
 
 		 327 aa  244  9e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0907  hypothetical protein  55.5 
 
 		 327 aa  242  3e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0248219  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3465  hypothetical protein  58.85 
 
 		 325 aa  233  1.0000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0641119 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0111  hypothetical protein  57.29 
 
 		 325 aa  230  1e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3074  CheW protein  57.29 
 
 		 325 aa  230  1e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.464984  normal  0.367409 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01831  hypothetical protein  51.33 
 
 		 271 aa  229  2e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0333  Type I secretion outer membrane protein, TolC  56.25 
 
 		 325 aa  230  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0672756 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0282  hypothetical protein  57.22 
 
 		 325 aa  226  3e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.822944  hitchhiker  0.00000243422 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0281  hypothetical protein  56.7 
 
 		 325 aa  218  5e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015206 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2943  histidine kinase  56.19 
 
 		 325 aa  218  7e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0607  hypothetical protein  56.19 
 
 		 325 aa  217  2e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1111  hypothetical protein  47.93 
 
 		 327 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0480419  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3017  hypothetical protein  53.93 
 
 		 325 aa  211  1e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0296678 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1856  hypothetical protein  46.03 
 
 		 370 aa  206  3e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2679  hypothetical protein  50.24 
 
 		 336 aa  197  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0118762  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0856  hypothetical protein  46.05 
 
 		 347 aa  192  3e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2906  hypothetical protein  50 
 
 		 329 aa  192  4e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3659  hypothetical protein  45.85 
 
 		 347 aa  188  5e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0868  hypothetical protein  44.49 
 
 		 344 aa  183  3e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1945  protein of unknown function DUF1568  45.09 
 
 		 341 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.499337 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2414  hypothetical protein  44.64 
 
 		 341 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.301389  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1700  protein of unknown function DUF1568  42.26 
 
 		 377 aa  181  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0414346 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1436  protein of unknown function DUF1568  49.75 
 
 		 341 aa  180  2e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1226  protein of unknown function DUF1568  44.64 
 
 		 341 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.353731  hitchhiker  0.000000017845 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2840  protein of unknown function DUF1568  42.54 
 
 		 345 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0644633 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2403  hypothetical protein  43.75 
 
 		 341 aa  179  4e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.284659  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3682  hypothetical protein  79.05 
 
 		 198 aa  178  7e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2780  hypothetical protein  49.22 
 
 		 336 aa  178  8e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000960474  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1697  hypothetical protein  44.64 
 
 		 349 aa  177  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3200  hypothetical protein  42.29 
 
 		 344 aa  177  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.789239 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1178  hypothetical protein  42.73 
 
 		 344 aa  176  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0303591  normal  0.0825627 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0910  hypothetical protein  43.17 
 
 		 344 aa  176  4e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2933  hypothetical protein  43.46 
 
 		 345 aa  176  4e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.161086  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1126  hypothetical protein  43.64 
 
 		 344 aa  174  8e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.776641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02306  hypothetical protein  43.32 
 
 		 324 aa  173  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.334783  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2480  hypothetical protein  41.85 
 
 		 344 aa  171  1e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02418  hypothetical protein  40.64 
 
 		 328 aa  170  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3041  hypothetical protein  88.1 
 
 		 198 aa  160  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3446  hypothetical protein  88.1 
 
 		 198 aa  160  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>