155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0499 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0499  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  390  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3040  hypothetical protein  94.25 
 
 		 325 aa  347  7e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3447  hypothetical protein  94.25 
 
 		 325 aa  347  7e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1546  hypothetical protein  91.38 
 
 		 326 aa  341  4e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4547  hypothetical protein  91.95 
 
 		 325 aa  341  4e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0115  hypothetical protein  91.38 
 
 		 325 aa  339  1e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1547  hypothetical protein  91.38 
 
 		 325 aa  340  1e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4530  hypothetical protein  91.38 
 
 		 325 aa  339  1e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2555  hypothetical protein  91.95 
 
 		 325 aa  339  1e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00750734  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1510  hypothetical protein  90.8 
 
 		 325 aa  337  4e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2402  hypothetical protein  91.38 
 
 		 325 aa  336  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.283143  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2622  hypothetical protein  91.38 
 
 		 319 aa  335  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0144606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2299  hypothetical protein  89.66 
 
 		 325 aa  333  7e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.187044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1511  hypothetical protein  89.66 
 
 		 325 aa  333  7e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2814  hypothetical protein  90.23 
 
 		 325 aa  333  9e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0116  hypothetical protein  89.66 
 
 		 325 aa  332  2e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1241  hypothetical protein  90.23 
 
 		 325 aa  332  2e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1861  hypothetical protein  88.51 
 
 		 329 aa  327  8e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.633128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0670  hypothetical protein  87.93 
 
 		 325 aa  327  8e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3473  hypothetical protein  87.36 
 
 		 325 aa  323  6e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0135  hypothetical protein  85.29 
 
 		 325 aa  314  5e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1921  hypothetical protein  84.8 
 
 		 325 aa  312  1.9999999999999998e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3680  hypothetical protein  84.8 
 
 		 325 aa  312  1.9999999999999998e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0606  hypothetical protein  87.13 
 
 		 325 aa  310  5.999999999999999e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1890  hypothetical protein  84.8 
 
 		 325 aa  310  1e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0957  hypothetical protein  84.8 
 
 		 325 aa  308  2.9999999999999997e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00250015  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2392  hypothetical protein  83.04 
 
 		 325 aa  306  8e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.134929  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1264  hypothetical protein  84.21 
 
 		 325 aa  306  9e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2393  hypothetical protein  83.04 
 
 		 238 aa  306  1.0000000000000001e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0597783  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0200  hypothetical protein  82.46 
 
 		 293 aa  301  2.0000000000000002e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1812  hypothetical protein  87.97 
 
 		 316 aa  294  4e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3113  hypothetical protein  85 
 
 		 207 aa  287  6e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1378  hypothetical protein  75.74 
 
 		 325 aa  279  2e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000599998 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4749  hypothetical protein  74.85 
 
 		 325 aa  278  2e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.291957  hitchhiker  0.000564584 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2958  hypothetical protein  75.15 
 
 		 325 aa  279  2e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4299  hypothetical protein  74.27 
 
 		 325 aa  277  5e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4465  hypothetical protein  74.56 
 
 		 325 aa  276  1e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3627  hypothetical protein  73.68 
 
 		 325 aa  275  4e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3773  hypothetical protein  73.37 
 
 		 325 aa  274  7e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.149988  hitchhiker  0.00126811 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3681  hypothetical protein  73.37 
 
 		 323 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2922  hypothetical protein  71.51 
 
 		 325 aa  271  4.0000000000000004e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2838  hypothetical protein  72.19 
 
 		 186 aa  269  2e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.579373  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1948  hypothetical protein  71.18 
 
 		 326 aa  264  5e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.270103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2785  hypothetical protein  69.59 
 
 		 325 aa  262  2e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0143634  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1610  hypothetical protein  70.76 
 
 		 325 aa  261  3e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3087  hypothetical protein  70.18 
 
 		 325 aa  262  3e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0052  hypothetical protein  69.01 
 
 		 326 aa  261  4.999999999999999e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.186799 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3084  hypothetical protein  70.18 
 
 		 325 aa  259  2e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2533  hypothetical protein  76.61 
 
 		 326 aa  255  2e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0991372  normal  0.0595118 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3323  hypothetical protein  69.01 
 
 		 325 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0196  hypothetical protein  67.84 
 
 		 326 aa  252  3e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.157282 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2653  hypothetical protein  68.42 
 
 		 326 aa  251  3e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2307  hypothetical protein  67.25 
 
 		 326 aa  250  9.000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3091  hypothetical protein  66.67 
 
 		 326 aa  249  2e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0496594 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2628  hypothetical protein  68.05 
 
 		 326 aa  248  3e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2414  hypothetical protein  74.56 
 
 		 326 aa  231  3e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.196776  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3356  hypothetical protein  55.62 
 
 		 323 aa  189  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.526564  normal  0.864241 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1735  hypothetical protein  55.56 
 
 		 327 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1948  hypothetical protein  55.56 
 
 		 327 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.557873  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01831  hypothetical protein  51.79 
 
 		 271 aa  181  6e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1848  hypothetical protein  54.94 
 
 		 327 aa  180  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1385  hypothetical protein  54.32 
 
 		 327 aa  179  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.868466  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4132  hypothetical protein  54.32 
 
 		 327 aa  179  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0907  hypothetical protein  54.32 
 
 		 327 aa  176  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0248219  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3465  hypothetical protein  58.52 
 
 		 325 aa  167  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0641119 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0111  hypothetical protein  57.04 
 
 		 325 aa  164  5.9999999999999996e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3074  CheW protein  57.04 
 
 		 325 aa  164  9e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.464984  normal  0.367409 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0282  hypothetical protein  56.93 
 
 		 325 aa  163  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.822944  hitchhiker  0.00000243422 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0333  Type I secretion outer membrane protein, TolC  54.81 
 
 		 325 aa  162  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0672756 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2943  histidine kinase  50.62 
 
 		 325 aa  161  5.0000000000000005e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0607  hypothetical protein  56.2 
 
 		 325 aa  158  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0281  hypothetical protein  56.2 
 
 		 325 aa  157  6e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015206 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1728  hypothetical protein  88.75 
 
 		 80 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1111  hypothetical protein  47.53 
 
 		 327 aa  154  8e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0480419  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0979  hypothetical protein  87.5 
 
 		 80 aa  153  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3017  hypothetical protein  54.07 
 
 		 325 aa  151  5.9999999999999996e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0296678 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1856  hypothetical protein  44.39 
 
 		 370 aa  149  3e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1436  protein of unknown function DUF1568  46.78 
 
 		 341 aa  144  8.000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3659  hypothetical protein  46.51 
 
 		 347 aa  142  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2906  hypothetical protein  50 
 
 		 329 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2414  hypothetical protein  45.83 
 
 		 341 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.301389  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1945  protein of unknown function DUF1568  45.83 
 
 		 341 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.499337 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3200  hypothetical protein  43.86 
 
 		 344 aa  136  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.789239 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0868  hypothetical protein  46.2 
 
 		 344 aa  135  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1226  protein of unknown function DUF1568  44.97 
 
 		 341 aa  134  9e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.353731  hitchhiker  0.000000017845 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2840  protein of unknown function DUF1568  46.25 
 
 		 345 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0644633 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2403  hypothetical protein  44.64 
 
 		 341 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.284659  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1126  hypothetical protein  44.44 
 
 		 344 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.776641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1178  hypothetical protein  44.44 
 
 		 344 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0303591  normal  0.0825627 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0856  hypothetical protein  46.34 
 
 		 347 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1541  hypothetical protein  42.78 
 
 		 209 aa  132  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0910  hypothetical protein  44.44 
 
 		 344 aa  131  5e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2933  hypothetical protein  42.69 
 
 		 345 aa  131  6e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.161086  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1697  hypothetical protein  46.88 
 
 		 349 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2679  hypothetical protein  48.68 
 
 		 336 aa  129  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0118762  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1890  hypothetical protein  48.87 
 
 		 147 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0896786  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2480  hypothetical protein  42.69 
 
 		 344 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2780  hypothetical protein  49.64 
 
 		 336 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000960474  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1902  hypothetical protein  48.12 
 
 		 147 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.266524  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02306  hypothetical protein  40 
 
 		 324 aa  122  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.334783  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>