187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0115 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0115  hypothetical protein  100 
 
 		 325 aa  680    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0116  hypothetical protein  97.23 
 
 		 325 aa  659    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1241  hypothetical protein  96 
 
 		 325 aa  654    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1510  hypothetical protein  94.46 
 
 		 325 aa  644    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1546  hypothetical protein  92.92 
 
 		 326 aa  644    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1547  hypothetical protein  95.08 
 
 		 325 aa  652    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3040  hypothetical protein  93.85 
 
 		 325 aa  647    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3447  hypothetical protein  93.85 
 
 		 325 aa  647    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4530  hypothetical protein  95.69 
 
 		 325 aa  657    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4547  hypothetical protein  92.62 
 
 		 325 aa  638    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2299  hypothetical protein  94.46 
 
 		 325 aa  649    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.187044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2555  hypothetical protein  93.85 
 
 		 325 aa  640    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00750734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2402  hypothetical protein  93.54 
 
 		 325 aa  640    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.283143  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1511  hypothetical protein  91.69 
 
 		 325 aa  632  1e-180  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0670  hypothetical protein  92 
 
 		 325 aa  631  1e-180  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2814  hypothetical protein  91.38 
 
 		 325 aa  629  1e-179  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3473  hypothetical protein  91.08 
 
 		 325 aa  628  1e-179  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2622  hypothetical protein  93.33 
 
 		 319 aa  617  1e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0144606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1861  hypothetical protein  90.27 
 
 		 329 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.633128  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1890  hypothetical protein  87.93 
 
 		 325 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0606  hypothetical protein  88.24 
 
 		 325 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0957  hypothetical protein  86.65 
 
 		 325 aa  598  1e-170  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00250015  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1264  hypothetical protein  86.34 
 
 		 325 aa  595  1e-169  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1812  hypothetical protein  92.23 
 
 		 316 aa  596  1e-169  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0135  hypothetical protein  79.19 
 
 		 325 aa  555  1e-157  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1921  hypothetical protein  78.88 
 
 		 325 aa  551  1e-156  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3680  hypothetical protein  78.88 
 
 		 325 aa  551  1e-156  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2392  hypothetical protein  77.64 
 
 		 325 aa  543  1e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.134929  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1378  hypothetical protein  74.3 
 
 		 325 aa  523  1e-147  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000599998 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2958  hypothetical protein  74.3 
 
 		 325 aa  523  1e-147  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3681  hypothetical protein  73.6 
 
 		 323 aa  518  1e-146  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3773  hypothetical protein  73.07 
 
 		 325 aa  518  1e-146  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.149988  hitchhiker  0.00126811 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4299  hypothetical protein  74.22 
 
 		 325 aa  520  1e-146  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0200  hypothetical protein  84.32 
 
 		 293 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2922  hypothetical protein  73.6 
 
 		 325 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4465  hypothetical protein  72.76 
 
 		 325 aa  511  1e-144  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2653  hypothetical protein  74.53 
 
 		 326 aa  513  1e-144  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3627  hypothetical protein  73.07 
 
 		 325 aa  512  1e-144  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4749  hypothetical protein  72.36 
 
 		 325 aa  508  1e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.291957  hitchhiker  0.000564584 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0196  hypothetical protein  73.29 
 
 		 326 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.157282 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2533  hypothetical protein  76.4 
 
 		 326 aa  501  1e-141  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0991372  normal  0.0595118 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2785  hypothetical protein  71.12 
 
 		 325 aa  498  1e-140  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0143634  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3087  hypothetical protein  71.43 
 
 		 325 aa  500  1e-140  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1610  hypothetical protein  71.43 
 
 		 325 aa  497  1e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1948  hypothetical protein  70.19 
 
 		 326 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.270103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3084  hypothetical protein  70.81 
 
 		 325 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2414  hypothetical protein  74.84 
 
 		 326 aa  478  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.196776  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0052  hypothetical protein  65.53 
 
 		 326 aa  466  9.999999999999999e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.186799 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2307  hypothetical protein  66.77 
 
 		 326 aa  465  9.999999999999999e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3323  hypothetical protein  65.53 
 
 		 325 aa  462  1e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3091  hypothetical protein  65.43 
 
 		 326 aa  460  9.999999999999999e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0496594 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2628  hypothetical protein  64.29 
 
 		 326 aa  449  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2393  hypothetical protein  84.07 
 
 		 238 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0597783  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3356  hypothetical protein  55.91 
 
 		 323 aa  374  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.526564  normal  0.864241 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1948  hypothetical protein  56.87 
 
 		 327 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.557873  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1385  hypothetical protein  56.55 
 
 		 327 aa  360  1e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.868466  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1848  hypothetical protein  56.23 
 
 		 327 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3041  hypothetical protein  93.33 
 
 		 198 aa  355  5e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3446  hypothetical protein  93.33 
 
 		 198 aa  355  5e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4132  hypothetical protein  55.27 
 
 		 327 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1735  hypothetical protein  55.59 
 
 		 327 aa  354  1e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0907  hypothetical protein  55.73 
 
 		 327 aa  353  2e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0248219  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3465  hypothetical protein  57.64 
 
 		 325 aa  347  2e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0641119 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0111  hypothetical protein  56.6 
 
 		 325 aa  344  1e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3074  CheW protein  56.6 
 
 		 325 aa  343  2e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.464984  normal  0.367409 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0333  Type I secretion outer membrane protein, TolC  55.21 
 
 		 325 aa  340  1e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0672756 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0499  hypothetical protein  91.38 
 
 		 186 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0282  hypothetical protein  55.52 
 
 		 325 aa  332  4e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.822944  hitchhiker  0.00000243422 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1111  hypothetical protein  52.08 
 
 		 327 aa  332  4e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0480419  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0281  hypothetical protein  54.83 
 
 		 325 aa  325  4.0000000000000003e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015206 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0607  hypothetical protein  54.83 
 
 		 325 aa  325  8.000000000000001e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2943  histidine kinase  51.44 
 
 		 325 aa  324  1e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1856  hypothetical protein  48.84 
 
 		 370 aa  322  6e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1436  protein of unknown function DUF1568  51.23 
 
 		 341 aa  318  7.999999999999999e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3017  hypothetical protein  52.78 
 
 		 325 aa  318  9e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0296678 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2679  hypothetical protein  50.33 
 
 		 336 aa  300  2e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0118762  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3659  hypothetical protein  47.22 
 
 		 347 aa  296  4e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2838  hypothetical protein  73.91 
 
 		 186 aa  295  8e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.579373  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2906  hypothetical protein  49.67 
 
 		 329 aa  292  6e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3113  hypothetical protein  86.88 
 
 		 207 aa  291  8e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2780  hypothetical protein  51.9 
 
 		 336 aa  291  1e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000960474  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2414  hypothetical protein  45 
 
 		 341 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.301389  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3200  hypothetical protein  45.51 
 
 		 344 aa  289  4e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.789239 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1700  protein of unknown function DUF1568  43.75 
 
 		 377 aa  289  5.0000000000000004e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0414346 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1945  protein of unknown function DUF1568  45 
 
 		 341 aa  288  7e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.499337 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1226  protein of unknown function DUF1568  46.56 
 
 		 341 aa  287  1e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.353731  hitchhiker  0.000000017845 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0856  hypothetical protein  47.63 
 
 		 347 aa  288  1e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2403  hypothetical protein  47.12 
 
 		 341 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.284659  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0910  hypothetical protein  46.23 
 
 		 344 aa  286  4e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0868  hypothetical protein  44.89 
 
 		 344 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2933  hypothetical protein  44.58 
 
 		 345 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.161086  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2840  protein of unknown function DUF1568  46.15 
 
 		 345 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0644633 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1178  hypothetical protein  46.35 
 
 		 344 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0303591  normal  0.0825627 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1697  hypothetical protein  46.47 
 
 		 349 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3682  hypothetical protein  70.88 
 
 		 198 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0562  hypothetical protein  45.24 
 
 		 370 aa  280  2e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0862774 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1126  hypothetical protein  46.03 
 
 		 344 aa  280  3e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.776641  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2480  hypothetical protein  45.71 
 
 		 344 aa  278  7e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02418  hypothetical protein  43.49 
 
 		 328 aa  276  4e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01831  hypothetical protein  50.77 
 
 		 271 aa  270  2.9999999999999997e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>