215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3773 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_3773  hypothetical protein  100 
 
 
325 aa  681    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.149988  hitchhiker  0.00126811 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1378  hypothetical protein  96.62 
 
 
325 aa  666    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599998 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2958  hypothetical protein  95.69 
 
 
325 aa  657    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4465  hypothetical protein  86.15 
 
 
325 aa  597  1e-170  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4749  hypothetical protein  86.38 
 
 
325 aa  595  1e-169  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.291957  hitchhiker  0.000564584 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3627  hypothetical protein  84.52 
 
 
325 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92162  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4299  hypothetical protein  84.21 
 
 
325 aa  581  1.0000000000000001e-165  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2922  hypothetical protein  77.95 
 
 
325 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1890  hypothetical protein  76.49 
 
 
325 aa  535  1e-151  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2555  hypothetical protein  75.08 
 
 
325 aa  535  1e-151  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00750734  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1241  hypothetical protein  74.15 
 
 
325 aa  531  1e-150  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4547  hypothetical protein  74.46 
 
 
325 aa  531  1e-150  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2299  hypothetical protein  74.77 
 
 
325 aa  532  1e-150  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.187044  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2402  hypothetical protein  74.46 
 
 
325 aa  531  1e-150  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.283143  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1510  hypothetical protein  73.85 
 
 
325 aa  527  1e-149  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3040  hypothetical protein  73.85 
 
 
325 aa  528  1e-149  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3447  hypothetical protein  73.85 
 
 
325 aa  528  1e-149  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4530  hypothetical protein  73.54 
 
 
325 aa  528  1e-149  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0957  hypothetical protein  74.69 
 
 
325 aa  530  1e-149  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00250015  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0135  hypothetical protein  74.69 
 
 
325 aa  528  1e-149  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1921  hypothetical protein  75.31 
 
 
325 aa  530  1e-149  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3681  hypothetical protein  76.4 
 
 
323 aa  528  1e-149  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3680  hypothetical protein  75.31 
 
 
325 aa  530  1e-149  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0670  hypothetical protein  74.15 
 
 
325 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1264  hypothetical protein  74.07 
 
 
325 aa  526  1e-148  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1547  hypothetical protein  72.92 
 
 
325 aa  527  1e-148  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3473  hypothetical protein  73.54 
 
 
325 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1511  hypothetical protein  74.22 
 
 
325 aa  525  1e-148  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2814  hypothetical protein  73.54 
 
 
325 aa  527  1e-148  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0116  hypothetical protein  73.23 
 
 
325 aa  521  1e-147  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1546  hypothetical protein  72.92 
 
 
326 aa  523  1e-147  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0606  hypothetical protein  74.69 
 
 
325 aa  522  1e-147  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2392  hypothetical protein  73.77 
 
 
325 aa  522  1e-147  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.134929  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0115  hypothetical protein  73.07 
 
 
325 aa  518  1e-146  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1861  hypothetical protein  73.56 
 
 
329 aa  518  1e-146  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.633128  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1812  hypothetical protein  74.76 
 
 
316 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2622  hypothetical protein  74.19 
 
 
319 aa  502  1e-141  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0144606  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3087  hypothetical protein  69.14 
 
 
325 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2653  hypothetical protein  71.16 
 
 
326 aa  491  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2785  hypothetical protein  68.83 
 
 
325 aa  490  1e-137  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0143634  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0196  hypothetical protein  71.16 
 
 
326 aa  488  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.157282 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1610  hypothetical protein  68.83 
 
 
325 aa  484  1e-136  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3084  hypothetical protein  67.9 
 
 
325 aa  480  1e-134  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2533  hypothetical protein  69.75 
 
 
326 aa  472  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0991372  normal  0.0595118 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0200  hypothetical protein  74.39 
 
 
293 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1948  hypothetical protein  65.52 
 
 
326 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.270103  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2414  hypothetical protein  68.52 
 
 
326 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.196776  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0052  hypothetical protein  60.82 
 
 
326 aa  432  1e-120  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.186799 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2307  hypothetical protein  61.13 
 
 
326 aa  434  1e-120  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3323  hypothetical protein  60.5 
 
 
325 aa  429  1e-119  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3091  hypothetical protein  59.87 
 
 
326 aa  425  1e-118  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0496594 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2628  hypothetical protein  62.07 
 
 
326 aa  424  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3356  hypothetical protein  55.59 
 
 
323 aa  378  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.526564  normal  0.864241 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2393  hypothetical protein  75.44 
 
 
238 aa  374  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0597783  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1385  hypothetical protein  53.35 
 
 
327 aa  345  5e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.868466  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1948  hypothetical protein  53.35 
 
 
327 aa  344  1e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.557873  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1848  hypothetical protein  53.04 
 
 
327 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4132  hypothetical protein  51.76 
 
 
327 aa  338  7e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3465  hypothetical protein  55.56 
 
 
325 aa  338  9e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0641119 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1735  hypothetical protein  52.72 
 
 
327 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0111  hypothetical protein  54.14 
 
 
325 aa  336  2.9999999999999997e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3074  CheW protein  54.51 
 
 
325 aa  335  5e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.464984  normal  0.367409 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0907  hypothetical protein  52.55 
 
 
327 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0248219  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0333  Type I secretion outer membrane protein, TolC  53.82 
 
 
325 aa  333  2e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0672756 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0282  hypothetical protein  49.84 
 
 
325 aa  323  2e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.822944  hitchhiker  0.00000243422 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0281  hypothetical protein  49.84 
 
 
325 aa  320  1.9999999999999998e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000015206 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0607  hypothetical protein  49.84 
 
 
325 aa  320  3e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3017  hypothetical protein  51.74 
 
 
325 aa  317  1e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0296678 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2943  histidine kinase  49.52 
 
 
325 aa  317  2e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1111  hypothetical protein  48.56 
 
 
327 aa  311  1e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0480419  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3041  hypothetical protein  77.22 
 
 
198 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3446  hypothetical protein  77.22 
 
 
198 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1856  hypothetical protein  46.09 
 
 
370 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3682  hypothetical protein  79.56 
 
 
198 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2838  hypothetical protein  75.27 
 
 
186 aa  300  3e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.579373  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2906  hypothetical protein  51 
 
 
329 aa  297  2e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0856  hypothetical protein  46.31 
 
 
347 aa  289  4e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3659  hypothetical protein  44.84 
 
 
347 aa  287  2e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02418  hypothetical protein  44.27 
 
 
328 aa  285  1.0000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2679  hypothetical protein  45.63 
 
 
336 aa  282  6.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0118762  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1700  protein of unknown function DUF1568  41.79 
 
 
377 aa  278  8e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0414346 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2414  hypothetical protein  45 
 
 
341 aa  278  9e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.301389  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1226  protein of unknown function DUF1568  45.31 
 
 
341 aa  277  1e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.353731  hitchhiker  0.000000017845 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01831  hypothetical protein  50.97 
 
 
271 aa  277  2e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2840  protein of unknown function DUF1568  44.69 
 
 
345 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0644633 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1945  protein of unknown function DUF1568  45 
 
 
341 aa  276  4e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.499337 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1436  protein of unknown function DUF1568  47.78 
 
 
341 aa  276  5e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3200  hypothetical protein  43.03 
 
 
344 aa  276  5e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.789239 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0868  hypothetical protein  44.27 
 
 
344 aa  276  5e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1697  hypothetical protein  45.31 
 
 
349 aa  275  8e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1178  hypothetical protein  43.96 
 
 
344 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0303591  normal  0.0825627 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0499  hypothetical protein  73.37 
 
 
186 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0910  hypothetical protein  43.65 
 
 
344 aa  273  3e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2403  hypothetical protein  44.38 
 
 
341 aa  272  6e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.284659  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2933  hypothetical protein  44.28 
 
 
345 aa  271  8.000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.161086  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0562  hypothetical protein  41.98 
 
 
370 aa  271  1e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0862774 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1126  hypothetical protein  43.65 
 
 
344 aa  271  1e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.776641  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2480  hypothetical protein  42.72 
 
 
344 aa  268  1e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2780  hypothetical protein  45.33 
 
 
336 aa  262  4.999999999999999e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000960474  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02306  hypothetical protein  42.12 
 
 
324 aa  262  6e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.334783  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>