184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2628 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_2628  hypothetical protein  100 
 
 
326 aa  682    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1948  hypothetical protein  72.39 
 
 
326 aa  509  1e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.270103  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0196  hypothetical protein  69.02 
 
 
326 aa  481  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.157282 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2653  hypothetical protein  68.4 
 
 
326 aa  476  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3323  hypothetical protein  67.49 
 
 
325 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0052  hypothetical protein  65.94 
 
 
326 aa  464  9.999999999999999e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.186799 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3091  hypothetical protein  65.63 
 
 
326 aa  465  9.999999999999999e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0496594 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0135  hypothetical protein  66.46 
 
 
325 aa  461  1e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1921  hypothetical protein  67.71 
 
 
325 aa  462  1e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3680  hypothetical protein  67.71 
 
 
325 aa  462  1e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2307  hypothetical protein  65.63 
 
 
326 aa  460  9.999999999999999e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2402  hypothetical protein  64.29 
 
 
325 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.283143  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2814  hypothetical protein  65.22 
 
 
325 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0115  hypothetical protein  64.29 
 
 
325 aa  449  1e-125  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1547  hypothetical protein  63.98 
 
 
325 aa  448  1e-125  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4530  hypothetical protein  64.29 
 
 
325 aa  449  1e-125  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4547  hypothetical protein  64.6 
 
 
325 aa  449  1e-125  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2392  hypothetical protein  65.52 
 
 
325 aa  451  1e-125  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.134929  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2785  hypothetical protein  65.2 
 
 
325 aa  450  1e-125  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0143634  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3087  hypothetical protein  64.89 
 
 
325 aa  449  1e-125  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2299  hypothetical protein  65.22 
 
 
325 aa  450  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.187044  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1890  hypothetical protein  65.12 
 
 
325 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3040  hypothetical protein  63.98 
 
 
325 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3447  hypothetical protein  63.98 
 
 
325 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0670  hypothetical protein  64.29 
 
 
325 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1610  hypothetical protein  64.89 
 
 
325 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3084  hypothetical protein  65.2 
 
 
325 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2555  hypothetical protein  64.29 
 
 
325 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00750734  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1511  hypothetical protein  64.89 
 
 
325 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1264  hypothetical protein  64.58 
 
 
325 aa  442  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1241  hypothetical protein  64.26 
 
 
325 aa  441  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1510  hypothetical protein  64.26 
 
 
325 aa  443  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1546  hypothetical protein  64.29 
 
 
326 aa  443  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3473  hypothetical protein  63.04 
 
 
325 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0116  hypothetical protein  63.32 
 
 
325 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4465  hypothetical protein  63.32 
 
 
325 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0957  hypothetical protein  64.26 
 
 
325 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00250015  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3681  hypothetical protein  63.44 
 
 
323 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0606  hypothetical protein  64.89 
 
 
325 aa  432  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2922  hypothetical protein  62.23 
 
 
325 aa  434  1e-120  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1378  hypothetical protein  62.7 
 
 
325 aa  431  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599998 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1812  hypothetical protein  64.72 
 
 
316 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2533  hypothetical protein  66.14 
 
 
326 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0991372  normal  0.0595118 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2622  hypothetical protein  63.78 
 
 
319 aa  429  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0144606  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3627  hypothetical protein  63.01 
 
 
325 aa  429  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92162  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3773  hypothetical protein  62.07 
 
 
325 aa  424  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.149988  hitchhiker  0.00126811 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4299  hypothetical protein  62.7 
 
 
325 aa  426  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2958  hypothetical protein  62.07 
 
 
325 aa  426  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4749  hypothetical protein  62.07 
 
 
325 aa  421  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.291957  hitchhiker  0.000564584 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1861  hypothetical protein  61.66 
 
 
329 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.633128  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2414  hypothetical protein  65.2 
 
 
326 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.196776  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0200  hypothetical protein  65.85 
 
 
293 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3356  hypothetical protein  57.23 
 
 
323 aa  389  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.526564  normal  0.864241 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1848  hypothetical protein  55.97 
 
 
327 aa  365  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1385  hypothetical protein  55.7 
 
 
327 aa  364  1e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.868466  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1948  hypothetical protein  54.75 
 
 
327 aa  362  4e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.557873  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4132  hypothetical protein  54.11 
 
 
327 aa  360  2e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0907  hypothetical protein  55.52 
 
 
327 aa  358  6e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0248219  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1735  hypothetical protein  54.11 
 
 
327 aa  355  3.9999999999999996e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3465  hypothetical protein  53.7 
 
 
325 aa  350  2e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0641119 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3017  hypothetical protein  53.61 
 
 
325 aa  348  9e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0296678 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0111  hypothetical protein  54.31 
 
 
325 aa  346  3e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0333  Type I secretion outer membrane protein, TolC  52.17 
 
 
325 aa  345  8.999999999999999e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0672756 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3074  CheW protein  53.46 
 
 
325 aa  344  1e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.464984  normal  0.367409 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0282  hypothetical protein  52.53 
 
 
325 aa  332  4e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.822944  hitchhiker  0.00000243422 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0281  hypothetical protein  51.9 
 
 
325 aa  327  2.0000000000000001e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000015206 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2943  histidine kinase  52.22 
 
 
325 aa  325  8.000000000000001e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0607  hypothetical protein  51.58 
 
 
325 aa  324  1e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1111  hypothetical protein  49.07 
 
 
327 aa  324  1e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0480419  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2393  hypothetical protein  66.52 
 
 
238 aa  318  7e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0597783  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1436  protein of unknown function DUF1568  53.61 
 
 
341 aa  312  4.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1856  hypothetical protein  45.71 
 
 
370 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0856  hypothetical protein  48.73 
 
 
347 aa  305  8.000000000000001e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2840  protein of unknown function DUF1568  47.16 
 
 
345 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0644633 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3659  hypothetical protein  47.2 
 
 
347 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1697  hypothetical protein  47.16 
 
 
349 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2906  hypothetical protein  50.16 
 
 
329 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2780  hypothetical protein  52.07 
 
 
336 aa  301  1e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000960474  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2679  hypothetical protein  48.54 
 
 
336 aa  298  6e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0118762  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0868  hypothetical protein  49.21 
 
 
344 aa  298  9e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1178  hypothetical protein  46.75 
 
 
344 aa  297  2e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0303591  normal  0.0825627 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3200  hypothetical protein  47.3 
 
 
344 aa  297  2e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.789239 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0910  hypothetical protein  46.13 
 
 
344 aa  295  6e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2480  hypothetical protein  46.75 
 
 
344 aa  295  7e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1126  hypothetical protein  46.44 
 
 
344 aa  293  2e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.776641  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02418  hypothetical protein  46.77 
 
 
328 aa  293  3e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2403  hypothetical protein  46.88 
 
 
341 aa  290  3e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.284659  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2414  hypothetical protein  47.76 
 
 
341 aa  290  3e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.301389  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2933  hypothetical protein  45.68 
 
 
345 aa  289  4e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.161086  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1945  protein of unknown function DUF1568  47.76 
 
 
341 aa  288  8e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.499337 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1226  protein of unknown function DUF1568  44.97 
 
 
341 aa  288  9e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.353731  hitchhiker  0.000000017845 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0562  hypothetical protein  45.51 
 
 
370 aa  277  2e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0862774 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1700  protein of unknown function DUF1568  43.62 
 
 
377 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0414346 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02306  hypothetical protein  42.86 
 
 
324 aa  269  5.9999999999999995e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.334783  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01831  hypothetical protein  50.37 
 
 
271 aa  267  2e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2838  hypothetical protein  67.78 
 
 
186 aa  263  3e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.579373  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2324  Elongator protein 3/MiaB/NifB  58.94 
 
 
208 aa  259  5.0000000000000005e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0123865 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3299  hypothetical protein  56.81 
 
 
213 aa  258  1e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3041  hypothetical protein  63.89 
 
 
198 aa  253  3e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3446  hypothetical protein  63.89 
 
 
198 aa  253  3e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>