174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1948 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0907  hypothetical protein  91.74 
 
 		 327 aa  643    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0248219  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1385  hypothetical protein  91.74 
 
 		 327 aa  650    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.868466  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1735  hypothetical protein  93.88 
 
 		 327 aa  652    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1848  hypothetical protein  92.66 
 
 		 327 aa  648    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1948  hypothetical protein  100 
 
 		 327 aa  693    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.557873  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4132  hypothetical protein  93.27 
 
 		 327 aa  657    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1111  hypothetical protein  77.06 
 
 		 327 aa  553  1e-156  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0480419  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3356  hypothetical protein  58.15 
 
 		 323 aa  393  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.526564  normal  0.864241 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3074  CheW protein  54.63 
 
 		 325 aa  381  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.464984  normal  0.367409 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0135  hypothetical protein  58.79 
 
 		 325 aa  381  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0111  hypothetical protein  53.7 
 
 		 325 aa  377  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3017  hypothetical protein  54.32 
 
 		 325 aa  375  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0296678 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3465  hypothetical protein  53.7 
 
 		 325 aa  375  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0641119 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1921  hypothetical protein  58.15 
 
 		 325 aa  377  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3680  hypothetical protein  58.15 
 
 		 325 aa  377  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0052  hypothetical protein  56.92 
 
 		 326 aa  377  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.186799 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3091  hypothetical protein  56.13 
 
 		 326 aa  376  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0496594 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1948  hypothetical protein  54.43 
 
 		 326 aa  374  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.270103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2392  hypothetical protein  57.19 
 
 		 325 aa  374  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.134929  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1890  hypothetical protein  57.19 
 
 		 325 aa  368  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0282  hypothetical protein  53.7 
 
 		 325 aa  369  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.822944  hitchhiker  0.00000243422 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0333  Type I secretion outer membrane protein, TolC  53.7 
 
 		 325 aa  371  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0672756 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1610  hypothetical protein  56.23 
 
 		 325 aa  370  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3084  hypothetical protein  56.55 
 
 		 325 aa  370  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3087  hypothetical protein  55.91 
 
 		 325 aa  370  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0116  hypothetical protein  57.51 
 
 		 325 aa  367  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2785  hypothetical protein  55.59 
 
 		 325 aa  367  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0143634  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3323  hypothetical protein  55.27 
 
 		 325 aa  367  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2299  hypothetical protein  58.15 
 
 		 325 aa  366  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.187044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2402  hypothetical protein  57.51 
 
 		 325 aa  365  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.283143  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2307  hypothetical protein  55.08 
 
 		 326 aa  366  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0196  hypothetical protein  55.35 
 
 		 326 aa  366  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.157282 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0957  hypothetical protein  56.69 
 
 		 325 aa  365  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00250015  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0607  hypothetical protein  53.7 
 
 		 325 aa  364  1e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1264  hypothetical protein  56.37 
 
 		 325 aa  364  1e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0670  hypothetical protein  57.32 
 
 		 325 aa  363  2e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0281  hypothetical protein  53.09 
 
 		 325 aa  363  2e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015206 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2943  histidine kinase  53.4 
 
 		 325 aa  363  2e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2555  hypothetical protein  57.51 
 
 		 325 aa  363  2e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00750734  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4547  hypothetical protein  56.23 
 
 		 325 aa  363  3e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2628  hypothetical protein  54.75 
 
 		 326 aa  362  4e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2814  hypothetical protein  57.83 
 
 		 325 aa  362  4e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2653  hypothetical protein  56.01 
 
 		 326 aa  362  4e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0115  hypothetical protein  56.87 
 
 		 325 aa  362  7.0000000000000005e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1812  hypothetical protein  57.61 
 
 		 316 aa  361  9e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3040  hypothetical protein  56.55 
 
 		 325 aa  360  1e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3447  hypothetical protein  56.55 
 
 		 325 aa  360  1e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1511  hypothetical protein  56.87 
 
 		 325 aa  360  1e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1510  hypothetical protein  56.55 
 
 		 325 aa  360  2e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4530  hypothetical protein  56.23 
 
 		 325 aa  360  2e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0606  hypothetical protein  56.69 
 
 		 325 aa  360  2e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1241  hypothetical protein  56.87 
 
 		 325 aa  360  3e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1547  hypothetical protein  55.59 
 
 		 325 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4465  hypothetical protein  54.31 
 
 		 325 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3473  hypothetical protein  56.05 
 
 		 325 aa  355  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1546  hypothetical protein  54.95 
 
 		 326 aa  354  8.999999999999999e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3681  hypothetical protein  54.78 
 
 		 323 aa  352  5e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2958  hypothetical protein  53.99 
 
 		 325 aa  350  1e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1378  hypothetical protein  53.99 
 
 		 325 aa  350  2e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000599998 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2922  hypothetical protein  53.82 
 
 		 325 aa  350  2e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2533  hypothetical protein  53.99 
 
 		 326 aa  348  8e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0991372  normal  0.0595118 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3773  hypothetical protein  53.35 
 
 		 325 aa  344  1e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.149988  hitchhiker  0.00126811 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02418  hypothetical protein  52.16 
 
 		 328 aa  344  1e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4299  hypothetical protein  52.4 
 
 		 325 aa  342  4e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1861  hypothetical protein  55.03 
 
 		 329 aa  340  2e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.633128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2622  hypothetical protein  56.33 
 
 		 319 aa  340  2e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0144606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3627  hypothetical protein  52.08 
 
 		 325 aa  338  5e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4749  hypothetical protein  52.4 
 
 		 325 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.291957  hitchhiker  0.000564584 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2414  hypothetical protein  52 
 
 		 326 aa  330  2e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.196776  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1856  hypothetical protein  44.85 
 
 		 370 aa  326  3e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2679  hypothetical protein  52.27 
 
 		 336 aa  325  6e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0118762  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0200  hypothetical protein  56.83 
 
 		 293 aa  323  2e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01831  hypothetical protein  54.61 
 
 		 271 aa  306  2.0000000000000002e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0562  hypothetical protein  43.68 
 
 		 370 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0862774 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2840  protein of unknown function DUF1568  45.56 
 
 		 345 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0644633 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3659  hypothetical protein  46.18 
 
 		 347 aa  300  2e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1178  hypothetical protein  44.74 
 
 		 344 aa  300  3e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0303591  normal  0.0825627 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1697  hypothetical protein  43.79 
 
 		 349 aa  298  7e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0868  hypothetical protein  44.15 
 
 		 344 aa  298  1e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0910  hypothetical protein  44.15 
 
 		 344 aa  297  2e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1436  protein of unknown function DUF1568  49.66 
 
 		 341 aa  296  2e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2414  hypothetical protein  44.25 
 
 		 341 aa  297  2e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.301389  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1126  hypothetical protein  44.44 
 
 		 344 aa  296  4e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.776641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3200  hypothetical protein  44.15 
 
 		 344 aa  294  1e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.789239 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2906  hypothetical protein  45.45 
 
 		 329 aa  294  1e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1945  protein of unknown function DUF1568  43.95 
 
 		 341 aa  293  2e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.499337 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2403  hypothetical protein  43.66 
 
 		 341 aa  293  2e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.284659  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2933  hypothetical protein  42.23 
 
 		 345 aa  290  2e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.161086  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1226  protein of unknown function DUF1568  43.95 
 
 		 341 aa  290  3e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.353731  hitchhiker  0.000000017845 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2480  hypothetical protein  43.57 
 
 		 344 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1890  hypothetical protein  89.12 
 
 		 147 aa  287  1e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0896786  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0856  hypothetical protein  42.27 
 
 		 347 aa  288  1e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1700  protein of unknown function DUF1568  41.67 
 
 		 377 aa  282  5.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0414346 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2780  hypothetical protein  47.77 
 
 		 336 aa  279  4e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000960474  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1902  hypothetical protein  87.76 
 
 		 147 aa  276  2e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.266524  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02306  hypothetical protein  45.45 
 
 		 324 aa  276  4e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.334783  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2324  Elongator protein 3/MiaB/NifB  59.51 
 
 		 208 aa  265  5.999999999999999e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0123865 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3299  hypothetical protein  55.98 
 
 		 213 aa  252  7e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2393  hypothetical protein  56.68 
 
 		 238 aa  250  2e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0597783  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3682  hypothetical protein  56.44 
 
 		 198 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>