107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1902 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1902  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  311  1.9999999999999998e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.266524  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1890  hypothetical protein  94.56 
 
 		 147 aa  292  1e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0896786  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1735  hypothetical protein  93.2 
 
 		 327 aa  288  1e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4132  hypothetical protein  91.84 
 
 		 327 aa  287  4e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1385  hypothetical protein  91.84 
 
 		 327 aa  285  1e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.868466  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1948  hypothetical protein  87.76 
 
 		 327 aa  276  5e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.557873  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1848  hypothetical protein  86.39 
 
 		 327 aa  267  4e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0907  hypothetical protein  86.39 
 
 		 327 aa  266  7e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0248219  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0882  hypothetical protein  71.92 
 
 		 153 aa  226  1e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1111  hypothetical protein  68.71 
 
 		 327 aa  220  4e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0480419  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3074  CheW protein  51.39 
 
 		 325 aa  150  4e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.464984  normal  0.367409 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0111  hypothetical protein  56.56 
 
 		 325 aa  149  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3465  hypothetical protein  51.06 
 
 		 325 aa  149  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0641119 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3017  hypothetical protein  50 
 
 		 325 aa  147  6e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0296678 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0282  hypothetical protein  47.22 
 
 		 325 aa  140  7e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.822944  hitchhiker  0.00000243422 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0333  Type I secretion outer membrane protein, TolC  47.92 
 
 		 325 aa  139  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0672756 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0135  hypothetical protein  52.63 
 
 		 325 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0200  hypothetical protein  52.63 
 
 		 293 aa  137  6e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0281  hypothetical protein  47.22 
 
 		 325 aa  136  7.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015206 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2943  histidine kinase  46.53 
 
 		 325 aa  136  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0196  hypothetical protein  50.74 
 
 		 326 aa  136  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.157282 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0607  hypothetical protein  46.53 
 
 		 325 aa  135  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1921  hypothetical protein  52.63 
 
 		 325 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3680  hypothetical protein  52.63 
 
 		 325 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1890  hypothetical protein  51.88 
 
 		 325 aa  134  5e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1948  hypothetical protein  48.53 
 
 		 326 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.270103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2653  hypothetical protein  50 
 
 		 326 aa  133  7.000000000000001e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2393  hypothetical protein  50.38 
 
 		 238 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0597783  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01831  hypothetical protein  47.22 
 
 		 271 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2392  hypothetical protein  50.38 
 
 		 325 aa  131  3e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.134929  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0116  hypothetical protein  50.38 
 
 		 325 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0115  hypothetical protein  50.38 
 
 		 325 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2555  hypothetical protein  50.38 
 
 		 325 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00750734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2402  hypothetical protein  51.13 
 
 		 325 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.283143  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0957  hypothetical protein  50.38 
 
 		 325 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00250015  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3040  hypothetical protein  49.62 
 
 		 325 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3447  hypothetical protein  49.62 
 
 		 325 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0052  hypothetical protein  47.22 
 
 		 326 aa  127  5.0000000000000004e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.186799 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1264  hypothetical protein  49.62 
 
 		 325 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4547  hypothetical protein  50.38 
 
 		 325 aa  127  6e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3113  hypothetical protein  49.62 
 
 		 207 aa  127  6e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3356  hypothetical protein  47.37 
 
 		 323 aa  127  7.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.526564  normal  0.864241 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2299  hypothetical protein  50.38 
 
 		 325 aa  126  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.187044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1610  hypothetical protein  50 
 
 		 325 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3084  hypothetical protein  50 
 
 		 325 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3323  hypothetical protein  47.37 
 
 		 325 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2814  hypothetical protein  51.13 
 
 		 325 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3091  hypothetical protein  46.21 
 
 		 326 aa  126  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0496594 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0670  hypothetical protein  49.62 
 
 		 325 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0499  hypothetical protein  48.12 
 
 		 186 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1241  hypothetical protein  49.62 
 
 		 325 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4530  hypothetical protein  48.87 
 
 		 325 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3087  hypothetical protein  49.25 
 
 		 325 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2622  hypothetical protein  49.62 
 
 		 319 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0144606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4749  hypothetical protein  48.12 
 
 		 325 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.291957  hitchhiker  0.000564584 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3627  hypothetical protein  47.37 
 
 		 325 aa  124  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92162  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1547  hypothetical protein  48.12 
 
 		 325 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1511  hypothetical protein  48.12 
 
 		 325 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3473  hypothetical protein  49.62 
 
 		 325 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1812  hypothetical protein  50.78 
 
 		 316 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1861  hypothetical protein  49.62 
 
 		 329 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.633128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0606  hypothetical protein  49.62 
 
 		 325 aa  124  6e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2307  hypothetical protein  45.83 
 
 		 326 aa  123  7e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1510  hypothetical protein  48.87 
 
 		 325 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2958  hypothetical protein  47.37 
 
 		 325 aa  123  9e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2785  hypothetical protein  46.62 
 
 		 325 aa  123  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0143634  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1378  hypothetical protein  47.37 
 
 		 325 aa  122  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000599998 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4465  hypothetical protein  47.37 
 
 		 325 aa  122  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4299  hypothetical protein  46.62 
 
 		 325 aa  122  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1546  hypothetical protein  46.62 
 
 		 326 aa  121  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2628  hypothetical protein  46.32 
 
 		 326 aa  121  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3773  hypothetical protein  46.62 
 
 		 325 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.149988  hitchhiker  0.00126811 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2922  hypothetical protein  44.36 
 
 		 325 aa  113  6.9999999999999995e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2838  hypothetical protein  43.61 
 
 		 186 aa  111  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.579373  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3681  hypothetical protein  43.61 
 
 		 323 aa  110  5e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2414  hypothetical protein  40.97 
 
 		 326 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.196776  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2679  hypothetical protein  46.09 
 
 		 336 aa  103  6e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0118762  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2533  hypothetical protein  43.61 
 
 		 326 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0991372  normal  0.0595118 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1856  hypothetical protein  30.6 
 
 		 370 aa  94  6e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2414  hypothetical protein  33.96 
 
 		 341 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.301389  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1945  protein of unknown function DUF1568  33.96 
 
 		 341 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.499337 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1178  hypothetical protein  34.57 
 
 		 344 aa  87.8  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0303591  normal  0.0825627 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2933  hypothetical protein  33.54 
 
 		 345 aa  87.8  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.161086  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1126  hypothetical protein  34.57 
 
 		 344 aa  87.8  5e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.776641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2403  hypothetical protein  33.33 
 
 		 341 aa  87.8  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.284659  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2840  protein of unknown function DUF1568  34.18 
 
 		 345 aa  87  7e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0644633 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0910  hypothetical protein  33.95 
 
 		 344 aa  86.3  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2325  molybdopterin binding domain-containing protein  40.4 
 
 		 100 aa  86.3  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0107016 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1541  hypothetical protein  33.54 
 
 		 209 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1697  hypothetical protein  32.91 
 
 		 349 aa  85.5  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2906  hypothetical protein  33.56 
 
 		 329 aa  85.9  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0868  hypothetical protein  32.72 
 
 		 344 aa  85.9  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3200  hypothetical protein  33.33 
 
 		 344 aa  84.7  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.789239 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1226  protein of unknown function DUF1568  33.33 
 
 		 341 aa  84  6e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.353731  hitchhiker  0.000000017845 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0856  hypothetical protein  32.52 
 
 		 347 aa  84  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2480  hypothetical protein  32.52 
 
 		 344 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3659  hypothetical protein  31.9 
 
 		 347 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1436  protein of unknown function DUF1568  41.44 
 
 		 341 aa  79.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1700  protein of unknown function DUF1568  31.25 
 
 		 377 aa  76.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0414346 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02418  hypothetical protein  34.03 
 
 		 328 aa  73.2  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>