193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1890 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1890  hypothetical protein  100 
 
 		 325 aa  681    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0670  hypothetical protein  89.2 
 
 		 325 aa  615  1e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2555  hypothetical protein  88.62 
 
 		 325 aa  614  1e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00750734  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1546  hypothetical protein  88.31 
 
 		 326 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2299  hypothetical protein  88.62 
 
 		 325 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.187044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1511  hypothetical protein  89.44 
 
 		 325 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2402  hypothetical protein  88.58 
 
 		 325 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.283143  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0957  hypothetical protein  88.31 
 
 		 325 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00250015  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1264  hypothetical protein  87.69 
 
 		 325 aa  608  1e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1547  hypothetical protein  87.96 
 
 		 325 aa  609  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3040  hypothetical protein  88.27 
 
 		 325 aa  608  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3447  hypothetical protein  88.27 
 
 		 325 aa  608  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4530  hypothetical protein  87.96 
 
 		 325 aa  608  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4547  hypothetical protein  87.65 
 
 		 325 aa  610  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0606  hypothetical protein  87.69 
 
 		 325 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3473  hypothetical protein  87.38 
 
 		 325 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0116  hypothetical protein  88.24 
 
 		 325 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1510  hypothetical protein  88.82 
 
 		 325 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0115  hypothetical protein  87.93 
 
 		 325 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1241  hypothetical protein  86.77 
 
 		 325 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2814  hypothetical protein  86.77 
 
 		 325 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1812  hypothetical protein  91.26 
 
 		 316 aa  596  1e-169  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1861  hypothetical protein  87.23 
 
 		 329 aa  596  1e-169  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.633128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2622  hypothetical protein  88.75 
 
 		 319 aa  585  1e-166  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0144606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0135  hypothetical protein  81.06 
 
 		 325 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1921  hypothetical protein  80.92 
 
 		 325 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3680  hypothetical protein  80.92 
 
 		 325 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2392  hypothetical protein  79.38 
 
 		 325 aa  566  1e-160  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.134929  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4299  hypothetical protein  76.92 
 
 		 325 aa  549  1e-155  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3627  hypothetical protein  76 
 
 		 325 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1378  hypothetical protein  77.43 
 
 		 325 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000599998 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2958  hypothetical protein  76.4 
 
 		 325 aa  536  1e-151  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3773  hypothetical protein  76.49 
 
 		 325 aa  535  1e-151  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.149988  hitchhiker  0.00126811 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4749  hypothetical protein  75.38 
 
 		 325 aa  537  1e-151  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.291957  hitchhiker  0.000564584 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0200  hypothetical protein  86.41 
 
 		 293 aa  528  1e-149  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2922  hypothetical protein  73.91 
 
 		 325 aa  523  1e-147  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4465  hypothetical protein  72.98 
 
 		 325 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1610  hypothetical protein  72.98 
 
 		 325 aa  511  1e-144  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3087  hypothetical protein  72.98 
 
 		 325 aa  513  1e-144  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3681  hypothetical protein  72.36 
 
 		 323 aa  508  1e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2785  hypothetical protein  71.43 
 
 		 325 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0143634  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3084  hypothetical protein  71.74 
 
 		 325 aa  502  1e-141  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2653  hypothetical protein  72.7 
 
 		 326 aa  502  1e-141  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0196  hypothetical protein  72.09 
 
 		 326 aa  498  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.157282 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2533  hypothetical protein  73.54 
 
 		 326 aa  496  1e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0991372  normal  0.0595118 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1948  hypothetical protein  70.53 
 
 		 326 aa  484  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.270103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2414  hypothetical protein  72.67 
 
 		 326 aa  472  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.196776  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0052  hypothetical protein  65.94 
 
 		 326 aa  457  9.999999999999999e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.186799 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3323  hypothetical protein  65.62 
 
 		 325 aa  457  1e-127  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2307  hypothetical protein  66.25 
 
 		 326 aa  456  1e-127  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3091  hypothetical protein  65.62 
 
 		 326 aa  453  1.0000000000000001e-126  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0496594 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2628  hypothetical protein  65.12 
 
 		 326 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2393  hypothetical protein  86.03 
 
 		 238 aa  423  1e-117  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0597783  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3356  hypothetical protein  55.91 
 
 		 323 aa  378  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.526564  normal  0.864241 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1385  hypothetical protein  57.51 
 
 		 327 aa  369  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.868466  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1948  hypothetical protein  57.19 
 
 		 327 aa  368  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.557873  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1848  hypothetical protein  57.19 
 
 		 327 aa  366  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0907  hypothetical protein  56.69 
 
 		 327 aa  362  4e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0248219  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1735  hypothetical protein  56.23 
 
 		 327 aa  362  6e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4132  hypothetical protein  55.59 
 
 		 327 aa  361  9e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3041  hypothetical protein  91.67 
 
 		 198 aa  354  8.999999999999999e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3446  hypothetical protein  91.67 
 
 		 198 aa  354  8.999999999999999e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3465  hypothetical protein  56.6 
 
 		 325 aa  345  5e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0641119 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0111  hypothetical protein  55.9 
 
 		 325 aa  344  1e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0333  Type I secretion outer membrane protein, TolC  54.86 
 
 		 325 aa  344  1e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0672756 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3074  CheW protein  55.9 
 
 		 325 aa  344  1e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.464984  normal  0.367409 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1111  hypothetical protein  51.44 
 
 		 327 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0480419  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0282  hypothetical protein  54.14 
 
 		 325 aa  332  6e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.822944  hitchhiker  0.00000243422 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0281  hypothetical protein  50.8 
 
 		 325 aa  327  2.0000000000000001e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015206 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2943  histidine kinase  50.8 
 
 		 325 aa  325  4.0000000000000003e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0607  hypothetical protein  50.48 
 
 		 325 aa  324  1e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3017  hypothetical protein  52.78 
 
 		 325 aa  322  5e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0296678 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1856  hypothetical protein  47.99 
 
 		 370 aa  318  6e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1436  protein of unknown function DUF1568  53.92 
 
 		 341 aa  311  1e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0499  hypothetical protein  84.8 
 
 		 186 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2838  hypothetical protein  75.27 
 
 		 186 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.579373  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2679  hypothetical protein  49.34 
 
 		 336 aa  297  2e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0118762  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3659  hypothetical protein  47.22 
 
 		 347 aa  295  8e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2906  hypothetical protein  50 
 
 		 329 aa  293  4e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2780  hypothetical protein  50.34 
 
 		 336 aa  291  9e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000960474  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0856  hypothetical protein  47.63 
 
 		 347 aa  290  2e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3682  hypothetical protein  72.53 
 
 		 198 aa  287  1e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1700  protein of unknown function DUF1568  43.38 
 
 		 377 aa  287  2e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0414346 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2414  hypothetical protein  45.94 
 
 		 341 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.301389  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3200  hypothetical protein  44.89 
 
 		 344 aa  287  2e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.789239 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1945  protein of unknown function DUF1568  45.94 
 
 		 341 aa  285  5e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.499337 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2403  hypothetical protein  46.79 
 
 		 341 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.284659  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0910  hypothetical protein  46.67 
 
 		 344 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0868  hypothetical protein  44.58 
 
 		 344 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1226  protein of unknown function DUF1568  45.62 
 
 		 341 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.353731  hitchhiker  0.000000017845 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2840  protein of unknown function DUF1568  45.83 
 
 		 345 aa  281  9e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0644633 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0562  hypothetical protein  44.97 
 
 		 370 aa  281  1e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0862774 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1697  hypothetical protein  46.15 
 
 		 349 aa  280  2e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1178  hypothetical protein  45.71 
 
 		 344 aa  280  2e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0303591  normal  0.0825627 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2933  hypothetical protein  43.96 
 
 		 345 aa  279  4e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.161086  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2480  hypothetical protein  45.4 
 
 		 344 aa  278  1e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1126  hypothetical protein  45.4 
 
 		 344 aa  277  2e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.776641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02418  hypothetical protein  43.81 
 
 		 328 aa  277  2e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3113  hypothetical protein  82.39 
 
 		 207 aa  277  2e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02306  hypothetical protein  44.86 
 
 		 324 aa  276  3e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.334783  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>