179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1241 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0115  hypothetical protein  96 
 
 		 325 aa  654    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0116  hypothetical protein  96.62 
 
 		 325 aa  662    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1241  hypothetical protein  100 
 
 		 325 aa  680    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1510  hypothetical protein  94.15 
 
 		 325 aa  642    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1546  hypothetical protein  92 
 
 		 326 aa  639    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1547  hypothetical protein  94.77 
 
 		 325 aa  647    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3040  hypothetical protein  95.08 
 
 		 325 aa  651    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3447  hypothetical protein  95.08 
 
 		 325 aa  651    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4530  hypothetical protein  93.85 
 
 		 325 aa  645    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4547  hypothetical protein  92.31 
 
 		 325 aa  636    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2299  hypothetical protein  94.15 
 
 		 325 aa  649    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.187044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2555  hypothetical protein  92.92 
 
 		 325 aa  635    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00750734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2402  hypothetical protein  93.85 
 
 		 325 aa  642    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.283143  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1511  hypothetical protein  92.31 
 
 		 325 aa  632  1e-180  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2814  hypothetical protein  92.31 
 
 		 325 aa  633  1e-180  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0670  hypothetical protein  91.08 
 
 		 325 aa  626  1e-178  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3473  hypothetical protein  90.15 
 
 		 325 aa  622  1e-177  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0606  hypothetical protein  89.54 
 
 		 325 aa  615  1e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1861  hypothetical protein  89.36 
 
 		 329 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.633128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2622  hypothetical protein  92.06 
 
 		 319 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0144606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0957  hypothetical protein  87.35 
 
 		 325 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00250015  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1890  hypothetical protein  86.77 
 
 		 325 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1264  hypothetical protein  87.04 
 
 		 325 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1812  hypothetical protein  90.94 
 
 		 316 aa  590  1e-168  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0135  hypothetical protein  80.43 
 
 		 325 aa  557  1e-157  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1921  hypothetical protein  78.77 
 
 		 325 aa  550  1e-155  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3680  hypothetical protein  78.77 
 
 		 325 aa  550  1e-155  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2392  hypothetical protein  77.23 
 
 		 325 aa  541  1e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.134929  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2958  hypothetical protein  75.69 
 
 		 325 aa  535  1e-151  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1378  hypothetical protein  75.69 
 
 		 325 aa  535  1e-151  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000599998 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3773  hypothetical protein  74.15 
 
 		 325 aa  531  1e-150  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.149988  hitchhiker  0.00126811 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4299  hypothetical protein  75.47 
 
 		 325 aa  529  1e-149  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3627  hypothetical protein  74.53 
 
 		 325 aa  521  1e-147  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4749  hypothetical protein  73.91 
 
 		 325 aa  518  1e-146  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.291957  hitchhiker  0.000564584 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4465  hypothetical protein  73.23 
 
 		 325 aa  518  1e-146  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3681  hypothetical protein  73.99 
 
 		 323 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2922  hypothetical protein  73.91 
 
 		 325 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2653  hypothetical protein  74.53 
 
 		 326 aa  512  1e-144  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0200  hypothetical protein  84.67 
 
 		 293 aa  511  1e-144  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3087  hypothetical protein  72 
 
 		 325 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1610  hypothetical protein  72 
 
 		 325 aa  503  1e-141  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2785  hypothetical protein  71.69 
 
 		 325 aa  503  1e-141  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0143634  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0196  hypothetical protein  73.29 
 
 		 326 aa  504  1e-141  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.157282 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2533  hypothetical protein  76.71 
 
 		 326 aa  501  1e-141  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0991372  normal  0.0595118 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3084  hypothetical protein  71.38 
 
 		 325 aa  498  1e-140  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1948  hypothetical protein  68.94 
 
 		 326 aa  481  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.270103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2414  hypothetical protein  74.46 
 
 		 326 aa  478  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.196776  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2307  hypothetical protein  67.08 
 
 		 326 aa  464  9.999999999999999e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3323  hypothetical protein  65.84 
 
 		 325 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0052  hypothetical protein  65.22 
 
 		 326 aa  459  9.999999999999999e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.186799 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3091  hypothetical protein  65.22 
 
 		 326 aa  451  1.0000000000000001e-126  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0496594 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2628  hypothetical protein  64.26 
 
 		 326 aa  441  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2393  hypothetical protein  82.1 
 
 		 238 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0597783  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3356  hypothetical protein  56.23 
 
 		 323 aa  372  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.526564  normal  0.864241 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1385  hypothetical protein  57.19 
 
 		 327 aa  360  1e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.868466  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1948  hypothetical protein  56.87 
 
 		 327 aa  360  3e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.557873  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1848  hypothetical protein  56.87 
 
 		 327 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3041  hypothetical protein  92.22 
 
 		 198 aa  355  3.9999999999999996e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3446  hypothetical protein  92.22 
 
 		 198 aa  355  3.9999999999999996e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0907  hypothetical protein  56.37 
 
 		 327 aa  353  2e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0248219  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4132  hypothetical protein  55.27 
 
 		 327 aa  352  4e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1735  hypothetical protein  55.59 
 
 		 327 aa  351  8e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3465  hypothetical protein  57.64 
 
 		 325 aa  343  2e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0641119 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0111  hypothetical protein  56.6 
 
 		 325 aa  341  9e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3074  CheW protein  56.6 
 
 		 325 aa  341  1e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.464984  normal  0.367409 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0333  Type I secretion outer membrane protein, TolC  55.21 
 
 		 325 aa  338  8e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0672756 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0499  hypothetical protein  90.23 
 
 		 186 aa  332  5e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0282  hypothetical protein  56.21 
 
 		 325 aa  332  7.000000000000001e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.822944  hitchhiker  0.00000243422 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1111  hypothetical protein  52.4 
 
 		 327 aa  330  2e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0480419  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0607  hypothetical protein  55.86 
 
 		 325 aa  327  2.0000000000000001e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0281  hypothetical protein  55.52 
 
 		 325 aa  325  7e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015206 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2943  histidine kinase  52.08 
 
 		 325 aa  323  4e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3017  hypothetical protein  53.12 
 
 		 325 aa  318  7e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0296678 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1856  hypothetical protein  48.84 
 
 		 370 aa  316  3e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1436  protein of unknown function DUF1568  50.62 
 
 		 341 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2906  hypothetical protein  50.83 
 
 		 329 aa  298  1e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3659  hypothetical protein  47.38 
 
 		 347 aa  294  2e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2679  hypothetical protein  50 
 
 		 336 aa  293  4e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0118762  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2780  hypothetical protein  52.6 
 
 		 336 aa  290  2e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000960474  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2838  hypothetical protein  72.58 
 
 		 186 aa  290  2e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.579373  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3200  hypothetical protein  45.51 
 
 		 344 aa  287  2e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.789239 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0868  hypothetical protein  45.51 
 
 		 344 aa  287  2e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1700  protein of unknown function DUF1568  44.05 
 
 		 377 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0414346 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2414  hypothetical protein  45.94 
 
 		 341 aa  285  5e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.301389  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0856  hypothetical protein  47.95 
 
 		 347 aa  285  7e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0910  hypothetical protein  46.23 
 
 		 344 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1226  protein of unknown function DUF1568  46.56 
 
 		 341 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.353731  hitchhiker  0.000000017845 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1945  protein of unknown function DUF1568  45.94 
 
 		 341 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.499337 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2840  protein of unknown function DUF1568  46.79 
 
 		 345 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0644633 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1697  hypothetical protein  47.44 
 
 		 349 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2403  hypothetical protein  47.12 
 
 		 341 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.284659  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3113  hypothetical protein  85 
 
 		 207 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2933  hypothetical protein  45.37 
 
 		 345 aa  281  1e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.161086  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1178  hypothetical protein  46.35 
 
 		 344 aa  281  1e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0303591  normal  0.0825627 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3682  hypothetical protein  71.43 
 
 		 198 aa  281  2e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0562  hypothetical protein  45.56 
 
 		 370 aa  279  6e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0862774 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02418  hypothetical protein  43.49 
 
 		 328 aa  276  2e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1126  hypothetical protein  46.03 
 
 		 344 aa  277  2e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.776641  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2480  hypothetical protein  45.71 
 
 		 344 aa  276  3e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02306  hypothetical protein  43.08 
 
 		 324 aa  268  1e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.334783  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>