185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0856 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_0856  hypothetical protein  100 
 
 
347 aa  724    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3659  hypothetical protein  75.5 
 
 
347 aa  570  1e-161  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2933  hypothetical protein  74.07 
 
 
345 aa  554  1e-157  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.161086  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1178  hypothetical protein  74.78 
 
 
344 aa  554  1e-157  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0303591  normal  0.0825627 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3200  hypothetical protein  74.71 
 
 
344 aa  556  1e-157  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.789239 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0868  hypothetical protein  74.86 
 
 
344 aa  553  1e-156  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0910  hypothetical protein  73.28 
 
 
344 aa  547  1e-155  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1697  hypothetical protein  76.01 
 
 
349 aa  548  1e-155  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1126  hypothetical protein  74.49 
 
 
344 aa  550  1e-155  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.776641  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2414  hypothetical protein  74.06 
 
 
341 aa  549  1e-155  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.301389  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1945  protein of unknown function DUF1568  74.06 
 
 
341 aa  546  1e-154  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.499337 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2840  protein of unknown function DUF1568  73.78 
 
 
345 aa  542  1e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0644633 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1226  protein of unknown function DUF1568  73.33 
 
 
341 aa  541  1e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.353731  hitchhiker  0.000000017845 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2480  hypothetical protein  72.75 
 
 
344 aa  537  1e-151  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2403  hypothetical protein  72.33 
 
 
341 aa  535  1e-151  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.284659  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2906  hypothetical protein  70.43 
 
 
329 aa  508  1e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3299  hypothetical protein  81.6 
 
 
213 aa  379  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1856  hypothetical protein  49.32 
 
 
370 aa  353  2e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1541  hypothetical protein  72.04 
 
 
209 aa  311  9e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2679  hypothetical protein  47.27 
 
 
336 aa  308  5.9999999999999995e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0118762  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2628  hypothetical protein  48.73 
 
 
326 aa  305  9.000000000000001e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3074  CheW protein  46.2 
 
 
325 aa  304  1.0000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.464984  normal  0.367409 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0111  hypothetical protein  44.94 
 
 
325 aa  303  3.0000000000000004e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0281  hypothetical protein  45.17 
 
 
325 aa  303  3.0000000000000004e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000015206 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0282  hypothetical protein  44.86 
 
 
325 aa  303  3.0000000000000004e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.822944  hitchhiker  0.00000243422 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3465  hypothetical protein  46.52 
 
 
325 aa  302  7.000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0641119 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0607  hypothetical protein  45.79 
 
 
325 aa  301  8.000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2943  histidine kinase  45.68 
 
 
325 aa  301  8.000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3681  hypothetical protein  48.15 
 
 
323 aa  301  1e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2780  hypothetical protein  46.35 
 
 
336 aa  300  2e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000960474  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3087  hypothetical protein  47.78 
 
 
325 aa  299  5e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1436  protein of unknown function DUF1568  47.84 
 
 
341 aa  298  8e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3017  hypothetical protein  44.62 
 
 
325 aa  298  1e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0296678 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4465  hypothetical protein  47.35 
 
 
325 aa  298  1e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0135  hypothetical protein  48.1 
 
 
325 aa  297  2e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2785  hypothetical protein  44.93 
 
 
325 aa  297  2e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0143634  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1921  hypothetical protein  46.3 
 
 
325 aa  295  7e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3680  hypothetical protein  46.3 
 
 
325 aa  295  7e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1378  hypothetical protein  47.53 
 
 
325 aa  294  1e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599998 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2958  hypothetical protein  45.88 
 
 
325 aa  294  2e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4299  hypothetical protein  46.47 
 
 
325 aa  294  2e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2922  hypothetical protein  47.47 
 
 
325 aa  293  4e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3356  hypothetical protein  43.77 
 
 
323 aa  293  4e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.526564  normal  0.864241 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1610  hypothetical protein  46.84 
 
 
325 aa  292  5e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1264  hypothetical protein  48.58 
 
 
325 aa  292  6e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0670  hypothetical protein  47.38 
 
 
325 aa  292  7e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2555  hypothetical protein  47.08 
 
 
325 aa  291  8e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00750734  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2392  hypothetical protein  47.15 
 
 
325 aa  291  1e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.134929  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3084  hypothetical protein  46.52 
 
 
325 aa  291  1e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0957  hypothetical protein  48.42 
 
 
325 aa  291  1e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00250015  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1890  hypothetical protein  47.63 
 
 
325 aa  290  2e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0196  hypothetical protein  45.43 
 
 
326 aa  291  2e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.157282 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0333  Type I secretion outer membrane protein, TolC  43.67 
 
 
325 aa  291  2e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0672756 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1948  hypothetical protein  45.13 
 
 
326 aa  290  2e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.270103  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3773  hypothetical protein  46.31 
 
 
325 aa  289  4e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.149988  hitchhiker  0.00126811 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1547  hypothetical protein  47.95 
 
 
325 aa  288  7e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0606  hypothetical protein  46.04 
 
 
325 aa  288  8e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0115  hypothetical protein  47.63 
 
 
325 aa  288  1e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3627  hypothetical protein  46.18 
 
 
325 aa  288  1e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92162  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1948  hypothetical protein  42.27 
 
 
327 aa  288  1e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.557873  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2402  hypothetical protein  47.32 
 
 
325 aa  288  1e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.283143  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1511  hypothetical protein  44.87 
 
 
325 aa  287  2e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1546  hypothetical protein  48.1 
 
 
326 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3040  hypothetical protein  47 
 
 
325 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3447  hypothetical protein  47 
 
 
325 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2653  hypothetical protein  45.13 
 
 
326 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1812  hypothetical protein  46.15 
 
 
316 aa  286  5e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3473  hypothetical protein  46.37 
 
 
325 aa  285  5e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4547  hypothetical protein  47.95 
 
 
325 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1241  hypothetical protein  47.95 
 
 
325 aa  285  8e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4749  hypothetical protein  46.18 
 
 
325 aa  285  8e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.291957  hitchhiker  0.000564584 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1848  hypothetical protein  42.57 
 
 
327 aa  285  8e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4530  hypothetical protein  47.63 
 
 
325 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1510  hypothetical protein  47.32 
 
 
325 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2299  hypothetical protein  47 
 
 
325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.187044  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2622  hypothetical protein  47.12 
 
 
319 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0144606  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0116  hypothetical protein  46.69 
 
 
325 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1385  hypothetical protein  41.69 
 
 
327 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.868466  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1735  hypothetical protein  41.98 
 
 
327 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2307  hypothetical protein  43.73 
 
 
326 aa  281  2e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2814  hypothetical protein  46.37 
 
 
325 aa  280  3e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0907  hypothetical protein  41.98 
 
 
327 aa  278  1e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0248219  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4132  hypothetical protein  40.82 
 
 
327 aa  278  1e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0562  hypothetical protein  42.52 
 
 
370 aa  277  2e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0862774 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3091  hypothetical protein  42.52 
 
 
326 aa  275  7e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0496594 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1700  protein of unknown function DUF1568  39.61 
 
 
377 aa  275  8e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0414346 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1861  hypothetical protein  46.42 
 
 
329 aa  273  3e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.633128  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1111  hypothetical protein  40.82 
 
 
327 aa  271  9e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0480419  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0052  hypothetical protein  42.23 
 
 
326 aa  269  5.9999999999999995e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.186799 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3323  hypothetical protein  40.88 
 
 
325 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2533  hypothetical protein  47.47 
 
 
326 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0991372  normal  0.0595118 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0200  hypothetical protein  46.62 
 
 
293 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2414  hypothetical protein  47.15 
 
 
326 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.196776  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02306  hypothetical protein  40.67 
 
 
324 aa  249  4e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.334783  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02418  hypothetical protein  40 
 
 
328 aa  232  8.000000000000001e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2324  Elongator protein 3/MiaB/NifB  51.2 
 
 
208 aa  229  5e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0123865 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1542  hypothetical protein  75.91 
 
 
139 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01831  hypothetical protein  44.32 
 
 
271 aa  220  3e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3682  hypothetical protein  57.14 
 
 
198 aa  220  3e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3041  hypothetical protein  54.14 
 
 
198 aa  203  3e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>