207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4465 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_4465  hypothetical protein  100 
 
 
325 aa  681    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1378  hypothetical protein  87.38 
 
 
325 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599998 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2958  hypothetical protein  86.46 
 
 
325 aa  600  1.0000000000000001e-171  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3773  hypothetical protein  86.15 
 
 
325 aa  597  1e-170  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.149988  hitchhiker  0.00126811 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4299  hypothetical protein  82.35 
 
 
325 aa  565  1e-160  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3627  hypothetical protein  81.42 
 
 
325 aa  558  1e-158  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92162  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4749  hypothetical protein  80.8 
 
 
325 aa  556  1e-157  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.291957  hitchhiker  0.000564584 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2922  hypothetical protein  76.09 
 
 
325 aa  528  1e-149  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2555  hypothetical protein  73.85 
 
 
325 aa  521  1e-147  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00750734  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2402  hypothetical protein  73.85 
 
 
325 aa  521  1e-147  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.283143  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1241  hypothetical protein  73.23 
 
 
325 aa  518  1e-146  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1547  hypothetical protein  73.23 
 
 
325 aa  520  1e-146  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4530  hypothetical protein  73.54 
 
 
325 aa  520  1e-146  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4547  hypothetical protein  73.54 
 
 
325 aa  520  1e-146  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0670  hypothetical protein  72.62 
 
 
325 aa  518  1e-146  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0957  hypothetical protein  73.15 
 
 
325 aa  519  1e-146  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00250015  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2299  hypothetical protein  73.23 
 
 
325 aa  518  1e-146  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.187044  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3681  hypothetical protein  75.16 
 
 
323 aa  518  1e-146  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1510  hypothetical protein  72.92 
 
 
325 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1890  hypothetical protein  72.98 
 
 
325 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0135  hypothetical protein  71.91 
 
 
325 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1264  hypothetical protein  72.53 
 
 
325 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0115  hypothetical protein  72.76 
 
 
325 aa  511  1e-144  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1546  hypothetical protein  72.62 
 
 
326 aa  512  1e-144  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3040  hypothetical protein  71.69 
 
 
325 aa  513  1e-144  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3447  hypothetical protein  71.69 
 
 
325 aa  513  1e-144  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1921  hypothetical protein  71.91 
 
 
325 aa  513  1e-144  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3680  hypothetical protein  71.91 
 
 
325 aa  513  1e-144  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2814  hypothetical protein  72 
 
 
325 aa  512  1e-144  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2392  hypothetical protein  71.6 
 
 
325 aa  508  1e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.134929  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1511  hypothetical protein  72.36 
 
 
325 aa  510  1e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3473  hypothetical protein  71.38 
 
 
325 aa  510  1e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0116  hypothetical protein  71.69 
 
 
325 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0606  hypothetical protein  71.6 
 
 
325 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1861  hypothetical protein  71.73 
 
 
329 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.633128  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2622  hypothetical protein  73.55 
 
 
319 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0144606  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1812  hypothetical protein  72.82 
 
 
316 aa  490  1e-137  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1948  hypothetical protein  66.46 
 
 
326 aa  473  1e-132  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.270103  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2653  hypothetical protein  67.7 
 
 
326 aa  471  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0196  hypothetical protein  67.7 
 
 
326 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.157282 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2533  hypothetical protein  69.75 
 
 
326 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0991372  normal  0.0595118 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2785  hypothetical protein  65.43 
 
 
325 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0143634  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3087  hypothetical protein  65.12 
 
 
325 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0200  hypothetical protein  73.01 
 
 
293 aa  464  1e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1610  hypothetical protein  65.12 
 
 
325 aa  463  1e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3084  hypothetical protein  64.2 
 
 
325 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2307  hypothetical protein  62.73 
 
 
326 aa  448  1e-125  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2414  hypothetical protein  68.52 
 
 
326 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.196776  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3323  hypothetical protein  61.8 
 
 
325 aa  441  1e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3091  hypothetical protein  61.18 
 
 
326 aa  439  9.999999999999999e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0496594 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2628  hypothetical protein  63.32 
 
 
326 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0052  hypothetical protein  61.8 
 
 
326 aa  440  9.999999999999999e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.186799 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3356  hypothetical protein  57.19 
 
 
323 aa  385  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.526564  normal  0.864241 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2393  hypothetical protein  77.19 
 
 
238 aa  380  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0597783  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1385  hypothetical protein  54.31 
 
 
327 aa  358  7e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.868466  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1948  hypothetical protein  54.31 
 
 
327 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.557873  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1848  hypothetical protein  53.67 
 
 
327 aa  353  2e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1735  hypothetical protein  53.67 
 
 
327 aa  352  5e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4132  hypothetical protein  52.72 
 
 
327 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0907  hypothetical protein  53.18 
 
 
327 aa  348  8e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0248219  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3465  hypothetical protein  57.29 
 
 
325 aa  346  3e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0641119 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0111  hypothetical protein  56.25 
 
 
325 aa  345  6e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3074  CheW protein  56.25 
 
 
325 aa  343  2e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.464984  normal  0.367409 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0333  Type I secretion outer membrane protein, TolC  55.56 
 
 
325 aa  342  4e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0672756 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0282  hypothetical protein  52.08 
 
 
325 aa  332  4e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.822944  hitchhiker  0.00000243422 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0281  hypothetical protein  52.08 
 
 
325 aa  329  3e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000015206 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0607  hypothetical protein  51.76 
 
 
325 aa  328  7e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2943  histidine kinase  51.76 
 
 
325 aa  326  4.0000000000000003e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3017  hypothetical protein  52.43 
 
 
325 aa  322  4e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0296678 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1111  hypothetical protein  48.88 
 
 
327 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0480419  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1856  hypothetical protein  46.96 
 
 
370 aa  312  5.999999999999999e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2838  hypothetical protein  75.81 
 
 
186 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.579373  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3659  hypothetical protein  46.92 
 
 
347 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3041  hypothetical protein  75.56 
 
 
198 aa  300  2e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3446  hypothetical protein  75.56 
 
 
198 aa  300  2e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2906  hypothetical protein  51.33 
 
 
329 aa  300  3e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0856  hypothetical protein  47.35 
 
 
347 aa  298  9e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3682  hypothetical protein  78.02 
 
 
198 aa  297  1e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2679  hypothetical protein  49.19 
 
 
336 aa  295  7e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0118762  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2840  protein of unknown function DUF1568  47.81 
 
 
345 aa  295  9e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0644633 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0868  hypothetical protein  47.06 
 
 
344 aa  293  4e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3200  hypothetical protein  44.84 
 
 
344 aa  293  4e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.789239 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1226  protein of unknown function DUF1568  46.73 
 
 
341 aa  292  5e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.353731  hitchhiker  0.000000017845 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1697  hypothetical protein  46.18 
 
 
349 aa  291  8e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2414  hypothetical protein  46.13 
 
 
341 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.301389  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1178  hypothetical protein  45.43 
 
 
344 aa  290  2e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0303591  normal  0.0825627 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1945  protein of unknown function DUF1568  46.13 
 
 
341 aa  290  3e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.499337 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1126  hypothetical protein  45.13 
 
 
344 aa  286  2e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.776641  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0910  hypothetical protein  44.54 
 
 
344 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2480  hypothetical protein  44.25 
 
 
344 aa  286  5e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02418  hypothetical protein  44.86 
 
 
328 aa  285  5.999999999999999e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2403  hypothetical protein  46.56 
 
 
341 aa  285  8e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.284659  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2933  hypothetical protein  44.97 
 
 
345 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.161086  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1436  protein of unknown function DUF1568  49.48 
 
 
341 aa  280  3e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01831  hypothetical protein  51.74 
 
 
271 aa  278  8e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1700  protein of unknown function DUF1568  43.23 
 
 
377 aa  276  3e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0414346 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0499  hypothetical protein  74.56 
 
 
186 aa  276  4e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2780  hypothetical protein  48.44 
 
 
336 aa  276  4e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000960474  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0562  hypothetical protein  42.52 
 
 
370 aa  276  5e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0862774 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02306  hypothetical protein  42.44 
 
 
324 aa  264  1e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.334783  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>