178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1264 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1264  hypothetical protein  100 
 
 
325 aa  680    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0957  hypothetical protein  98.46 
 
 
325 aa  669    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00250015  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0606  hypothetical protein  90.46 
 
 
325 aa  621  1e-177  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1890  hypothetical protein  87.69 
 
 
325 aa  608  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2299  hypothetical protein  87.65 
 
 
325 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.187044  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3473  hypothetical protein  87.08 
 
 
325 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1241  hypothetical protein  87.04 
 
 
325 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1546  hypothetical protein  86.73 
 
 
326 aa  600  1.0000000000000001e-171  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3040  hypothetical protein  87.04 
 
 
325 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3447  hypothetical protein  87.04 
 
 
325 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0670  hypothetical protein  87.04 
 
 
325 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2555  hypothetical protein  86.42 
 
 
325 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00750734  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1510  hypothetical protein  86.69 
 
 
325 aa  597  1e-170  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1547  hypothetical protein  86.11 
 
 
325 aa  597  1e-170  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4530  hypothetical protein  86.42 
 
 
325 aa  599  1e-170  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0115  hypothetical protein  86.34 
 
 
325 aa  595  1e-169  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0116  hypothetical protein  86.65 
 
 
325 aa  595  1e-169  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1511  hypothetical protein  86.02 
 
 
325 aa  594  1e-169  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2402  hypothetical protein  85.49 
 
 
325 aa  597  1e-169  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.283143  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2814  hypothetical protein  86.11 
 
 
325 aa  597  1e-169  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4547  hypothetical protein  86.11 
 
 
325 aa  593  1e-168  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1861  hypothetical protein  86.28 
 
 
329 aa  592  1e-168  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.633128  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1812  hypothetical protein  88.35 
 
 
316 aa  579  1e-164  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2622  hypothetical protein  87.06 
 
 
319 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0144606  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1921  hypothetical protein  81.85 
 
 
325 aa  567  1e-161  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3680  hypothetical protein  81.85 
 
 
325 aa  567  1e-161  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0135  hypothetical protein  81.23 
 
 
325 aa  565  1e-160  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2392  hypothetical protein  81.23 
 
 
325 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.134929  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4299  hypothetical protein  74.77 
 
 
325 aa  533  1e-150  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2958  hypothetical protein  75.62 
 
 
325 aa  534  1e-150  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1378  hypothetical protein  75.62 
 
 
325 aa  534  1e-150  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599998 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3627  hypothetical protein  73.85 
 
 
325 aa  525  1e-148  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92162  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0200  hypothetical protein  86.21 
 
 
293 aa  525  1e-148  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3773  hypothetical protein  74.07 
 
 
325 aa  526  1e-148  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.149988  hitchhiker  0.00126811 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4749  hypothetical protein  74.46 
 
 
325 aa  526  1e-148  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.291957  hitchhiker  0.000564584 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4465  hypothetical protein  72.53 
 
 
325 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2922  hypothetical protein  73.6 
 
 
325 aa  512  1e-144  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3681  hypothetical protein  73.6 
 
 
323 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3087  hypothetical protein  72 
 
 
325 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1610  hypothetical protein  72 
 
 
325 aa  504  1e-141  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2785  hypothetical protein  71.08 
 
 
325 aa  499  1e-140  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0143634  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2653  hypothetical protein  72.73 
 
 
326 aa  496  1e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3084  hypothetical protein  71.08 
 
 
325 aa  496  1e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0196  hypothetical protein  72.1 
 
 
326 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.157282 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2533  hypothetical protein  72.92 
 
 
326 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0991372  normal  0.0595118 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1948  hypothetical protein  69.16 
 
 
326 aa  480  1e-134  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.270103  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2414  hypothetical protein  71.08 
 
 
326 aa  461  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.196776  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2307  hypothetical protein  65.62 
 
 
326 aa  454  1e-127  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0052  hypothetical protein  64.31 
 
 
326 aa  448  1e-125  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.186799 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3323  hypothetical protein  63.38 
 
 
325 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3091  hypothetical protein  65 
 
 
326 aa  444  1e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0496594 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2628  hypothetical protein  64.58 
 
 
326 aa  442  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2393  hypothetical protein  86.46 
 
 
238 aa  419  1e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0597783  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3356  hypothetical protein  54.31 
 
 
323 aa  371  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.526564  normal  0.864241 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1385  hypothetical protein  56.23 
 
 
327 aa  363  1e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.868466  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1948  hypothetical protein  56.37 
 
 
327 aa  364  1e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.557873  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1848  hypothetical protein  55.91 
 
 
327 aa  360  3e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0907  hypothetical protein  55.41 
 
 
327 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0248219  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1735  hypothetical protein  54.95 
 
 
327 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4132  hypothetical protein  54.31 
 
 
327 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3041  hypothetical protein  88.89 
 
 
198 aa  347  2e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3446  hypothetical protein  88.89 
 
 
198 aa  347  2e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3074  CheW protein  55.17 
 
 
325 aa  339  4e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.464984  normal  0.367409 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3465  hypothetical protein  55.86 
 
 
325 aa  339  4e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0641119 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0111  hypothetical protein  54.83 
 
 
325 aa  337  1.9999999999999998e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0333  Type I secretion outer membrane protein, TolC  54.14 
 
 
325 aa  337  1.9999999999999998e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0672756 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1111  hypothetical protein  50.8 
 
 
327 aa  333  4e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0480419  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3017  hypothetical protein  53.1 
 
 
325 aa  330  2e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0296678 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0282  hypothetical protein  53.45 
 
 
325 aa  326  3e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.822944  hitchhiker  0.00000243422 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0607  hypothetical protein  53.45 
 
 
325 aa  323  2e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0281  hypothetical protein  53.45 
 
 
325 aa  323  4e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000015206 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2943  histidine kinase  53.45 
 
 
325 aa  320  1.9999999999999998e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1856  hypothetical protein  47.97 
 
 
370 aa  316  3e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0499  hypothetical protein  84.21 
 
 
186 aa  306  3e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1436  protein of unknown function DUF1568  48.15 
 
 
341 aa  302  6.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3659  hypothetical protein  47.53 
 
 
347 aa  295  5e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2838  hypothetical protein  74.19 
 
 
186 aa  296  5e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.579373  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2906  hypothetical protein  50.33 
 
 
329 aa  295  7e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2679  hypothetical protein  48.87 
 
 
336 aa  295  7e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0118762  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0856  hypothetical protein  48.58 
 
 
347 aa  292  5e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3682  hypothetical protein  74.73 
 
 
198 aa  287  2e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2840  protein of unknown function DUF1568  47.76 
 
 
345 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0644633 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3200  hypothetical protein  45.51 
 
 
344 aa  287  2e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.789239 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0868  hypothetical protein  45.82 
 
 
344 aa  285  5e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0910  hypothetical protein  47.3 
 
 
344 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2414  hypothetical protein  45.62 
 
 
341 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.301389  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1697  hypothetical protein  47.12 
 
 
349 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02418  hypothetical protein  43.85 
 
 
328 aa  282  5.000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1945  protein of unknown function DUF1568  45.62 
 
 
341 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.499337 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2403  hypothetical protein  47.23 
 
 
341 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.284659  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1178  hypothetical protein  46.35 
 
 
344 aa  280  2e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0303591  normal  0.0825627 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1226  protein of unknown function DUF1568  45.31 
 
 
341 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.353731  hitchhiker  0.000000017845 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1700  protein of unknown function DUF1568  43.45 
 
 
377 aa  280  3e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0414346 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2933  hypothetical protein  44.21 
 
 
345 aa  279  5e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.161086  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2780  hypothetical protein  49.32 
 
 
336 aa  278  1e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000960474  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2480  hypothetical protein  46.03 
 
 
344 aa  277  2e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02306  hypothetical protein  45.48 
 
 
324 aa  276  2e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.334783  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1126  hypothetical protein  46.03 
 
 
344 aa  276  4e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.776641  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3113  hypothetical protein  82.17 
 
 
207 aa  272  6e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0562  hypothetical protein  43.2 
 
 
370 aa  271  1e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0862774 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>