171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3017 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3017  hypothetical protein  100 
 
 		 325 aa  680    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0296678 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0282  hypothetical protein  74.77 
 
 		 325 aa  521  1e-147  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.822944  hitchhiker  0.00000243422 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3465  hypothetical protein  72.62 
 
 		 325 aa  514  1.0000000000000001e-145  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0641119 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0281  hypothetical protein  74.15 
 
 		 325 aa  512  1e-144  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015206 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3074  CheW protein  72.31 
 
 		 325 aa  511  1e-144  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.464984  normal  0.367409 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0111  hypothetical protein  72 
 
 		 325 aa  508  1e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0333  Type I secretion outer membrane protein, TolC  72 
 
 		 325 aa  508  1e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0672756 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0607  hypothetical protein  72.92 
 
 		 325 aa  508  1e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2943  histidine kinase  73.54 
 
 		 325 aa  508  1e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1385  hypothetical protein  55.56 
 
 		 327 aa  382  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.868466  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3356  hypothetical protein  55.8 
 
 		 323 aa  382  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.526564  normal  0.864241 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1848  hypothetical protein  55.56 
 
 		 327 aa  376  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1948  hypothetical protein  54.32 
 
 		 327 aa  375  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.557873  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4132  hypothetical protein  53.7 
 
 		 327 aa  374  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0907  hypothetical protein  54.63 
 
 		 327 aa  369  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0248219  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1735  hypothetical protein  54.63 
 
 		 327 aa  369  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2628  hypothetical protein  53.61 
 
 		 326 aa  348  9e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1111  hypothetical protein  50.31 
 
 		 327 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0480419  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0052  hypothetical protein  54.83 
 
 		 326 aa  345  8.999999999999999e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.186799 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2307  hypothetical protein  53.89 
 
 		 326 aa  343  2.9999999999999997e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2324  Elongator protein 3/MiaB/NifB  77.78 
 
 		 208 aa  340  1e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0123865 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3323  hypothetical protein  53.27 
 
 		 325 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3091  hypothetical protein  53.58 
 
 		 326 aa  340  2.9999999999999998e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0496594 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0135  hypothetical protein  55.9 
 
 		 325 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2653  hypothetical protein  51.41 
 
 		 326 aa  334  1e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0196  hypothetical protein  51.1 
 
 		 326 aa  333  2e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.157282 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1921  hypothetical protein  55.21 
 
 		 325 aa  332  6e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3680  hypothetical protein  55.21 
 
 		 325 aa  332  6e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0957  hypothetical protein  53.82 
 
 		 325 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00250015  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1610  hypothetical protein  53.82 
 
 		 325 aa  330  2e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3087  hypothetical protein  54.17 
 
 		 325 aa  330  2e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1948  hypothetical protein  50.16 
 
 		 326 aa  330  2e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.270103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1264  hypothetical protein  53.1 
 
 		 325 aa  330  2e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2555  hypothetical protein  53.82 
 
 		 325 aa  328  5.0000000000000004e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00750734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2392  hypothetical protein  53.82 
 
 		 325 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.134929  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3084  hypothetical protein  53.82 
 
 		 325 aa  325  4.0000000000000003e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2814  hypothetical protein  54.17 
 
 		 325 aa  325  5e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2922  hypothetical protein  53.47 
 
 		 325 aa  325  5e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0606  hypothetical protein  54.17 
 
 		 325 aa  325  5e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2785  hypothetical protein  53.1 
 
 		 325 aa  325  7e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0143634  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0670  hypothetical protein  53.47 
 
 		 325 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2299  hypothetical protein  54.17 
 
 		 325 aa  324  1e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.187044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2402  hypothetical protein  53.12 
 
 		 325 aa  324  1e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.283143  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2958  hypothetical protein  52.43 
 
 		 325 aa  323  2e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1812  hypothetical protein  53.12 
 
 		 316 aa  323  3e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4465  hypothetical protein  52.43 
 
 		 325 aa  322  4e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1856  hypothetical protein  43.77 
 
 		 370 aa  323  4e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1890  hypothetical protein  52.78 
 
 		 325 aa  322  5e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1547  hypothetical protein  52.43 
 
 		 325 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1378  hypothetical protein  51.74 
 
 		 325 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000599998 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3040  hypothetical protein  52.78 
 
 		 325 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3447  hypothetical protein  52.78 
 
 		 325 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1510  hypothetical protein  52.78 
 
 		 325 aa  318  5e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4530  hypothetical protein  52.78 
 
 		 325 aa  319  5e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0116  hypothetical protein  52.78 
 
 		 325 aa  318  6e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3681  hypothetical protein  52.78 
 
 		 323 aa  318  6e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1241  hypothetical protein  53.12 
 
 		 325 aa  318  7e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0115  hypothetical protein  52.78 
 
 		 325 aa  318  9e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3773  hypothetical protein  51.74 
 
 		 325 aa  317  1e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.149988  hitchhiker  0.00126811 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1511  hypothetical protein  52.43 
 
 		 325 aa  318  1e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4547  hypothetical protein  52.43 
 
 		 325 aa  317  2e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3473  hypothetical protein  51.74 
 
 		 325 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1546  hypothetical protein  51.74 
 
 		 326 aa  316  4e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2533  hypothetical protein  53.45 
 
 		 326 aa  315  5e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0991372  normal  0.0595118 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2622  hypothetical protein  53.19 
 
 		 319 aa  309  5e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0144606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0868  hypothetical protein  47.62 
 
 		 344 aa  308  9e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4749  hypothetical protein  50.69 
 
 		 325 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.291957  hitchhiker  0.000564584 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3627  hypothetical protein  50.35 
 
 		 325 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4299  hypothetical protein  50.35 
 
 		 325 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2414  hypothetical protein  48.08 
 
 		 341 aa  306  3e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.301389  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1861  hypothetical protein  51.03 
 
 		 329 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.633128  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1697  hypothetical protein  45.27 
 
 		 349 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2414  hypothetical protein  48.92 
 
 		 326 aa  301  9e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.196776  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1945  protein of unknown function DUF1568  47.44 
 
 		 341 aa  300  2e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.499337 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2403  hypothetical protein  47.44 
 
 		 341 aa  300  2e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.284659  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1226  protein of unknown function DUF1568  47.76 
 
 		 341 aa  300  2e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.353731  hitchhiker  0.000000017845 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2906  hypothetical protein  48 
 
 		 329 aa  299  5e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0910  hypothetical protein  47.3 
 
 		 344 aa  298  7e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3659  hypothetical protein  46.84 
 
 		 347 aa  298  7e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0856  hypothetical protein  44.62 
 
 		 347 aa  298  1e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2840  protein of unknown function DUF1568  46.06 
 
 		 345 aa  297  2e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0644633 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1178  hypothetical protein  47.3 
 
 		 344 aa  296  2e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0303591  normal  0.0825627 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3200  hypothetical protein  46.52 
 
 		 344 aa  295  8e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.789239 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2933  hypothetical protein  46.18 
 
 		 345 aa  295  1e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.161086  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2480  hypothetical protein  46.98 
 
 		 344 aa  293  2e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1126  hypothetical protein  46.98 
 
 		 344 aa  293  3e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.776641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1436  protein of unknown function DUF1568  42.22 
 
 		 341 aa  291  1e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2679  hypothetical protein  47.91 
 
 		 336 aa  290  2e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0118762  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01831  hypothetical protein  57.03 
 
 		 271 aa  285  8e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2780  hypothetical protein  42.17 
 
 		 336 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000960474  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0200  hypothetical protein  52.17 
 
 		 293 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02418  hypothetical protein  45.45 
 
 		 328 aa  268  1e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02306  hypothetical protein  43.16 
 
 		 324 aa  262  6.999999999999999e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.334783  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0562  hypothetical protein  38.9 
 
 		 370 aa  257  2e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0862774 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3299  hypothetical protein  54.25 
 
 		 213 aa  245  9e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1700  protein of unknown function DUF1568  35.75 
 
 		 377 aa  239  5e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0414346 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3682  hypothetical protein  55.49 
 
 		 198 aa  218  1e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3041  hypothetical protein  54.44 
 
 		 198 aa  215  8e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3446  hypothetical protein  54.44 
 
 		 198 aa  215  8e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2393  hypothetical protein  53.93 
 
 		 238 aa  211  2e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0597783  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>