121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2839 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_2839  hypothetical protein  100 
 
 
137 aa  285  1e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.504912  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3681  hypothetical protein  94.16 
 
 
323 aa  270  5.000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2922  hypothetical protein  88.32 
 
 
325 aa  260  4e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2958  hypothetical protein  79.56 
 
 
325 aa  231  3e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1378  hypothetical protein  78.83 
 
 
325 aa  229  7.000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599998 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3773  hypothetical protein  77.37 
 
 
325 aa  226  9e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.149988  hitchhiker  0.00126811 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1610  hypothetical protein  72.99 
 
 
325 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0957  hypothetical protein  72.26 
 
 
325 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00250015  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0196  hypothetical protein  74.45 
 
 
326 aa  218  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.157282 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1510  hypothetical protein  71.53 
 
 
325 aa  217  3e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1511  hypothetical protein  71.53 
 
 
325 aa  217  3e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3087  hypothetical protein  71.53 
 
 
325 aa  217  3.9999999999999997e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1264  hypothetical protein  71.53 
 
 
325 aa  217  6e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2785  hypothetical protein  72.26 
 
 
325 aa  216  7.999999999999999e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0143634  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3682  hypothetical protein  89.47 
 
 
198 aa  216  7.999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2299  hypothetical protein  70.8 
 
 
325 aa  216  8.999999999999998e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.187044  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4530  hypothetical protein  70.07 
 
 
325 aa  216  1e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2653  hypothetical protein  73.72 
 
 
326 aa  216  1e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0115  hypothetical protein  70.07 
 
 
325 aa  215  2e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1241  hypothetical protein  70.8 
 
 
325 aa  214  2e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3040  hypothetical protein  70.07 
 
 
325 aa  215  2e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3447  hypothetical protein  70.07 
 
 
325 aa  215  2e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3084  hypothetical protein  71.53 
 
 
325 aa  214  2.9999999999999998e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0606  hypothetical protein  71.53 
 
 
325 aa  214  2.9999999999999998e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4547  hypothetical protein  69.34 
 
 
325 aa  214  4e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2414  hypothetical protein  71.53 
 
 
326 aa  214  4e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.196776  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2533  hypothetical protein  71.53 
 
 
326 aa  213  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0991372  normal  0.0595118 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0116  hypothetical protein  70.07 
 
 
325 aa  213  8e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1890  hypothetical protein  68.61 
 
 
325 aa  213  8e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1547  hypothetical protein  68.61 
 
 
325 aa  213  9e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0670  hypothetical protein  70.07 
 
 
325 aa  213  9e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0135  hypothetical protein  68.61 
 
 
325 aa  211  1.9999999999999998e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2555  hypothetical protein  70.8 
 
 
325 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00750734  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2402  hypothetical protein  69.34 
 
 
325 aa  211  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.283143  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1812  hypothetical protein  70.07 
 
 
316 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3473  hypothetical protein  68.61 
 
 
325 aa  210  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1861  hypothetical protein  70.07 
 
 
329 aa  211  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.633128  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4299  hypothetical protein  70.07 
 
 
325 aa  210  4.9999999999999996e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1546  hypothetical protein  69.34 
 
 
326 aa  209  7e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3041  hypothetical protein  69.34 
 
 
198 aa  209  9e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3446  hypothetical protein  69.34 
 
 
198 aa  209  9e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1921  hypothetical protein  67.15 
 
 
325 aa  208  2e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3680  hypothetical protein  67.15 
 
 
325 aa  208  2e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4749  hypothetical protein  71.53 
 
 
325 aa  208  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.291957  hitchhiker  0.000564584 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2814  hypothetical protein  68.61 
 
 
325 aa  208  2e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2392  hypothetical protein  66.42 
 
 
325 aa  207  3e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.134929  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3627  hypothetical protein  70.07 
 
 
325 aa  207  3e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92162  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4465  hypothetical protein  72.26 
 
 
325 aa  207  3e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1948  hypothetical protein  66.42 
 
 
326 aa  202  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.270103  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2622  hypothetical protein  70.08 
 
 
319 aa  196  6e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0144606  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3323  hypothetical protein  54.74 
 
 
325 aa  175  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2307  hypothetical protein  56.2 
 
 
326 aa  173  6e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3356  hypothetical protein  54.74 
 
 
323 aa  173  8e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.526564  normal  0.864241 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2628  hypothetical protein  56.2 
 
 
326 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2394  hypothetical protein  72.73 
 
 
104 aa  168  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.176236  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0052  hypothetical protein  55.47 
 
 
326 aa  168  3e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.186799 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3091  hypothetical protein  55.47 
 
 
326 aa  167  3e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0496594 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1385  hypothetical protein  54.74 
 
 
327 aa  165  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.868466  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0907  hypothetical protein  54.01 
 
 
327 aa  164  4e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0248219  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1948  hypothetical protein  54.01 
 
 
327 aa  164  4e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.557873  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1848  hypothetical protein  53.28 
 
 
327 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4132  hypothetical protein  52.55 
 
 
327 aa  160  5.0000000000000005e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0111  hypothetical protein  52.55 
 
 
325 aa  155  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3074  CheW protein  52.55 
 
 
325 aa  155  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.464984  normal  0.367409 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3465  hypothetical protein  53.28 
 
 
325 aa  155  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0641119 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02418  hypothetical protein  51.09 
 
 
328 aa  155  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1111  hypothetical protein  51.82 
 
 
327 aa  154  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0480419  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0200  hypothetical protein  68.63 
 
 
293 aa  154  4e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0333  Type I secretion outer membrane protein, TolC  51.82 
 
 
325 aa  154  5.0000000000000005e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0672756 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1735  hypothetical protein  51.09 
 
 
327 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3017  hypothetical protein  48.18 
 
 
325 aa  145  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0296678 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2679  hypothetical protein  48.18 
 
 
336 aa  144  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0118762  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0281  hypothetical protein  49.64 
 
 
325 aa  144  5e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000015206 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0562  hypothetical protein  48.57 
 
 
370 aa  144  5e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0862774 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0856  hypothetical protein  51.09 
 
 
347 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1889  hypothetical protein  71.26 
 
 
88 aa  142  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0282  hypothetical protein  49.64 
 
 
325 aa  142  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.822944  hitchhiker  0.00000243422 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1436  protein of unknown function DUF1568  49.64 
 
 
341 aa  140  5e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2324  Elongator protein 3/MiaB/NifB  48.18 
 
 
208 aa  140  7e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0123865 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0607  hypothetical protein  48.91 
 
 
325 aa  139  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2943  histidine kinase  48.91 
 
 
325 aa  139  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1856  hypothetical protein  47.01 
 
 
370 aa  137  3e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1700  protein of unknown function DUF1568  46.76 
 
 
377 aa  137  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0414346 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2780  hypothetical protein  47.45 
 
 
336 aa  136  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000960474  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2906  hypothetical protein  49.64 
 
 
329 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0868  hypothetical protein  44.53 
 
 
344 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3659  hypothetical protein  44.53 
 
 
347 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1697  hypothetical protein  45.26 
 
 
349 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3299  hypothetical protein  45.26 
 
 
213 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2840  protein of unknown function DUF1568  45.99 
 
 
345 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0644633 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2933  hypothetical protein  42.34 
 
 
345 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.161086  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0910  hypothetical protein  43.07 
 
 
344 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1542  hypothetical protein  44.53 
 
 
139 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3200  hypothetical protein  43.07 
 
 
344 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.789239 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1178  hypothetical protein  43.07 
 
 
344 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0303591  normal  0.0825627 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1226  protein of unknown function DUF1568  44.53 
 
 
341 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.353731  hitchhiker  0.000000017845 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2414  hypothetical protein  43.07 
 
 
341 aa  126  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.301389  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2480  hypothetical protein  43.07 
 
 
344 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3809  hypothetical protein  54 
 
 
112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1945  protein of unknown function DUF1568  43.07 
 
 
341 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.499337 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>