117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2394 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2394  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.176236  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1890  hypothetical protein  89 
 
 		 325 aa  194  3e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1511  hypothetical protein  88.89 
 
 		 325 aa  194  3e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1510  hypothetical protein  88 
 
 		 325 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1546  hypothetical protein  90.91 
 
 		 326 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0957  hypothetical protein  86.27 
 
 		 325 aa  193  5.000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00250015  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2299  hypothetical protein  87.88 
 
 		 325 aa  193  6e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.187044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0606  hypothetical protein  88 
 
 		 325 aa  193  6e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1264  hypothetical protein  86.27 
 
 		 325 aa  193  6e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1241  hypothetical protein  87.88 
 
 		 325 aa  192  1e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3473  hypothetical protein  88.89 
 
 		 325 aa  192  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1812  hypothetical protein  88 
 
 		 316 aa  192  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0670  hypothetical protein  88 
 
 		 325 aa  191  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0116  hypothetical protein  87.88 
 
 		 325 aa  191  4e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3040  hypothetical protein  87.88 
 
 		 325 aa  190  5e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3447  hypothetical protein  87.88 
 
 		 325 aa  190  5e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1861  hypothetical protein  88 
 
 		 329 aa  190  5e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.633128  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4547  hypothetical protein  86.87 
 
 		 325 aa  189  9e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4530  hypothetical protein  85 
 
 		 325 aa  188  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2814  hypothetical protein  85.86 
 
 		 325 aa  188  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3041  hypothetical protein  85 
 
 		 198 aa  186  8e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3446  hypothetical protein  85 
 
 		 198 aa  186  8e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1547  hypothetical protein  84.85 
 
 		 325 aa  186  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2555  hypothetical protein  83.84 
 
 		 325 aa  185  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00750734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2402  hypothetical protein  84.85 
 
 		 325 aa  186  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.283143  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0115  hypothetical protein  84.85 
 
 		 325 aa  184  3e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2958  hypothetical protein  76 
 
 		 325 aa  171  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3087  hypothetical protein  75 
 
 		 325 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3773  hypothetical protein  75 
 
 		 325 aa  170  5.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.149988  hitchhiker  0.00126811 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1610  hypothetical protein  75 
 
 		 325 aa  169  1e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2785  hypothetical protein  75 
 
 		 325 aa  169  1e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0143634  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3084  hypothetical protein  75 
 
 		 325 aa  169  1e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1378  hypothetical protein  73 
 
 		 325 aa  169  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000599998 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0135  hypothetical protein  74 
 
 		 325 aa  168  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2839  hypothetical protein  72.73 
 
 		 137 aa  168  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.504912  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3681  hypothetical protein  72 
 
 		 323 aa  167  6e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1921  hypothetical protein  73 
 
 		 325 aa  166  7e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3680  hypothetical protein  73 
 
 		 325 aa  166  7e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4299  hypothetical protein  73 
 
 		 325 aa  166  7e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2922  hypothetical protein  71 
 
 		 325 aa  166  7e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1889  hypothetical protein  86.21 
 
 		 88 aa  165  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2392  hypothetical protein  72 
 
 		 325 aa  165  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.134929  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2414  hypothetical protein  71 
 
 		 326 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.196776  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3627  hypothetical protein  72 
 
 		 325 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2533  hypothetical protein  71 
 
 		 326 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0991372  normal  0.0595118 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2653  hypothetical protein  72 
 
 		 326 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0196  hypothetical protein  71.72 
 
 		 326 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.157282 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2622  hypothetical protein  82.56 
 
 		 319 aa  159  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0144606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4465  hypothetical protein  70 
 
 		 325 aa  156  9e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4749  hypothetical protein  70 
 
 		 325 aa  156  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.291957  hitchhiker  0.000564584 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3323  hypothetical protein  62 
 
 		 325 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1948  hypothetical protein  66 
 
 		 326 aa  150  7e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.270103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2628  hypothetical protein  63.11 
 
 		 326 aa  148  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2307  hypothetical protein  60 
 
 		 326 aa  145  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3091  hypothetical protein  59 
 
 		 326 aa  142  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0496594 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3356  hypothetical protein  62.24 
 
 		 323 aa  141  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.526564  normal  0.864241 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0052  hypothetical protein  57 
 
 		 326 aa  139  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.186799 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1385  hypothetical protein  61.22 
 
 		 327 aa  138  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.868466  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1948  hypothetical protein  59.18 
 
 		 327 aa  135  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.557873  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1111  hypothetical protein  58.16 
 
 		 327 aa  134  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0480419  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3809  hypothetical protein  72.29 
 
 		 112 aa  134  4e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0907  hypothetical protein  59.18 
 
 		 327 aa  134  5e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0248219  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4132  hypothetical protein  58.16 
 
 		 327 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1848  hypothetical protein  59.18 
 
 		 327 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0562  hypothetical protein  60 
 
 		 370 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0862774 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1436  protein of unknown function DUF1568  57.43 
 
 		 341 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3682  hypothetical protein  71.43 
 
 		 198 aa  130  5e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0200  hypothetical protein  92.31 
 
 		 293 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1735  hypothetical protein  55.1 
 
 		 327 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1856  hypothetical protein  57.29 
 
 		 370 aa  125  3e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1700  protein of unknown function DUF1568  56 
 
 		 377 aa  123  8.000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0414346 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3074  CheW protein  52.53 
 
 		 325 aa  123  9e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.464984  normal  0.367409 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0111  hypothetical protein  52.53 
 
 		 325 aa  122  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3465  hypothetical protein  52.53 
 
 		 325 aa  122  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0641119 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3017  hypothetical protein  49.49 
 
 		 325 aa  122  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0296678 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0333  Type I secretion outer membrane protein, TolC  52 
 
 		 325 aa  121  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0672756 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2324  Elongator protein 3/MiaB/NifB  52 
 
 		 208 aa  120  4e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0123865 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0281  hypothetical protein  51 
 
 		 325 aa  119  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015206 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2780  hypothetical protein  53 
 
 		 336 aa  119  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000960474  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0282  hypothetical protein  52 
 
 		 325 aa  119  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.822944  hitchhiker  0.00000243422 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3678  hypothetical protein  73.53 
 
 		 68 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2943  histidine kinase  51 
 
 		 325 aa  117  6e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0607  hypothetical protein  51 
 
 		 325 aa  116  7.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02418  hypothetical protein  48.98 
 
 		 328 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2679  hypothetical protein  52 
 
 		 336 aa  113  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0118762  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0856  hypothetical protein  49 
 
 		 347 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1571  hypothetical protein  81.67 
 
 		 66 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641007  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3659  hypothetical protein  48.98 
 
 		 347 aa  111  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0910  hypothetical protein  50.53 
 
 		 344 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1697  hypothetical protein  49.47 
 
 		 349 aa  110  5e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3299  hypothetical protein  48.98 
 
 		 213 aa  110  5e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2480  hypothetical protein  49.47 
 
 		 344 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3200  hypothetical protein  49.47 
 
 		 344 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.789239 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2906  hypothetical protein  51.52 
 
 		 329 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2414  hypothetical protein  48.42 
 
 		 341 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.301389  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2840  protein of unknown function DUF1568  49.47 
 
 		 345 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0644633 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1542  hypothetical protein  49.47 
 
 		 139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1126  hypothetical protein  47.37 
 
 		 344 aa  107  5e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.776641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1178  hypothetical protein  47.37 
 
 		 344 aa  107  5e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0303591  normal  0.0825627 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2933  hypothetical protein  44.9 
 
 		 345 aa  107  5e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.161086  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>