120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_1542 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1542  hypothetical protein  100 
 
 
139 aa  290  5e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2840  protein of unknown function DUF1568  94.89 
 
 
345 aa  273  7e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0644633 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1178  hypothetical protein  91.24 
 
 
344 aa  268  1e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0303591  normal  0.0825627 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1697  hypothetical protein  90.51 
 
 
349 aa  266  7e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3200  hypothetical protein  89.78 
 
 
344 aa  266  1e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.789239 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1126  hypothetical protein  90.51 
 
 
344 aa  265  2e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.776641  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0868  hypothetical protein  86.86 
 
 
344 aa  258  2e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0910  hypothetical protein  85.4 
 
 
344 aa  258  3e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2414  hypothetical protein  86.86 
 
 
341 aa  256  6e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.301389  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2480  hypothetical protein  86.86 
 
 
344 aa  256  7e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1945  protein of unknown function DUF1568  86.86 
 
 
341 aa  253  4e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.499337 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3299  hypothetical protein  84.67 
 
 
213 aa  253  4e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1226  protein of unknown function DUF1568  86.13 
 
 
341 aa  251  3e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.353731  hitchhiker  0.000000017845 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3659  hypothetical protein  83.21 
 
 
347 aa  249  7e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2403  hypothetical protein  84.67 
 
 
341 aa  249  9.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.284659  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2933  hypothetical protein  78.83 
 
 
345 aa  241  3e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.161086  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0856  hypothetical protein  75.91 
 
 
347 aa  226  8e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2906  hypothetical protein  71.53 
 
 
329 aa  212  9.999999999999999e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1856  hypothetical protein  54.01 
 
 
370 aa  161  3e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1436  protein of unknown function DUF1568  46.72 
 
 
341 aa  147  3e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2679  hypothetical protein  45.99 
 
 
336 aa  147  5e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0118762  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2780  hypothetical protein  47.45 
 
 
336 aa  146  9e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000960474  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0282  hypothetical protein  49.64 
 
 
325 aa  140  4e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.822944  hitchhiker  0.00000243422 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0281  hypothetical protein  48.91 
 
 
325 aa  140  6e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000015206 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0333  Type I secretion outer membrane protein, TolC  45.99 
 
 
325 aa  139  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0672756 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2324  Elongator protein 3/MiaB/NifB  48.57 
 
 
208 aa  139  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0123865 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3017  hypothetical protein  47.45 
 
 
325 aa  138  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0296678 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3356  hypothetical protein  46.72 
 
 
323 aa  138  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.526564  normal  0.864241 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2628  hypothetical protein  45.99 
 
 
326 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2943  histidine kinase  48.57 
 
 
325 aa  138  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0111  hypothetical protein  45.26 
 
 
325 aa  137  4.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0607  hypothetical protein  48.18 
 
 
325 aa  137  4.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3074  CheW protein  45.26 
 
 
325 aa  137  6e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.464984  normal  0.367409 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1948  hypothetical protein  45.26 
 
 
327 aa  136  7.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.557873  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3465  hypothetical protein  45.26 
 
 
325 aa  135  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0641119 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0135  hypothetical protein  45.26 
 
 
325 aa  134  4e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1385  hypothetical protein  44.53 
 
 
327 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.868466  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1848  hypothetical protein  44.53 
 
 
327 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2392  hypothetical protein  44.53 
 
 
325 aa  131  3e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.134929  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1111  hypothetical protein  45.99 
 
 
327 aa  131  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0480419  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0562  hypothetical protein  43.85 
 
 
370 aa  131  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0862774 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2785  hypothetical protein  45.26 
 
 
325 aa  130  3.9999999999999996e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0143634  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4132  hypothetical protein  43.07 
 
 
327 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3087  hypothetical protein  44.53 
 
 
325 aa  130  5e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1700  protein of unknown function DUF1568  49.09 
 
 
377 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0414346 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1921  hypothetical protein  43.07 
 
 
325 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3680  hypothetical protein  43.07 
 
 
325 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0907  hypothetical protein  43.8 
 
 
327 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0248219  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2922  hypothetical protein  43.8 
 
 
325 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4465  hypothetical protein  45.99 
 
 
325 aa  128  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2839  hypothetical protein  44.53 
 
 
137 aa  128  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.504912  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1735  hypothetical protein  43.07 
 
 
327 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3084  hypothetical protein  43.8 
 
 
325 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1948  hypothetical protein  43.07 
 
 
326 aa  127  6e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.270103  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1610  hypothetical protein  43.8 
 
 
325 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3681  hypothetical protein  43.8 
 
 
323 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0196  hypothetical protein  43.8 
 
 
326 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.157282 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3091  hypothetical protein  44.53 
 
 
326 aa  125  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0496594 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0957  hypothetical protein  44.53 
 
 
325 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00250015  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1264  hypothetical protein  44.53 
 
 
325 aa  124  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2653  hypothetical protein  43.8 
 
 
326 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2307  hypothetical protein  44.53 
 
 
326 aa  124  5e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3323  hypothetical protein  40.88 
 
 
325 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0052  hypothetical protein  43.8 
 
 
326 aa  123  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.186799 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2402  hypothetical protein  41.61 
 
 
325 aa  122  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.283143  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0115  hypothetical protein  41.61 
 
 
325 aa  121  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1510  hypothetical protein  41.61 
 
 
325 aa  121  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1890  hypothetical protein  40.88 
 
 
325 aa  121  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2414  hypothetical protein  40.88 
 
 
326 aa  121  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.196776  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2533  hypothetical protein  40.88 
 
 
326 aa  121  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0991372  normal  0.0595118 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1241  hypothetical protein  42.34 
 
 
325 aa  121  4e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1511  hypothetical protein  41.61 
 
 
325 aa  120  4e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02418  hypothetical protein  43.07 
 
 
328 aa  121  4e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0606  hypothetical protein  43.07 
 
 
325 aa  120  8e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3040  hypothetical protein  41.61 
 
 
325 aa  119  9e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3447  hypothetical protein  41.61 
 
 
325 aa  119  9e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1547  hypothetical protein  41.61 
 
 
325 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3041  hypothetical protein  41.61 
 
 
198 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3446  hypothetical protein  41.61 
 
 
198 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2299  hypothetical protein  41.61 
 
 
325 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.187044  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2555  hypothetical protein  41.61 
 
 
325 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00750734  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4530  hypothetical protein  41.61 
 
 
325 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4547  hypothetical protein  40.15 
 
 
325 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1861  hypothetical protein  39.86 
 
 
329 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.633128  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2814  hypothetical protein  40.88 
 
 
325 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1812  hypothetical protein  40.15 
 
 
316 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0116  hypothetical protein  40.15 
 
 
325 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1546  hypothetical protein  40.88 
 
 
326 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0670  hypothetical protein  40.15 
 
 
325 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3473  hypothetical protein  39.42 
 
 
325 aa  117  6e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2622  hypothetical protein  42.86 
 
 
319 aa  117  7e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0144606  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2958  hypothetical protein  39.42 
 
 
325 aa  115  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1378  hypothetical protein  38.69 
 
 
325 aa  114  5e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599998 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3773  hypothetical protein  38.69 
 
 
325 aa  113  6.9999999999999995e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.149988  hitchhiker  0.00126811 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02306  hypothetical protein  41.3 
 
 
324 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.334783  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4299  hypothetical protein  39.42 
 
 
325 aa  111  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2394  hypothetical protein  49.47 
 
 
104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.176236  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3627  hypothetical protein  38.69 
 
 
325 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92162  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3682  hypothetical protein  43.86 
 
 
198 aa  106  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1705  hypothetical protein  62.12 
 
 
68 aa  103  7e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>