115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1705 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1705  hypothetical protein  100 
 
 
68 aa  143  9e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1436  protein of unknown function DUF1568  75.76 
 
 
341 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3659  hypothetical protein  63.64 
 
 
347 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3299  hypothetical protein  63.64 
 
 
213 aa  107  5e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2780  hypothetical protein  69.7 
 
 
336 aa  107  6e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000960474  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3200  hypothetical protein  62.12 
 
 
344 aa  106  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.789239 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2414  hypothetical protein  60.61 
 
 
341 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.301389  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1945  protein of unknown function DUF1568  60.61 
 
 
341 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.499337 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2933  hypothetical protein  63.64 
 
 
345 aa  105  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.161086  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2840  protein of unknown function DUF1568  62.12 
 
 
345 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0644633 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1226  protein of unknown function DUF1568  62.12 
 
 
341 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.353731  hitchhiker  0.000000017845 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1697  hypothetical protein  62.12 
 
 
349 aa  104  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1178  hypothetical protein  60.61 
 
 
344 aa  104  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0303591  normal  0.0825627 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1126  hypothetical protein  60.61 
 
 
344 aa  104  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.776641  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1542  hypothetical protein  62.12 
 
 
139 aa  103  7e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1856  hypothetical protein  62.12 
 
 
370 aa  103  8e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2480  hypothetical protein  62.12 
 
 
344 aa  103  9e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0856  hypothetical protein  60.61 
 
 
347 aa  103  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0910  hypothetical protein  60.61 
 
 
344 aa  102  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0868  hypothetical protein  57.58 
 
 
344 aa  101  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2403  hypothetical protein  60.61 
 
 
341 aa  101  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.284659  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2906  hypothetical protein  59.09 
 
 
329 aa  100  6e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3356  hypothetical protein  63.64 
 
 
323 aa  98.2  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.526564  normal  0.864241 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1111  hypothetical protein  60.61 
 
 
327 aa  94  7e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0480419  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02418  hypothetical protein  59.09 
 
 
328 aa  92.8  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1385  hypothetical protein  57.58 
 
 
327 aa  91.7  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.868466  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1948  hypothetical protein  56.06 
 
 
327 aa  90.9  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.557873  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1848  hypothetical protein  57.58 
 
 
327 aa  90.5  7e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3681  hypothetical protein  59.09 
 
 
323 aa  90.5  7e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1610  hypothetical protein  62.12 
 
 
325 aa  90.1  8e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2628  hypothetical protein  59.09 
 
 
326 aa  89.7  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0907  hypothetical protein  57.58 
 
 
327 aa  89.4  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0248219  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4132  hypothetical protein  54.55 
 
 
327 aa  89  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3087  hypothetical protein  60.61 
 
 
325 aa  88.2  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2839  hypothetical protein  57.58 
 
 
137 aa  88.6  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.504912  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3017  hypothetical protein  54.55 
 
 
325 aa  88.2  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0296678 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3084  hypothetical protein  60.61 
 
 
325 aa  88.2  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02306  hypothetical protein  53.03 
 
 
324 aa  87.8  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.334783  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2679  hypothetical protein  56.06 
 
 
336 aa  87.8  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0118762  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2324  Elongator protein 3/MiaB/NifB  54.55 
 
 
208 aa  87  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0123865 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2922  hypothetical protein  56.06 
 
 
325 aa  87.4  7e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1510  hypothetical protein  57.58 
 
 
325 aa  87  8e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0115  hypothetical protein  56.06 
 
 
325 aa  85.9  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3040  hypothetical protein  57.58 
 
 
325 aa  86.7  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3447  hypothetical protein  57.58 
 
 
325 aa  86.7  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0111  hypothetical protein  56.06 
 
 
325 aa  86.7  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0333  Type I secretion outer membrane protein, TolC  56.06 
 
 
325 aa  86.7  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0672756 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3074  CheW protein  56.06 
 
 
325 aa  86.7  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.464984  normal  0.367409 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2785  hypothetical protein  59.09 
 
 
325 aa  86.3  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0143634  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1511  hypothetical protein  59.09 
 
 
325 aa  86.7  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1241  hypothetical protein  57.58 
 
 
325 aa  85.9  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1547  hypothetical protein  54.55 
 
 
325 aa  85.5  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4547  hypothetical protein  54.55 
 
 
325 aa  85.5  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3465  hypothetical protein  56.06 
 
 
325 aa  85.5  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0641119 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0562  hypothetical protein  56.06 
 
 
370 aa  85.5  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0862774 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0606  hypothetical protein  56.06 
 
 
325 aa  85.9  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2414  hypothetical protein  57.58 
 
 
326 aa  85.5  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.196776  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1546  hypothetical protein  54.55 
 
 
326 aa  85.5  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0135  hypothetical protein  57.58 
 
 
325 aa  85.1  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2555  hypothetical protein  57.58 
 
 
325 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00750734  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2402  hypothetical protein  57.58 
 
 
325 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.283143  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1812  hypothetical protein  56.06 
 
 
316 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1948  hypothetical protein  57.58 
 
 
326 aa  85.1  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.270103  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2533  hypothetical protein  57.58 
 
 
326 aa  84.7  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0991372  normal  0.0595118 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0116  hypothetical protein  54.55 
 
 
325 aa  84.7  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1890  hypothetical protein  56.06 
 
 
325 aa  84.7  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0281  hypothetical protein  53.03 
 
 
325 aa  84.7  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000015206 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0282  hypothetical protein  53.03 
 
 
325 aa  84.7  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.822944  hitchhiker  0.00000243422 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0607  hypothetical protein  53.03 
 
 
325 aa  84.7  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2299  hypothetical protein  56.06 
 
 
325 aa  84.3  5e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.187044  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2814  hypothetical protein  57.58 
 
 
325 aa  84.3  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3473  hypothetical protein  57.58 
 
 
325 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4530  hypothetical protein  54.55 
 
 
325 aa  84  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2943  histidine kinase  53.03 
 
 
325 aa  84.3  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3091  hypothetical protein  53.03 
 
 
326 aa  84  6e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0496594 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0670  hypothetical protein  56.06 
 
 
325 aa  84  7e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3041  hypothetical protein  54.55 
 
 
198 aa  83.6  8e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3446  hypothetical protein  54.55 
 
 
198 aa  83.6  8e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3323  hypothetical protein  53.03 
 
 
325 aa  83.6  8e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2307  hypothetical protein  53.03 
 
 
326 aa  83.6  8e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2394  hypothetical protein  53.03 
 
 
104 aa  83.6  9e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.176236  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0957  hypothetical protein  53.03 
 
 
325 aa  83.6  9e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00250015  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1889  hypothetical protein  56.06 
 
 
88 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1921  hypothetical protein  54.55 
 
 
325 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2392  hypothetical protein  54.55 
 
 
325 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.134929  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3680  hypothetical protein  54.55 
 
 
325 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1264  hypothetical protein  53.03 
 
 
325 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1735  hypothetical protein  53.03 
 
 
327 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3678  hypothetical protein  54.55 
 
 
68 aa  82  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1700  protein of unknown function DUF1568  50 
 
 
377 aa  81.6  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0414346 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0052  hypothetical protein  51.52 
 
 
326 aa  81.3  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.186799 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1861  hypothetical protein  54.55 
 
 
329 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.633128  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2622  hypothetical protein  57.89 
 
 
319 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0144606  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1378  hypothetical protein  51.52 
 
 
325 aa  79  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599998 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2653  hypothetical protein  53.03 
 
 
326 aa  79  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3773  hypothetical protein  51.52 
 
 
325 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.149988  hitchhiker  0.00126811 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4465  hypothetical protein  50 
 
 
325 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2958  hypothetical protein  51.52 
 
 
325 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0196  hypothetical protein  51.52 
 
 
326 aa  77.4  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.157282 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1704  hypothetical protein  100 
 
 
63 aa  71.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.944679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>