117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1889 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1889  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  186  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1241  hypothetical protein  97.7 
 
 		 325 aa  181  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2299  hypothetical protein  95.4 
 
 		 325 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.187044  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1510  hypothetical protein  95.4 
 
 		 325 aa  179  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1812  hypothetical protein  94.25 
 
 		 316 aa  178  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0116  hypothetical protein  94.25 
 
 		 325 aa  177  2.9999999999999997e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2814  hypothetical protein  94.25 
 
 		 325 aa  177  4e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1546  hypothetical protein  91.95 
 
 		 326 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1511  hypothetical protein  93.1 
 
 		 325 aa  176  7e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4547  hypothetical protein  93.1 
 
 		 325 aa  176  9e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3473  hypothetical protein  91.95 
 
 		 325 aa  176  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0606  hypothetical protein  90.8 
 
 		 325 aa  176  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2402  hypothetical protein  93.1 
 
 		 325 aa  174  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.283143  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4530  hypothetical protein  91.95 
 
 		 325 aa  174  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2555  hypothetical protein  91.95 
 
 		 325 aa  174  4e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00750734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0670  hypothetical protein  90.8 
 
 		 325 aa  174  4e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1890  hypothetical protein  90.8 
 
 		 325 aa  174  5e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3040  hypothetical protein  91.95 
 
 		 325 aa  174  5e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3447  hypothetical protein  91.95 
 
 		 325 aa  174  5e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1861  hypothetical protein  91.95 
 
 		 329 aa  174  5e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.633128  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0115  hypothetical protein  93.1 
 
 		 325 aa  173  6e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1547  hypothetical protein  91.95 
 
 		 325 aa  173  6e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3041  hypothetical protein  91.95 
 
 		 198 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3446  hypothetical protein  91.95 
 
 		 198 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0957  hypothetical protein  87.36 
 
 		 325 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00250015  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1264  hypothetical protein  87.36 
 
 		 325 aa  171  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2394  hypothetical protein  86.21 
 
 		 104 aa  165  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.176236  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1610  hypothetical protein  76.14 
 
 		 325 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3084  hypothetical protein  76.14 
 
 		 325 aa  154  6e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0135  hypothetical protein  77.01 
 
 		 325 aa  153  9e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2958  hypothetical protein  77.01 
 
 		 325 aa  152  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1921  hypothetical protein  75.86 
 
 		 325 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3087  hypothetical protein  75.86 
 
 		 325 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3680  hypothetical protein  75.86 
 
 		 325 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2785  hypothetical protein  75.86 
 
 		 325 aa  150  5.9999999999999996e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0143634  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2392  hypothetical protein  74.71 
 
 		 325 aa  150  8e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.134929  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3773  hypothetical protein  75.86 
 
 		 325 aa  149  8.999999999999999e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.149988  hitchhiker  0.00126811 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1378  hypothetical protein  75.86 
 
 		 325 aa  149  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000599998 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2653  hypothetical protein  79.31 
 
 		 326 aa  149  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4299  hypothetical protein  75.86 
 
 		 325 aa  147  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2414  hypothetical protein  75.86 
 
 		 326 aa  147  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.196776  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2533  hypothetical protein  75.86 
 
 		 326 aa  147  4e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0991372  normal  0.0595118 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2922  hypothetical protein  72.41 
 
 		 325 aa  147  7e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3681  hypothetical protein  73.56 
 
 		 323 aa  146  7e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2622  hypothetical protein  88.31 
 
 		 319 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0144606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0196  hypothetical protein  77.01 
 
 		 326 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.157282 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2839  hypothetical protein  71.26 
 
 		 137 aa  142  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.504912  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3627  hypothetical protein  73.56 
 
 		 325 aa  142  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4465  hypothetical protein  70.11 
 
 		 325 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4749  hypothetical protein  71.26 
 
 		 325 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.291957  hitchhiker  0.000564584 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3323  hypothetical protein  66.67 
 
 		 325 aa  138  3e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2307  hypothetical protein  63.22 
 
 		 326 aa  130  5e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2628  hypothetical protein  63.22 
 
 		 326 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3809  hypothetical protein  76.62 
 
 		 112 aa  127  6e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3091  hypothetical protein  60.92 
 
 		 326 aa  127  6e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0496594 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3356  hypothetical protein  63.22 
 
 		 323 aa  126  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.526564  normal  0.864241 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0052  hypothetical protein  58.62 
 
 		 326 aa  125  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.186799 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1948  hypothetical protein  64.37 
 
 		 326 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.270103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1385  hypothetical protein  65.12 
 
 		 327 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.868466  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1111  hypothetical protein  61.63 
 
 		 327 aa  123  9e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0480419  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3678  hypothetical protein  76.47 
 
 		 68 aa  120  5e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0907  hypothetical protein  60.47 
 
 		 327 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0248219  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1948  hypothetical protein  60.47 
 
 		 327 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.557873  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1848  hypothetical protein  61.63 
 
 		 327 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0562  hypothetical protein  63.22 
 
 		 370 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0862774 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4132  hypothetical protein  59.3 
 
 		 327 aa  118  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1571  hypothetical protein  86.67 
 
 		 66 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641007  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1436  protein of unknown function DUF1568  59.77 
 
 		 341 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3017  hypothetical protein  52.63 
 
 		 325 aa  114  5e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0296678 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2324  Elongator protein 3/MiaB/NifB  60.24 
 
 		 208 aa  113  8.999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0123865 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0111  hypothetical protein  54.74 
 
 		 325 aa  112  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0333  Type I secretion outer membrane protein, TolC  54.74 
 
 		 325 aa  112  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0672756 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3074  CheW protein  54.74 
 
 		 325 aa  112  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.464984  normal  0.367409 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3465  hypothetical protein  54.74 
 
 		 325 aa  112  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0641119 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0281  hypothetical protein  60.24 
 
 		 325 aa  111  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015206 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0282  hypothetical protein  60.24 
 
 		 325 aa  111  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.822944  hitchhiker  0.00000243422 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2780  hypothetical protein  57.47 
 
 		 336 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000960474  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1700  protein of unknown function DUF1568  57.83 
 
 		 377 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0414346 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1735  hypothetical protein  55.81 
 
 		 327 aa  110  6e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0607  hypothetical protein  59.04 
 
 		 325 aa  109  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2943  histidine kinase  59.04 
 
 		 325 aa  109  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1856  hypothetical protein  57.83 
 
 		 370 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2906  hypothetical protein  55.29 
 
 		 329 aa  106  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02418  hypothetical protein  51.72 
 
 		 328 aa  105  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0910  hypothetical protein  51.72 
 
 		 344 aa  104  5e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3200  hypothetical protein  51.72 
 
 		 344 aa  103  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.789239 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1697  hypothetical protein  51.72 
 
 		 349 aa  103  6e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1226  protein of unknown function DUF1568  51.72 
 
 		 341 aa  103  8e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.353731  hitchhiker  0.000000017845 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2480  hypothetical protein  51.72 
 
 		 344 aa  103  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2414  hypothetical protein  50.57 
 
 		 341 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.301389  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2403  hypothetical protein  51.72 
 
 		 341 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.284659  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2840  protein of unknown function DUF1568  51.81 
 
 		 345 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0644633 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3659  hypothetical protein  53.01 
 
 		 347 aa  102  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02306  hypothetical protein  51.72 
 
 		 324 aa  102  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.334783  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0856  hypothetical protein  52.38 
 
 		 347 aa  102  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1945  protein of unknown function DUF1568  49.43 
 
 		 341 aa  101  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.499337 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2933  hypothetical protein  49.43 
 
 		 345 aa  100  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.161086  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1126  hypothetical protein  49.43 
 
 		 344 aa  100  5e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.776641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1178  hypothetical protein  49.43 
 
 		 344 aa  100  5e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0303591  normal  0.0825627 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3299  hypothetical protein  52.38 
 
 		 213 aa  100  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>