270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2563 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2563  protein of unknown function DUF1568  100 
 
 
248 aa  522  1e-147  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2564  hypothetical protein  96.15 
 
 
170 aa  315  3e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1541  hypothetical protein  42.91 
 
 
267 aa  205  6e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.463797  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2887  hypothetical protein  42.16 
 
 
242 aa  177  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1802  protein of unknown function DUF1568  27.4 
 
 
240 aa  96.7  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2932  hypothetical protein  31.88 
 
 
234 aa  89.4  5e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1007  hypothetical protein  33.08 
 
 
234 aa  87.4  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849512  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1484  hypothetical protein  33.1 
 
 
231 aa  86.7  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0682  hypothetical protein  32.06 
 
 
232 aa  86.7  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349284  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3122  transposase  34.51 
 
 
231 aa  85.1  8e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299801  normal  0.623865 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0790  hypothetical protein  31.91 
 
 
232 aa  84  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.513436  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2394  hypothetical protein  31.58 
 
 
239 aa  79  0.00000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419691  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29611  hypothetical protein  34.43 
 
 
124 aa  79  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03381  hypothetical protein  33.08 
 
 
199 aa  78.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.593355 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0708  protein of unknown function DUF1568  29.79 
 
 
233 aa  78.2  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.615013  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0793  hypothetical protein  26.34 
 
 
314 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0740  hypothetical protein  27.22 
 
 
255 aa  77.4  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345588  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0996  protein of unknown function DUF1568  30.61 
 
 
216 aa  76.6  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.976226  normal  0.164778 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27481  hypothetical protein  32.33 
 
 
260 aa  76.6  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.581269 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0477  hypothetical protein  28.9 
 
 
232 aa  75.5  0.0000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13701  hypothetical protein  32.56 
 
 
164 aa  74.7  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0093  hypothetical protein  30.66 
 
 
234 aa  73.9  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150021  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2620  hypothetical protein  31.82 
 
 
254 aa  73.6  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000852823  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26971  hypothetical protein  31.58 
 
 
260 aa  73.2  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2793  transposase-like p;rotein  29.5 
 
 
165 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3926  hypothetical protein  25.86 
 
 
322 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1151  protein of unknown function DUF1568  29.08 
 
 
231 aa  72.8  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0179  hypothetical protein  33.65 
 
 
254 aa  72.8  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0565655  normal  0.576766 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3016  hypothetical protein  29.93 
 
 
312 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3020  hypothetical protein  24.14 
 
 
316 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3295  hypothetical protein  30.47 
 
 
230 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4446  hypothetical protein  30.53 
 
 
236 aa  69.3  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.885807  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1552  protein of unknown function DUF1568  27.44 
 
 
230 aa  69.3  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.268269 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0902  hypothetical protein  31.48 
 
 
250 aa  68.9  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3485  hypothetical protein  32.04 
 
 
260 aa  68.9  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36702  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27031  hypothetical protein  31.58 
 
 
260 aa  68.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1356  hypothetical protein  29.05 
 
 
319 aa  68.2  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.895893  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3871  protein of unknown function DUF1568  28.03 
 
 
236 aa  68.6  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1914  protein of unknown function DUF1568  36.27 
 
 
124 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1558  protein of unknown function DUF1568  25.7 
 
 
230 aa  67  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.55731 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1556  protein of unknown function DUF1568  26.64 
 
 
230 aa  66.6  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.444415 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1554  protein of unknown function DUF1568  26.64 
 
 
230 aa  66.6  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.335003 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0033  hypothetical protein  27.54 
 
 
235 aa  66.2  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3670  transposase and inactivated derivatives  31.34 
 
 
228 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1813  protein of unknown function DUF1568  30.77 
 
 
277 aa  65.9  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00112655  hitchhiker  0.00000000103135 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2161  hypothetical protein  35.88 
 
 
295 aa  65.5  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3872  hypothetical protein  33.33 
 
 
317 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2897  protein of unknown function DUF1568  28.46 
 
 
250 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3244  protein of unknown function DUF1568  28.46 
 
 
241 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2264  transposase and inactivated derivatives  23.53 
 
 
323 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.88974  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2265  transposase and inactivated derivatives  23.95 
 
 
241 aa  63.5  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3592  protein of unknown function DUF1568  28.18 
 
 
235 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00165115  hitchhiker  0.000000708999 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2321  hypothetical protein  34.35 
 
 
297 aa  63.2  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0102584 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0364  transposase-like protein  28.18 
 
 
235 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.72516  normal  0.431982 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0231  protein of unknown function DUF1568  29.82 
 
 
298 aa  62.8  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0242  protein of unknown function DUF1568  34.35 
 
 
298 aa  62  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0717597  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0329  hypothetical protein  28.18 
 
 
237 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3498  hypothetical protein  28.18 
 
 
237 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.827202  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0304  hypothetical protein  28.18 
 
 
237 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0401  hypothetical protein  28.18 
 
 
237 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0320  hypothetical protein  28.18 
 
 
237 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.396962  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2474  protein of unknown function DUF1568  24.48 
 
 
224 aa  61.6  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000403207  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2706  hypothetical protein  28.18 
 
 
237 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0803898  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0380  hypothetical protein  28.18 
 
 
237 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2789  hypothetical protein  28.18 
 
 
235 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603101  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0164  transposase  29.79 
 
 
287 aa  61.6  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0743928  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2153  hypothetical protein  23.49 
 
 
221 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0207768  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0220  hypothetical protein  34.85 
 
 
298 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0309  hypothetical protein  32.87 
 
 
297 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.359735  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1717  hypothetical protein  34.81 
 
 
295 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205722  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0397  protein of unknown function DUF1568  29.01 
 
 
304 aa  60.5  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000164254  normal  0.853679 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3257  hypothetical protein  34.06 
 
 
314 aa  59.7  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2776  hypothetical protein  29.6 
 
 
235 aa  59.7  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.721483  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2878  protein of unknown function DUF1568  26.57 
 
 
287 aa  59.3  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4538  protein of unknown function DUF1568  24.26 
 
 
251 aa  58.9  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0855967  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1036  hypothetical protein  28.36 
 
 
222 aa  58.9  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1701  hypothetical protein  28.32 
 
 
174 aa  58.9  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0493  transposase  26.15 
 
 
222 aa  58.9  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3749  hypothetical protein  27.27 
 
 
237 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2737  hypothetical protein  27.27 
 
 
237 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3215  hypothetical protein  27.27 
 
 
237 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3719  transposase  27.27 
 
 
237 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.719861  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3015  hypothetical protein  27.27 
 
 
237 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3691  hypothetical protein  27.27 
 
 
237 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4462  hypothetical protein  28.35 
 
 
152 aa  58.9  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1766  hypothetical protein  27.27 
 
 
237 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2788  hypothetical protein  27.27 
 
 
237 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2966  hypothetical protein  26.83 
 
 
241 aa  58.5  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0320  protein of unknown function DUF1568  32.17 
 
 
297 aa  58.5  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.726603  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0331  protein of unknown function DUF1568  31.47 
 
 
297 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.214506  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0324  protein of unknown function DUF1568  27.45 
 
 
252 aa  58.2  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.551772  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2086  hypothetical protein  25.85 
 
 
321 aa  57.4  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.464464  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4133  hypothetical protein  30.71 
 
 
298 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1748  hypothetical protein  27.97 
 
 
312 aa  57.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.994794  normal  0.0128416 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3264  hypothetical protein  31.71 
 
 
247 aa  57.4  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0926373  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1788  hypothetical protein  33.59 
 
 
295 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.239361  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3049  transposase and inactivated derivatives  28.15 
 
 
226 aa  56.6  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3990  hypothetical protein  31.11 
 
 
320 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0487  transposase  26.15 
 
 
222 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12790  transposase  25.91 
 
 
241 aa  56.6  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>