157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4462 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_4462  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  324  2.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1552  hypothetical protein  36 
 
 		 205 aa  92.4  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0339239 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3122  transposase  33.64 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299801  normal  0.623865 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1007  hypothetical protein  29.46 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1802  protein of unknown function DUF1568  35.79 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2777  hypothetical protein  32.14 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.430133  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0996  protein of unknown function DUF1568  34.78 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.976226  normal  0.164778 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3976  protein of unknown function DUF1568  30.15 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.183049  normal  0.223747 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4707  hypothetical protein  28.57 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0917  protein of unknown function DUF1568  25.78 
 
 		 221 aa  64.3  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4421  hypothetical protein  25 
 
 		 152 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.268203 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0885  protein of unknown function DUF1568  24.14 
 
 		 169 aa  60.5  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4446  hypothetical protein  27.34 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.885807  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0262  hypothetical protein  25.58 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0093  hypothetical protein  26.67 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150021  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5047  hypothetical protein  24.19 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0419469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0708  protein of unknown function DUF1568  25.78 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.615013  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2563  protein of unknown function DUF1568  28.35 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0740  hypothetical protein  25.78 
 
 		 255 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2474  protein of unknown function DUF1568  29.13 
 
 		 224 aa  57.4  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000403207  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1689  hypothetical protein  27.15 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.625848  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0033  hypothetical protein  26.88 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0477  hypothetical protein  28.26 
 
 		 232 aa  55.1  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3670  transposase and inactivated derivatives  27.5 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0568  hypothetical protein  25 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2531  transposase  24.66 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719011  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0943  protein of unknown function DUF1568  23.57 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3295  hypothetical protein  29.41 
 
 		 230 aa  54.7  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1484  hypothetical protein  27.27 
 
 		 231 aa  54.7  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2530  hypothetical protein  22.97 
 
 		 179 aa  54.3  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01210  transposase  24.59 
 
 		 245 aa  53.9  0.0000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4538  protein of unknown function DUF1568  22.9 
 
 		 251 aa  53.5  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0855967  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2532  hypothetical protein  26.72 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709096 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1855  hypothetical protein  29.91 
 
 		 175 aa  53.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3353  protein of unknown function DUF1568  24.2 
 
 		 181 aa  53.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.231762 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3135  hypothetical protein  23.61 
 
 		 176 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.01424 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1701  hypothetical protein  25.19 
 
 		 174 aa  53.5  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2835  hypothetical protein  25.33 
 
 		 191 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1489  hypothetical protein  25.4 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0352  hypothetical protein  23.97 
 
 		 187 aa  52.8  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.642542  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2932  hypothetical protein  25 
 
 		 234 aa  52.8  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3465  hypothetical protein  27.13 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0682  hypothetical protein  25.38 
 
 		 232 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349284  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1364  hypothetical protein  23.39 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0968684  normal  0.0104776 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1888  hypothetical protein  26.02 
 
 		 171 aa  51.6  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.17258  hitchhiker  0.00842787 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1574  hypothetical protein  28.24 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.620864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0721b  hypothetical protein  26.83 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0607  hypothetical protein  24.11 
 
 		 151 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1975  hypothetical protein  22.9 
 
 		 163 aa  51.6  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3016  hypothetical protein  27.41 
 
 		 312 aa  51.2  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0793  hypothetical protein  25.36 
 
 		 314 aa  51.2  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2478  hypothetical protein  26.67 
 
 		 161 aa  50.4  0.000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0790  hypothetical protein  27.78 
 
 		 232 aa  50.4  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.513436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3592  protein of unknown function DUF1568  24.78 
 
 		 235 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00165115  hitchhiker  0.000000708999 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0364  transposase-like protein  24.78 
 
 		 235 aa  50.4  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.72516  normal  0.431982 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1541  hypothetical protein  24.51 
 
 		 267 aa  49.7  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.463797  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3130  transposase and inactivated derivatives  28.06 
 
 		 178 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0127624  normal  0.415202 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3477  hypothetical protein  24.03 
 
 		 188 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.379705  normal  0.40189 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2887  hypothetical protein  28.3 
 
 		 242 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3020  hypothetical protein  26.67 
 
 		 316 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1317  protein of unknown function DUF1568  24.11 
 
 		 179 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.737296  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4597  hypothetical protein  21.77 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0971888 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4373  hypothetical protein  27.5 
 
 		 178 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295832  normal  0.0449373 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1962  hypothetical protein  24.84 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0770  protein of unknown function DUF1568  23.42 
 
 		 316 aa  48.9  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1748  hypothetical protein  27.27 
 
 		 312 aa  48.9  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.994794  normal  0.0128416 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4226  hypothetical protein  25 
 
 		 177 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.853067  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0613  hypothetical protein  22.58 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.018198 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2966  hypothetical protein  25.62 
 
 		 241 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1685  transposase, putative  24.11 
 
 		 184 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.207714 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1556  protein of unknown function DUF1568  25 
 
 		 230 aa  48.9  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.444415 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1554  protein of unknown function DUF1568  25 
 
 		 230 aa  48.9  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.335003 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3919  hypothetical protein  24.22 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0968412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3871  protein of unknown function DUF1568  27.96 
 
 		 236 aa  48.5  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1384  hypothetical protein  25.33 
 
 		 180 aa  48.5  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.705846 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2394  hypothetical protein  27.37 
 
 		 239 aa  48.1  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419691  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2421  hypothetical protein  28.47 
 
 		 161 aa  48.1  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1966  hypothetical protein  22.77 
 
 		 231 aa  47.8  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.74185  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00223  hypothetical protein  22.73 
 
 		 165 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1558  protein of unknown function DUF1568  25 
 
 		 230 aa  47.8  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.55731 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12790  transposase  27.69 
 
 		 241 aa  47.8  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1151  protein of unknown function DUF1568  23.33 
 
 		 231 aa  47.8  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00227  hypothetical protein  22.73 
 
 		 165 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0796  hypothetical protein  22.94 
 
 		 159 aa  47.4  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3392  hypothetical protein  22.73 
 
 		 165 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3379  conserved hypothetical protein  22.73 
 
 		 165 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0320  hypothetical protein  23.01 
 
 		 237 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.396962  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0329  hypothetical protein  23.01 
 
 		 237 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4549  hypothetical protein  21.15 
 
 		 181 aa  47.4  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.86188 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3037  protein of unknown function DUF1568  22.68 
 
 		 315 aa  47.4  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3498  hypothetical protein  22.22 
 
 		 237 aa  47  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.827202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2706  hypothetical protein  22.22 
 
 		 237 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0803898  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0401  hypothetical protein  22.22 
 
 		 237 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0304  hypothetical protein  23.01 
 
 		 237 aa  47  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0380  hypothetical protein  22.22 
 
 		 237 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2897  protein of unknown function DUF1568  24.17 
 
 		 250 aa  47  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0240  hypothetical protein  21.97 
 
 		 165 aa  47  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0337  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  22.94 
 
 		 1345 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.038664  normal  0.920027 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3405  hypothetical protein  25.87 
 
 		 179 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0242544  normal  0.205029 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4081  hypothetical protein  25.62 
 
 		 177 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0580442  normal  0.342905 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>