98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl2478 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl2478  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  334  2.9999999999999997e-91  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2421  hypothetical protein  63.64 
 
 
161 aa  207  4e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1689  hypothetical protein  62.59 
 
 
184 aa  194  6e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.625848  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33360  hypothetical protein  53.1 
 
 
176 aa  179  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1962  hypothetical protein  55.1 
 
 
164 aa  174  5e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1855  hypothetical protein  54.42 
 
 
175 aa  172  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1952  hypothetical protein  51.37 
 
 
178 aa  167  6e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1473  transposase, putative  53.38 
 
 
179 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1685  transposase, putative  53.74 
 
 
184 aa  164  4e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.207714 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4226  hypothetical protein  48.28 
 
 
177 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.853067  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0768  hypothetical protein  52.74 
 
 
175 aa  159  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0333217  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4081  hypothetical protein  47.59 
 
 
177 aa  158  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0580442  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0721b  hypothetical protein  62.39 
 
 
133 aa  154  3e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0243  hypothetical protein  48.28 
 
 
178 aa  147  8e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.273479  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4373  hypothetical protein  48.97 
 
 
178 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295832  normal  0.0449373 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3405  hypothetical protein  46.94 
 
 
179 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0242544  normal  0.205029 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2530  hypothetical protein  49.33 
 
 
179 aa  142  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3135  hypothetical protein  46.62 
 
 
176 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.01424 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0731  hypothetical protein  45.33 
 
 
176 aa  138  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4825  transposase and inactivated derivative  45.52 
 
 
163 aa  138  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1317  protein of unknown function DUF1568  48.65 
 
 
179 aa  138  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.737296  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1384  hypothetical protein  46 
 
 
180 aa  137  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.705846 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3130  transposase and inactivated derivatives  44.83 
 
 
178 aa  131  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0127624  normal  0.415202 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0796  hypothetical protein  42.47 
 
 
159 aa  130  7.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2835  hypothetical protein  45.62 
 
 
191 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3379  conserved hypothetical protein  43.84 
 
 
165 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00223  hypothetical protein  43.84 
 
 
165 aa  128  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3392  hypothetical protein  43.84 
 
 
165 aa  128  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00227  hypothetical protein  43.84 
 
 
165 aa  128  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0240  hypothetical protein  43.15 
 
 
165 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2890  hypothetical protein  43.79 
 
 
191 aa  124  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1888  hypothetical protein  42.57 
 
 
171 aa  123  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.17258  hitchhiker  0.00842787 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0361  hypothetical protein  44.67 
 
 
191 aa  121  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0352  hypothetical protein  44.44 
 
 
187 aa  119  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.642542  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2531  transposase  43.75 
 
 
187 aa  119  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719011  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2532  hypothetical protein  27.86 
 
 
157 aa  66.6  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.709096 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1676  hypothetical protein  32.31 
 
 
157 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3712  hypothetical protein  30 
 
 
177 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013542 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0917  protein of unknown function DUF1568  27.27 
 
 
221 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1512  hypothetical protein  28.95 
 
 
222 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.656335 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3477  hypothetical protein  25.97 
 
 
188 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.379705  normal  0.40189 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0885  protein of unknown function DUF1568  25.16 
 
 
169 aa  55.5  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2563  hypothetical protein  33.91 
 
 
176 aa  54.7  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000213064  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1552  hypothetical protein  27.52 
 
 
205 aa  54.3  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0339239 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3049  transposase and inactivated derivatives  24.31 
 
 
226 aa  52.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4707  hypothetical protein  30.36 
 
 
152 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4223  hypothetical protein  34.29 
 
 
212 aa  51.6  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1784  hypothetical protein  31.43 
 
 
197 aa  51.2  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0347  hypothetical protein  35 
 
 
158 aa  51.2  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.119312  normal  0.0189577 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3286  protein of unknown function DUF1568  33.02 
 
 
214 aa  50.8  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00118326  unclonable  0.0000000135739 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33350  hypothetical protein  74.19 
 
 
38 aa  50.4  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4462  hypothetical protein  26.67 
 
 
152 aa  50.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2474  protein of unknown function DUF1568  26.21 
 
 
224 aa  50.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000403207  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2607  protein of unknown function DUF1568  24.81 
 
 
186 aa  49.7  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.407993  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3026  hypothetical protein  48.84 
 
 
76 aa  48.5  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.247877  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1888b  hypothetical protein  43.1 
 
 
101 aa  48.1  0.00005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0301  hypothetical protein  42.31 
 
 
91 aa  48.1  0.00006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4597  hypothetical protein  26.43 
 
 
151 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0971888 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3976  protein of unknown function DUF1568  30.19 
 
 
151 aa  47.8  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.183049  normal  0.223747 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2777  hypothetical protein  33.33 
 
 
149 aa  47  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.430133  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3154  hypothetical protein  37.7 
 
 
58 aa  47  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0787684 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1701  hypothetical protein  26.22 
 
 
174 aa  46.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5382  hypothetical protein  27.03 
 
 
223 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal  0.588654 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5411  protein of unknown function DUF1568  26.79 
 
 
218 aa  45.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000187281  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0489  hypothetical protein  29.17 
 
 
310 aa  45.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.448467 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1272  hypothetical protein  28.09 
 
 
196 aa  45.1  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3277  protein of unknown function DUF1568  34.29 
 
 
197 aa  45.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0262  hypothetical protein  26.79 
 
 
152 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0788  hypothetical protein  24.11 
 
 
150 aa  44.7  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1574  hypothetical protein  25.71 
 
 
150 aa  44.7  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.620864  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0613  hypothetical protein  24.77 
 
 
151 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.018198 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0996  protein of unknown function DUF1568  25.71 
 
 
216 aa  43.9  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.976226  normal  0.164778 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1364  hypothetical protein  22.45 
 
 
150 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0968684  normal  0.0104776 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3871  protein of unknown function DUF1568  23.33 
 
 
236 aa  43.5  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3612  hypothetical protein  29.31 
 
 
201 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0368765  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1975  hypothetical protein  24.26 
 
 
163 aa  42.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4599  hypothetical protein  26.21 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0337  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  24.44 
 
 
1345 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.038664  normal  0.920027 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0311  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  24.44 
 
 
1372 aa  42.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.220801 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4549  hypothetical protein  24.63 
 
 
181 aa  43.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.86188 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3872  hypothetical protein  24.85 
 
 
317 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1489  hypothetical protein  30.69 
 
 
153 aa  42.4  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2563  protein of unknown function DUF1568  23.13 
 
 
248 aa  42.4  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3670  transposase and inactivated derivatives  26.21 
 
 
228 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1967  hypothetical protein  25.76 
 
 
226 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00827335  normal  0.496503 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5047  hypothetical protein  25.22 
 
 
151 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0419469  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1484  hypothetical protein  23.84 
 
 
231 aa  42.4  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2321  hypothetical protein  23.53 
 
 
297 aa  42.4  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0102584 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1024  hypothetical protein  35.16 
 
 
163 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0275616 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0995  hypothetical protein  35.16 
 
 
163 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2844  hypothetical protein  27.08 
 
 
168 aa  41.2  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1813  protein of unknown function DUF1568  25.64 
 
 
277 aa  41.2  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00112655  hitchhiker  0.00000000103135 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1802  protein of unknown function DUF1568  26.67 
 
 
240 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0568  hypothetical protein  27.52 
 
 
151 aa  41.2  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2932  hypothetical protein  24.83 
 
 
234 aa  40.8  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3465  hypothetical protein  25.22 
 
 
150 aa  40.8  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0033  hypothetical protein  25.77 
 
 
235 aa  40.8  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3257  hypothetical protein  22.22 
 
 
314 aa  40.4  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>