86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1272 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1272  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  409  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2451  hypothetical protein  53.89 
 
 		 201 aa  197  6e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.875999 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0300  hypothetical protein  50 
 
 		 193 aa  184  9e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.401229  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1092  hypothetical protein  49.47 
 
 		 223 aa  181  5.0000000000000004e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.462205  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3252  hypothetical protein  50.9 
 
 		 174 aa  176  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0995  hypothetical protein  48.8 
 
 		 163 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1024  hypothetical protein  48.8 
 
 		 163 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0275616 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0837  hypothetical protein  49.48 
 
 		 206 aa  170  1e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2844  hypothetical protein  49.1 
 
 		 168 aa  170  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2426  hypothetical protein  45.81 
 
 		 249 aa  169  2e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.763748  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1068  hypothetical protein  46.59 
 
 		 179 aa  169  4e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0377724 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3321  hypothetical protein  47.67 
 
 		 197 aa  167  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  hitchhiker  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0825  hypothetical protein  44.28 
 
 		 204 aa  166  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0508  hypothetical protein  44.85 
 
 		 197 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2720  hypothetical protein  41.23 
 
 		 232 aa  164  8e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1806  hypothetical protein  43.06 
 
 		 220 aa  162  3e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.929401  normal  0.508252 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0554  hypothetical protein  45.83 
 
 		 177 aa  162  3e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1527  hypothetical protein  42.13 
 
 		 199 aa  157  1e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0544  hypothetical protein  41.18 
 
 		 221 aa  156  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1141  hypothetical protein  44 
 
 		 204 aa  154  6e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343798  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1136  hypothetical protein  41.62 
 
 		 192 aa  153  2e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1450  hypothetical protein  42.94 
 
 		 203 aa  153  2e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0181  hypothetical protein  40.31 
 
 		 200 aa  153  2e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2260  hypothetical protein  42.63 
 
 		 207 aa  153  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0315  hypothetical protein  43.2 
 
 		 197 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1453  hypothetical protein  43.5 
 
 		 203 aa  152  4e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0440  hypothetical protein  38.96 
 
 		 251 aa  151  5e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0459  protein of unknown function DUF1568  41.42 
 
 		 219 aa  149  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0472  protein of unknown function DUF1568  41.32 
 
 		 185 aa  147  8e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2688  hypothetical protein  38.84 
 
 		 239 aa  147  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2335  hypothetical protein  43.81 
 
 		 198 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000417097  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0284  hypothetical protein  45.76 
 
 		 187 aa  143  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1123  hypothetical protein  41.12 
 
 		 198 aa  141  5e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1035  hypothetical protein  38.27 
 
 		 224 aa  138  4.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2239  hypothetical protein  37.7 
 
 		 193 aa  134  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.892224 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1423  hypothetical protein  38.1 
 
 		 190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0723696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0555  hypothetical protein  42.86 
 
 		 127 aa  105  6e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0779  hypothetical protein  56.79 
 
 		 107 aa  104  6e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1529  hypothetical protein  34.07 
 
 		 192 aa  99.8  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1437  hypothetical protein  31.02 
 
 		 200 aa  86.3  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1350  hypothetical protein  25.93 
 
 		 258 aa  82  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0718437  normal  0.104355 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4519  hypothetical protein  34.78 
 
 		 152 aa  67  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3702  hypothetical protein  32.03 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000809832 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3286  protein of unknown function DUF1568  32.98 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00118326  unclonable  0.0000000135739 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0243  hypothetical protein  26.49 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.273479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1133  hypothetical protein  28.57 
 
 		 153 aa  54.7  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000547954  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4373  hypothetical protein  27.33 
 
 		 178 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295832  normal  0.0449373 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1855  hypothetical protein  27.52 
 
 		 175 aa  53.5  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1473  transposase, putative  31.51 
 
 		 179 aa  53.9  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2775  hypothetical protein  41.94 
 
 		 129 aa  52.4  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.963752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1352  hypothetical protein  38.33 
 
 		 172 aa  51.6  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0376314  normal  0.0977946 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2835  hypothetical protein  23.33 
 
 		 191 aa  51.6  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1962  hypothetical protein  25.33 
 
 		 164 aa  51.2  0.000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1952  hypothetical protein  31.37 
 
 		 178 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1351  hypothetical protein  36.67 
 
 		 165 aa  50.8  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0430442  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1689  hypothetical protein  25.34 
 
 		 184 aa  50.4  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.625848  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1489  hypothetical protein  25.93 
 
 		 153 aa  50.1  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1317  protein of unknown function DUF1568  26.39 
 
 		 179 aa  50.1  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.737296  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0731  hypothetical protein  26.57 
 
 		 176 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0311  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  28.83 
 
 		 1372 aa  50.1  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.220801 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4825  transposase and inactivated derivative  26.39 
 
 		 163 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3130  transposase and inactivated derivatives  28.19 
 
 		 178 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0127624  normal  0.415202 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1975  hypothetical protein  25.81 
 
 		 163 aa  48.5  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0337  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  29.21 
 
 		 1345 aa  48.5  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.038664  normal  0.920027 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1685  hypothetical protein  24.46 
 
 		 149 aa  48.1  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.365398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1384  hypothetical protein  25.52 
 
 		 180 aa  48.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.705846 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4223  hypothetical protein  29.79 
 
 		 212 aa  48.1  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1888  hypothetical protein  26.9 
 
 		 171 aa  47.4  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.17258  hitchhiker  0.00842787 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1966  hypothetical protein  31.11 
 
 		 231 aa  47  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.74185  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1685  transposase, putative  27.59 
 
 		 184 aa  46.2  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.207714 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5035  protein of unknown function DUF1568  25.89 
 
 		 214 aa  46.2  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.916294 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4226  hypothetical protein  24.31 
 
 		 177 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.853067  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2478  hypothetical protein  28.09 
 
 		 161 aa  45.1  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3465  hypothetical protein  29.87 
 
 		 150 aa  44.3  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4081  hypothetical protein  26.21 
 
 		 177 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0580442  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0721b  hypothetical protein  26.6 
 
 		 133 aa  43.9  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3135  hypothetical protein  25.52 
 
 		 176 aa  44.3  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.01424 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2890  hypothetical protein  25.17 
 
 		 191 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3405  hypothetical protein  26.06 
 
 		 179 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0242544  normal  0.205029 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0768  hypothetical protein  23.61 
 
 		 175 aa  43.9  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0333217  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33360  hypothetical protein  27.84 
 
 		 176 aa  43.1  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0361  hypothetical protein  25.83 
 
 		 191 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0943  protein of unknown function DUF1568  31.18 
 
 		 163 aa  41.6  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2421  hypothetical protein  25 
 
 		 161 aa  41.2  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0262  hypothetical protein  25.33 
 
 		 152 aa  41.2  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0788  hypothetical protein  28.12 
 
 		 150 aa  41.2  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>