42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1352 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1352  hypothetical protein  100 
 
 
172 aa  356  7e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0376314  normal  0.0977946 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1351  hypothetical protein  82.56 
 
 
165 aa  286  7e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0430442  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1350  hypothetical protein  79.65 
 
 
258 aa  278  4e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0718437  normal  0.104355 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0181  hypothetical protein  63.49 
 
 
200 aa  92.8  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0315  hypothetical protein  46.84 
 
 
197 aa  70.9  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1123  hypothetical protein  48.53 
 
 
198 aa  67  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2239  hypothetical protein  47.54 
 
 
193 aa  62.8  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.892224 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0554  hypothetical protein  35.71 
 
 
177 aa  58.9  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1527  hypothetical protein  36.36 
 
 
199 aa  58.9  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3321  hypothetical protein  41.54 
 
 
197 aa  57.4  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  hitchhiker  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1136  hypothetical protein  41.27 
 
 
192 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1092  hypothetical protein  40.58 
 
 
223 aa  55.5  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.462205  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1024  hypothetical protein  36.56 
 
 
163 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0275616 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1035  hypothetical protein  32.91 
 
 
224 aa  53.9  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0300  hypothetical protein  37.5 
 
 
193 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.401229  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0995  hypothetical protein  36.56 
 
 
163 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2688  hypothetical protein  36.99 
 
 
239 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968577  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2335  hypothetical protein  33.68 
 
 
198 aa  52.4  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000417097  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1141  hypothetical protein  38.57 
 
 
204 aa  52  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343798  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1272  hypothetical protein  38.33 
 
 
196 aa  51.6  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0440  hypothetical protein  33.82 
 
 
251 aa  51.6  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1450  hypothetical protein  39.34 
 
 
203 aa  51.6  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0544  hypothetical protein  31.03 
 
 
221 aa  51.6  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1806  hypothetical protein  38.03 
 
 
220 aa  51.2  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.929401  normal  0.508252 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0837  hypothetical protein  35.38 
 
 
206 aa  51.2  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2260  hypothetical protein  38.46 
 
 
207 aa  51.2  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2720  hypothetical protein  25.81 
 
 
232 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2844  hypothetical protein  36.11 
 
 
168 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3252  hypothetical protein  36.11 
 
 
174 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0825  hypothetical protein  37.5 
 
 
204 aa  50.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0508  hypothetical protein  39.34 
 
 
197 aa  50.1  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1453  hypothetical protein  36.07 
 
 
203 aa  48.9  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2775  hypothetical protein  30.19 
 
 
129 aa  48.9  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.963752  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0459  protein of unknown function DUF1568  39.34 
 
 
219 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0472  protein of unknown function DUF1568  39.34 
 
 
185 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2451  hypothetical protein  44.83 
 
 
201 aa  48.9  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.875999 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2426  hypothetical protein  37.1 
 
 
249 aa  47.8  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.763748  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1068  hypothetical protein  35.06 
 
 
179 aa  47.4  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0377724 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1529  hypothetical protein  36.67 
 
 
192 aa  47  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0284  hypothetical protein  36.51 
 
 
187 aa  45.4  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1423  hypothetical protein  36.23 
 
 
190 aa  44.7  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0723696  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1489  hypothetical protein  51.72 
 
 
153 aa  40.8  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>