46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2335 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2335  hypothetical protein  100 
 
 
198 aa  417  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000417097  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2720  hypothetical protein  46.19 
 
 
232 aa  194  5.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0544  hypothetical protein  45.21 
 
 
221 aa  190  1e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0440  hypothetical protein  47.37 
 
 
251 aa  188  5e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1035  hypothetical protein  44.67 
 
 
224 aa  176  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1136  hypothetical protein  43.68 
 
 
192 aa  166  2e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0825  hypothetical protein  45.75 
 
 
204 aa  164  5.9999999999999996e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1068  hypothetical protein  46.23 
 
 
179 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0377724 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0315  hypothetical protein  44 
 
 
197 aa  155  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3252  hypothetical protein  41.03 
 
 
174 aa  149  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2451  hypothetical protein  41.15 
 
 
201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.875999 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2844  hypothetical protein  41.49 
 
 
168 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2260  hypothetical protein  42.71 
 
 
207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1272  hypothetical protein  43.81 
 
 
196 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0181  hypothetical protein  38.27 
 
 
200 aa  142  3e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1123  hypothetical protein  37.5 
 
 
198 aa  142  3e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0300  hypothetical protein  39.8 
 
 
193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.401229  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1450  hypothetical protein  38.27 
 
 
203 aa  137  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1527  hypothetical protein  38.61 
 
 
199 aa  137  1e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0995  hypothetical protein  38.34 
 
 
163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1024  hypothetical protein  38.34 
 
 
163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0275616 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1453  hypothetical protein  37.76 
 
 
203 aa  134  8e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0508  hypothetical protein  38.58 
 
 
197 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2688  hypothetical protein  37.79 
 
 
239 aa  129  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968577  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0459  protein of unknown function DUF1568  36.73 
 
 
219 aa  125  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1092  hypothetical protein  39.9 
 
 
223 aa  124  7e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.462205  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0837  hypothetical protein  41.36 
 
 
206 aa  124  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0284  hypothetical protein  37.63 
 
 
187 aa  123  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0472  protein of unknown function DUF1568  36.08 
 
 
185 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0554  hypothetical protein  36.46 
 
 
177 aa  122  3e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3321  hypothetical protein  35.18 
 
 
197 aa  121  6e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  hitchhiker  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2426  hypothetical protein  34.92 
 
 
249 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.763748  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1141  hypothetical protein  38.12 
 
 
204 aa  112  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343798  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1806  hypothetical protein  36.19 
 
 
220 aa  111  7.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.929401  normal  0.508252 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1350  hypothetical protein  29.53 
 
 
258 aa  111  8.000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0718437  normal  0.104355 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2239  hypothetical protein  32.64 
 
 
193 aa  108  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.892224 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0555  hypothetical protein  53.09 
 
 
127 aa  97.1  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1437  hypothetical protein  31.09 
 
 
200 aa  90.9  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1529  hypothetical protein  30.73 
 
 
192 aa  89  5e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0779  hypothetical protein  48.75 
 
 
107 aa  84  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2775  hypothetical protein  43.12 
 
 
129 aa  83.6  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.963752  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1423  hypothetical protein  28.57 
 
 
190 aa  73.9  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0723696  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4519  hypothetical protein  38.27 
 
 
152 aa  64.3  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1352  hypothetical protein  33.68 
 
 
172 aa  52.4  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0376314  normal  0.0977946 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1351  hypothetical protein  36.62 
 
 
165 aa  52.4  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0430442  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4707  hypothetical protein  25.29 
 
 
152 aa  42.4  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>