46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2720 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2720  hypothetical protein  100 
 
 
232 aa  481  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0825  hypothetical protein  59.05 
 
 
204 aa  251  8.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1068  hypothetical protein  46.32 
 
 
179 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0377724 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2335  hypothetical protein  46.19 
 
 
198 aa  194  7e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000417097  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2451  hypothetical protein  44.68 
 
 
201 aa  176  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.875999 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2260  hypothetical protein  39.91 
 
 
207 aa  169  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1527  hypothetical protein  40.77 
 
 
199 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1272  hypothetical protein  41.23 
 
 
196 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0508  hypothetical protein  40.89 
 
 
197 aa  160  2e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0440  hypothetical protein  40.49 
 
 
251 aa  157  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3321  hypothetical protein  40.68 
 
 
197 aa  154  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  hitchhiker  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0837  hypothetical protein  41.59 
 
 
206 aa  154  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0300  hypothetical protein  39.74 
 
 
193 aa  152  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.401229  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0544  hypothetical protein  39.67 
 
 
221 aa  148  6e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1450  hypothetical protein  40.81 
 
 
203 aa  148  6e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1453  hypothetical protein  40.81 
 
 
203 aa  148  9e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1136  hypothetical protein  38.43 
 
 
192 aa  146  3e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1123  hypothetical protein  38.79 
 
 
198 aa  144  1e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0554  hypothetical protein  37.95 
 
 
177 aa  144  2e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1806  hypothetical protein  40 
 
 
220 aa  143  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.929401  normal  0.508252 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1092  hypothetical protein  40.09 
 
 
223 aa  138  7e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.462205  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1035  hypothetical protein  38.33 
 
 
224 aa  136  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0315  hypothetical protein  37.29 
 
 
197 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0181  hypothetical protein  35.06 
 
 
200 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1141  hypothetical protein  40.71 
 
 
204 aa  129  6e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343798  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2688  hypothetical protein  37.02 
 
 
239 aa  128  9.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968577  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1350  hypothetical protein  31.73 
 
 
258 aa  124  9e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0718437  normal  0.104355 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2844  hypothetical protein  54.55 
 
 
168 aa  122  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3252  hypothetical protein  55.1 
 
 
174 aa  121  9e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0284  hypothetical protein  33.48 
 
 
187 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2426  hypothetical protein  36.28 
 
 
249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.763748  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2239  hypothetical protein  32.76 
 
 
193 aa  113  3e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.892224 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0459  protein of unknown function DUF1568  28.57 
 
 
219 aa  108  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0472  protein of unknown function DUF1568  28.38 
 
 
185 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0995  hypothetical protein  47.31 
 
 
163 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0555  hypothetical protein  49.04 
 
 
127 aa  103  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1024  hypothetical protein  47.31 
 
 
163 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0275616 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1529  hypothetical protein  27.15 
 
 
192 aa  87  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0779  hypothetical protein  50.63 
 
 
107 aa  86.7  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1423  hypothetical protein  26.85 
 
 
190 aa  82.8  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0723696  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1437  hypothetical protein  29.49 
 
 
200 aa  79.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4519  hypothetical protein  35.9 
 
 
152 aa  62.8  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1352  hypothetical protein  25.81 
 
 
172 aa  50.1  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0376314  normal  0.0977946 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2775  hypothetical protein  38.03 
 
 
129 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.963752  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1133  hypothetical protein  31.15 
 
 
153 aa  45.4  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000547954  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1351  hypothetical protein  25.66 
 
 
165 aa  45.4  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0430442  normal  0.0970629 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>