48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0440 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0440  hypothetical protein  100 
 
 
251 aa  520  1e-147  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0544  hypothetical protein  57.89 
 
 
221 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2335  hypothetical protein  47.37 
 
 
198 aa  188  7e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000417097  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1035  hypothetical protein  42.79 
 
 
224 aa  169  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2720  hypothetical protein  40.49 
 
 
232 aa  157  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1136  hypothetical protein  38.91 
 
 
192 aa  156  3e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1272  hypothetical protein  38.96 
 
 
196 aa  151  8.999999999999999e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2451  hypothetical protein  36.17 
 
 
201 aa  146  4.0000000000000006e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.875999 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0825  hypothetical protein  38.79 
 
 
204 aa  141  9e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3321  hypothetical protein  39.66 
 
 
197 aa  137  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  hitchhiker  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0508  hypothetical protein  38.94 
 
 
197 aa  137  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3252  hypothetical protein  33.63 
 
 
174 aa  135  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1068  hypothetical protein  36.56 
 
 
179 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0377724 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0554  hypothetical protein  34.23 
 
 
177 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1123  hypothetical protein  34.5 
 
 
198 aa  125  5e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0300  hypothetical protein  36.6 
 
 
193 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.401229  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2844  hypothetical protein  32.42 
 
 
168 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1092  hypothetical protein  37.44 
 
 
223 aa  122  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.462205  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1450  hypothetical protein  35.75 
 
 
203 aa  122  4e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1527  hypothetical protein  34.93 
 
 
199 aa  122  6e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1453  hypothetical protein  35.75 
 
 
203 aa  122  7e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0181  hypothetical protein  32.89 
 
 
200 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0315  hypothetical protein  33.92 
 
 
197 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2426  hypothetical protein  34.39 
 
 
249 aa  119  6e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.763748  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0837  hypothetical protein  37.89 
 
 
206 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2688  hypothetical protein  33.76 
 
 
239 aa  109  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968577  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0284  hypothetical protein  34.4 
 
 
187 aa  108  6e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2260  hypothetical protein  32.47 
 
 
207 aa  107  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0459  protein of unknown function DUF1568  30.36 
 
 
219 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1806  hypothetical protein  33.73 
 
 
220 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.929401  normal  0.508252 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2239  hypothetical protein  31.28 
 
 
193 aa  106  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.892224 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1141  hypothetical protein  32.64 
 
 
204 aa  105  5e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343798  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1350  hypothetical protein  28.29 
 
 
258 aa  105  7e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0718437  normal  0.104355 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0472  protein of unknown function DUF1568  29.73 
 
 
185 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0779  hypothetical protein  55.7 
 
 
107 aa  93.2  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0555  hypothetical protein  46.81 
 
 
127 aa  93.6  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1437  hypothetical protein  30.14 
 
 
200 aa  89  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1024  hypothetical protein  44.57 
 
 
163 aa  86.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0275616 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0995  hypothetical protein  44.57 
 
 
163 aa  86.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2775  hypothetical protein  49.44 
 
 
129 aa  85.9  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.963752  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1529  hypothetical protein  27.35 
 
 
192 aa  76.6  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1423  hypothetical protein  28.77 
 
 
190 aa  76.3  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0723696  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4519  hypothetical protein  33.96 
 
 
152 aa  65.5  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1351  hypothetical protein  35.94 
 
 
165 aa  52.8  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0430442  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1352  hypothetical protein  33.82 
 
 
172 aa  51.6  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0376314  normal  0.0977946 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3702  hypothetical protein  54.55 
 
 
208 aa  45.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000809832 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3286  protein of unknown function DUF1568  51.52 
 
 
214 aa  43.9  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00118326  unclonable  0.0000000135739 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4373  hypothetical protein  53.33 
 
 
178 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295832  normal  0.0449373 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>